【收藏】DRESIS数据库:史上最全面的耐药性数据库
广泛的耐药性已成为全球卫生保健的关键问题,今天要介绍的 DRESIS 数据库则有望解决耐药相关的临床治疗优化并辅助新药开发。文章标题: DRESIS: the first comprehensive landscape of drug resistance information, 数据库地址: http://dresis.idrblab.net/ 。
DOI: 10.1093/nar/gkac812
DRESIS 数据库收录了超过2 万种具有临床/ 实验验证的耐药性药物,对应到395 种耐药疾病,以及2197 个关键耐药分子的分子机制,并分析了耐药相关分子的疾病特异性和组织特异性。
每种药物耐药信息的详细描述包括 :药物名称、药物同义词、疾病适应症 ( 以及相应的药物临床状态 ) 、药物结构 ( 可下载的 2D 和 3D 格式 ) 、药物靶点和外部链接到其他完善的分子生物学数据库,如 PubChem 、 DrugBank 、 TTD 、 VARIDT 和 INTEDE ,以及对应的耐药疾病。
使用交互式图表说明药物的多种耐药机制。药物被放置在中间,周围是各种类型的机制( 如图顶部所示 ) 。不同的疾病类别与 不同 机制类型相关联,这些机制类型进一步与关键的抗性分子相关联( 在最外层的叶子中显示) 。 数据库还按照疾病进行分类,提供了详细的耐药机制,包含:关键耐药分子数据、耐药证据类型和实验细节。对于关键的耐药分子,描述了它们在耐药疾病中的改变,及不同类型的耐药证据 ( 临床报告,通过体内模型验证或通过细胞系实验确定 ) 。实验细节 则包括 : 不同的实验技术,数百种疾病细胞系和感染菌株,数百种体内模型和多种信号通路调控的耐药性疾病。
DRESIS 数据库还可以查看特定疾病的耐药性药物的总览结果: 纵轴使用药物 id提供完整的耐药药物列表,横轴使用分子 id 显示另一个关键耐药分子列表。 可以通过拖动交互图底部和右侧的滑块来实现整个总览的可视化。不同类型的耐药 机制在这张图中用不同颜色的圆圈 (中间有字母 “R”) 表示。将鼠标放在任意一个圆圈上,就可以交互式地查看机制类型、耐药药物和关键分子的详细信息。
可以在数据库的“ Home ”“ Search ”界面直接检索所关注的药物 / 疾病 / 分子,当然也可以设置筛选条件进行精细检索,使用非常友好。
可以在数据库的“ Download ”界面下载药物 / 疾病 / 分子,下载也非常友好哦。
说一千道一万,不如大家动动手指点一点试试看,再次奉上数据库地址:http://dresis.idrblab.net/ 。
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