最近总是有人问小编
你们构建载体怎么做的
“我的基因上有很多酶切位点,
没有可选的酶切位点用来构建表达载体呀”
别着急,容小编来一一讲解
传统的载体构建方法——酶切连接法
一、引物设计,引物的长度一般为15-30bp,引物中需要加入酶切位点(如XbaI、EcoRI)及保护性碱基(可增加酶切效率)。
二、 PCR扩增目的基因。
三、用特定的限制性内切酶对目的基因进行酶切(一般酶切效率比较低),同时对目的载体进行酶切。
四、用T4 DNA连接酶进行连接,目的基因与目的载体的摩尔比很重要,而且连接反应体系的体积对效率也有很大关系,之后进行测序鉴定。
专治各种“疑难杂症”——同源重组法构建载体
采用同源重组法构建载体与常规双酶切构建载体方法不同,该方法不受酶切位点的限制。
一、设计引物时上游引物5’端前面加的是酶切位点(如BamHI)及该酶切位点在载体中对应前面的15个碱基载体片段(上游同源臂),下游引物5’端前面加的是酶切位点(如HindIII)及该酶切位点在载体中对应后面的15个碱基载体片段(下游同源臂)。
二、将载体进行双酶切(或者是单酶切,单酶切假阳性率很高),使得载体成为两端分别带BamHI、HindIII位点的线性载体;同时PCR扩增目的基因。
三、PCR产物直接用于重组连接,不需要酶切产生粘性末端,而且重组酶的重组能力强于T4 DNA连接酶的连接能力,一般只需要一步即可重组连接成功,因此可以在重组反应之后进行测序鉴定。
总的来说:
酶切连接 | 同源重组 | |
酶切位点依赖性 | 依赖性较高 | 依赖性较低 |
构建耗时 | 长 | 短 |
难易程度 | 繁琐 | 简单 |
重组效率 | 高 | 较高 |
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