1、灰叶斑病
这是番茄灰叶斑病，又称芝麻斑病。番茄灰叶斑病病斑周围一般具黄色晕圈，有的病斑上具有同心轮纹，跟早疫病相近，但病斑要小、圆，且分布均匀，枝梗上也有圆形小病斑。也不同于细菌性斑点病（危害叶片时，形成深褐色至黑色不规则斑点，病斑发展到后期不易穿孔）。
该病发生迅速，一般在连续2～3个阴雨天后，会造成大面积暴发流行，一旦发生，难以控制。应以预防为主。
2、灰霉病
叶片发病多始于叶尖，此外病残体脱落接触部分也会很快受到侵染；花瓣是主要受害器官；果实受害往往是青果期，果皮逐渐呈灰白色、软腐状；最明显的辨识点是病部着生灰色霉层。药剂可选择啶酰菌胺、异菌脲等。
3、晚疫病
叶片发病后会出现暗绿只黑绿色的病斑；茎秆染病病斑呈褐色，略微凹陷；果实受害初期生油浸状浅褐色病斑，后期软腐；湿度大时，病斑均可生白色霉层。药剂可选择苯醚甲环唑、氟菌·霜霉威、烯酰吗啉等。
4、早疫病
病斑近圆形，棕褐色至黑褐色，最大的特点是有轮纹，所以也称轮纹病，药剂可选择苯醚甲环唑、异菌脲、戊唑醇、吡唑醚菌酯等。
5、叶霉病
初期呈受害叶上生椭圆形或不规则淡黄色病斑，叶背先长出灰褐色霉层，严重时叶正面也有。防治药剂可选择肟菌·戊唑醇、春雷霉素、苯醚甲环唑、氟唑菌酰胺等喷雾防治。
6、青枯病
根部形成褐色的水浸状病斑，向下凹陷，维管束变褐，髓部逐渐腐烂；随着病情扩展，病茎上也可见水浸状条形斑，髓部变成褐色，内充满白色的菌脓，横切病茎，用手挤压，维管束溢出白色菌液；病株白天萎蔫，傍晚复原。一般预防为主发病初期可用碱式硫酸铜、氢氧化铜、细霸等灌根。
7、细菌性溃疡病
叶片从叶柄处生坏死斑，后萎蔫枯死；茎部出现褪绿条斑，维管束变褐，髓部出现空洞；果实生疣状突起。有效药剂可选择、氢氧化铜、中生菌素四霉素等。
8、脐腐病
番茄脐腐病，俗称黑膏药、贴膏药，属生理性病害，为难以防治的世界性难题。一旦发生，只能摘除，对生产影响较大。一般认为番茄脐腐病由缺钙引起，或与品种及肥水管理等有关。
防治方法：建议选用不易得脐腐病的品种，基肥要增施钙肥，田间肥水均匀供应，及时补施硼钙肥。
9、病毒病
病毒病发病症状多种多样，主要有花叶型、黄化型、坏死型、畸形型等。同时防止好同翅亚目害虫如蚜虫等传播媒介，发病初期可尝试用盐酸吗啉胍等药剂
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