1.提高产品质量
提高生物有机肥产品质量，主要应该在菌种选育、工艺优化和开发新产品三点发力。
在菌种选育方面，应加大对促进根系生长、转化土壤养分、防控土传病害、消减与钝化根际有毒有害物质等特定功能的农业微生物菌种资源的挖掘与利用。另外，为保证产品在加工、运输、储存等过程仍保持较高的生物活性，应加强对抗逆性强的芽孢杆菌属的应用。
在工艺优化方面，研发与建立不同固体有机废弃物堆肥资源化利用技术与工艺，根据不同来源的废弃物，建立配套工艺与技术，以满足变化多端的有机废弃物资源化利用产业需求。同时，优化工艺参数，进而提高产品质量、缩短生产周期、降低生产成本。
在开发新产品方面，结合生产实际，加大创新力度。改良土壤中的微生物区系，使得原来有病害的土壤、养分转换慢的土壤，逐渐变成健康的土壤、养分转化快的土壤。未来应生产出适合不同土壤、不同作物和不同气候条件的新型生物有机肥料产品。
2.规范产品管理
目前市场上生物有机肥产品品种繁多，包装丰富多样，质量良莠不齐，针对这些问题，相关行业管理部门应加强对产品的检测和监管，加大肥料产品质量监督抽查力度，加强与市场监管等部门协作。严格按照“双随机一公开”原则组织开展肥料产品质量监督抽查，以适当形式公告抽查产品质量，督促生产企业提高肥料质量，保障农民用上放心肥。对于市场上的假冒伪劣行为，必须严厉打击，严惩不贷。
3.加大推广力度
政府、企业和相关农业技术部门应合力加强对生物有机肥的宣传、推广，可通过示范、讲解、现场指导等方式，向农民展示生物有机肥的应用效果， 让农民从根本上了解生物有机肥的经济效益和生态效益，提高农民使用生物有机肥的积极性。
生物有机肥能将有机废弃物“变废为宝”实现资源化利用，具有较高的经济效益、生态效益和社会效益，是实现农业可持续发展的有力保障。未来生物有机肥必将成为肥料行业生产和农资消费的热点，具有广阔的发展前景。
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