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(团队论文)苗期草莓炭疽病病原菌多样性及对甲基硫菌灵的抗性检测

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由炭疽菌属真菌(Colletotrichum spp.)引起的草莓炭疽病是草莓生产中一种毁灭性的真菌病害,它在整个草莓生长周期中均可进行为害,尤其是在草莓苗期和移栽期。在适宜的温湿度环境条件中,草莓苗受Colletotrichum spp.侵染,可以发生50-80%的死苗率。

1 苗期草莓炭疽病的典型症状

Colletotrichum spp.可以侵染草莓植株的所有组织。Colletotrichum spp.侵染草莓苗,在叶柄上形成褐色的、纺锤形的凹陷状病斑,叶柄呈现不健康的深红色;在根茎部形式红褐色的溃疡病斑;逐渐引起茎基腐;严重时,整个草莓植株呈萎蔫状,最后死亡。

图1 苗期草莓炭疽病的田间典型症状

2 苗期草莓炭疽病菌的分子鉴定

从150株草莓病样中分离获得具有炭疽菌典型菌落形态特征的真菌共105株,联合acting (ACT),calmodulin (CAL),chitin synthase (CHS-1), glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH)等4个基因和 internal transcribed spacer (ITS)进行系统发育树分析,105株Colletotrichum spp.都属于胶孢炭疽复合种C. gloeosporioides complex,其中5个菌株属于C. aenigma,37个菌株属于C. fructicola,7个菌株属于C. gloeosporioides,56个菌株属于C. siamense

图2 苗期草莓炭疽病病原菌系统发育树分析

3 病原菌形态特征

从田间草莓病苗上分离到的4类Colletotrichum spp.在PDA(土豆葡萄糖琼脂培养基)平板上的菌落形态相似,4类炭疽菌在PDA上的菌落呈灰色、橄榄绿或白色,可形成橘黄色的分生孢子堆,分生孢子无色透明、无隔膜,呈圆柱状,两端钝圆或一端稍尖,可见1个油球。

图3 4类Colletotrichum spp.的菌落形态和显微结构

4  甲基硫菌灵的抗性LAMP法检测

传统区分剂量法测定105株Colletotrichum spp.中99个菌株对甲基硫菌灵表现为高水平抗性,2个菌株表现为中等水平抗性,4个菌株表现为敏感;基于β-Tubulin基因上198位密码子突变 [密码子GAG→GCG,氨基酸glutamate(E)→alanine(A) ]设计的LAMP检测体系(E198A-LAMP),检测到95个菌株为阳性菌株,10个菌株为阴性菌株。经测序验证, 95个阳性菌株在β-Tubulin基因的198位密码子由GAG突变成GCG,导致氨基酸突变;10个阴性菌株中,6个菌株β-Tubulin基因的200位密码子由TTC突变成TAC,氨基酸从phenylalanine(F) 变成tyrosine(Y),另外4个菌株的β-Tubulin基因未发生密码子突变。

 表1 苗期草莓炭疽病菌对甲基硫菌灵的抗性监测及分子机制.

图4 LAMP法检测苗期草莓炭疽病对甲基硫菌灵的抗性水平和抗性分子机制

总结

草莓炭疽病是草莓苗圃中一种重要的真菌病害,主要由C. aenigma,C. fructicola,C. gloeosporioides,C. siamense 4种炭疽菌引起,它们在形态特征上较为相似。苗期草莓炭疽病对甲基硫菌灵的抗性水平高且频率高,建议田间不再使用甲基硫菌灵、多菌灵等苯并咪唑类杀菌剂防治炭疽病,可考虑使用苯醚甲环唑、戊唑醇等其他类别杀菌剂防治该病害。

文章题目:Diversity and Resistance to Thiophanate-Methyl of Colletotrichum spp. in Strawberry Nursery and the Development of Rapid Detection Using LAMP Method

作者:吴鉴艳,胡硕丹,叶博洋,胡小然,肖文斐,余红,张传清

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