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已为你将这篇经典5 论文拆解干净!让你写论文更加得心应手~

大家好,我是文献菌,今天来跟随文献君一起继续学习三元交互套路:分子 分子 通路。这次要拆解的是一篇5 的胰腺导管腺癌研究,接下来就让我们一起看看吧~

本文于2022年7月发表在Molecular Carcinogenesis homepage杂志上,标题《HIF-1α-regulated stanniocalcin-1 mediates gemcitabine resistance in pancreatic ductal adenocarcinoma via PI3K/AKT signaling pathway》,影响因子5.139分,中科院2区。研究的是HIF-1α介导的STC1通过PI3K/AKT信号通路调控胰腺导管腺癌(PDAC)吉西他滨(GEM)耐药。

关键要素

疾病:胰腺导管腺癌(PDAC)

表型:耐药、增殖

主变量:STC1

效应变量:HIF-1α、PI3K/AKT信号通路

机制模式:

直接机制:无

间接机制:HIF-1α介导的STC1通过PI3K/AKT信号通路调控胰腺导管腺癌吉西他滨耐药

套路格式:分子 分子 通路的三元间接作用

研究模型:

细胞模型:胰腺癌细胞系:

  a. AsPC-1细胞和PANC-1细胞;

  b. 耐药细胞,从AsPC-1细胞和PANC-1细胞构建而得

动物模型:

  a. 裸鼠皮下移植模型:AsPC-1细胞在裸鼠中建立了皮下移植肿瘤模型

科学假设

在【胰腺癌细胞系】中,【HIF-1α】介导主变量【STC1】通过效应变量【PI3K/AKT】途径调控【吉西他滨耐药】。

逻辑关系

因果逻辑(1):主变量【STC1】受效应变量【STC1】调控

因果逻辑(2):效应变量【HIF-1α】介导主变量【STC1】调控【吉西他滨耐药】表型

因果逻辑(3):效应变量【HIF-1α】介导主变量【STC1】通过【PI3K/AKT】途径调控【吉西他滨耐药】


知识背景

胰腺导管腺癌(PDAC)是世界上最致命的恶性肿瘤,5年生存率低于10%,分别在中国和美国癌症相关死亡中排名第六和第四。目前,吉西他滨是胰腺癌患者使用最广泛的化疗药物。不幸的是,许多患者在治疗期间迅速对吉西他滨产生化疗耐药性,导致其预后没有显着改善。因此,探讨吉西他滨耐药性对PDAC患者治疗的发生机制具有重要意义。

PDAC之所以对吉西他滨反应不佳,部分原因是它具有特殊的肿瘤微环境,缺氧环境在其恶性行为中起重要作用。HIF-1α已被证明在PDAC中具有升高的表达水平并促进肿瘤细胞的恶性表型,HIF-1α信号通路的激活与胰腺癌的化学耐药性密切相关。

研究表明HIF-1α是肿瘤厌氧条件下诱导STC1表达的关键因子。STC1在乳腺癌、肝癌、结肠癌等肿瘤中高表达,通过激活Notch、JNK/c-Jun和PI3K/AKT信号通路,促进细胞增殖、侵袭和迁移能力,阻止细胞凋亡。然而,没有关于STC1与PDAC化疗耐药关系的文献报道。

研究流程

数据解读

Fig 1. STC1 is overexpressed in PDAC and related to gemcitabine resistance

图1. STC1在PDAC中过表达且与GEM耐药性有关。

细胞】细胞水平、耐药表型、主变量表达差异

A:在GEM敏感PDX模型和GEM耐药PDX模型中检测STC12表达,发现在GEM耐药PDX中STC1的mRNA水平显着升高;(细胞水平、耐药表型)

B-C:检测GEM耐药MIA PaCa-1细胞和正常MIA PaCa-1细胞中的STC2 mRNA、蛋白水平,发现在GEM耐药MIA PaCa-1细胞中STC1表达明显增加;(细胞水平,主变量表达差异)

D-F:查询GEO数据集和TCGA数据集中的STC1表达水平,发现与正常组织相比,STC1在PDAC肿瘤中的表达水平升高。(生信分析,主变量表达差异)

结论:STC1在PDAC中过表达,且与吉西他滨耐药性有关。

Fig 2. Gemcitabine stimulation induces the expression of STC1

图2. GEM刺激诱导STC1表达。

细胞 生信】细胞水平,主变量表达差异

A-B:在AsPC-1细胞或PANC-1细胞中,检测不同GEM浓度的STC1 mRNA水平,发现随着GEM浓度的升高,STC1表达逐渐升高;(细胞水平,主变量表达差异)

C-D:当用1μM/LGEM处理AsPC-1细胞或PANC-1细胞时,发现STC1表达随着GEM刺激时间的延长而增加;(细胞水平,主变量表达差异)

E:在AsPC-1细胞中,不同GEM浓度的HIF-1α mRNA表达水平,发现随着GEM浓度的升高,HIF-1α表达逐渐升高;(细胞水平)

F:当用1μM/LGEM处理AsPC-1细胞时,发现HIF-1α表达随着GEM刺激时间的延长而增加;(细胞水平)

G:用不同GEM浓度处理的PANC-1细胞,采用WB检测STC1和HIF-1α的蛋白质水平,发现浓度越高,STC1和HIF-1α表达增加;(细胞水平)

H:HIF-1α在TCGA数据集中的mRNA水平升高;(生信分析)

I:在TCGA数据集中,STC1和HIF-1α呈正相关。(生信分析,STC1和HIF-1α正相关)

结论:吉西他滨刺激诱导STC1表达。

Fig 3. Gemcitabine exerts stimulating effect on STC1 through HIF-1α

图3. 吉西他滨通过HIF-1α对STC1发挥刺激作用。

细胞 分子】HIF-1α调控STC1

A:qPCR验证AsPC-1细胞中HIF-1α的敲低效果;(反向操作,细胞水平)

B:在AsPC-1细胞中,添加MGEM促进STC1的表达可以明显被沉默HIF-1α所回复(反反反,调控论证)

C:WB检测AsPC-1细胞中,沉默HIF-1α,可以降低STC1的蛋白水平(反向操作,调控论证,细胞水平)

D:qPCR检测AsPC-1细胞中不同GEM浓度的STC1和HIF-1α mRNA水平,发现GEM可以以梯度依赖性的方式促进HIF-1α和STC1的表达;(细胞水平)

E:qPCR检测在HIF-1α敲低后,AsPC-1细胞中不同浓度的吉西他滨的STC1和HIF-1α mRNA水平,发现STC1表达下降;(分子机制,反向操作,HIF-1α调控STC1)

F-H:不同浓度氯化钴2下HIF-1α的mRNA和蛋白水平,发现随着浓度的增加,HIF-1α蛋白表达增加;(细胞水平)

G-I:不同浓度氯化钴2下的STC1 mRNA水平,发现STC1 mRNA水平随着HIF-1α蛋白的增加而升高;(分子机制,正向操作,HIF-1α调控STC1)

结论:吉西他滨刺激可以通过上调转录因子HIF-1α来提升STC1基因表达。

Fig 4. STC1 promotes the proliferation and increases chemoresistance of PDAC cells in vitro and in vivo

图4. STC1促进PDAC细胞在体外和体内的增殖并增加耐药性。

细胞、动物】耐药表型、增殖表型

A:研究STC1对胰腺癌细胞增殖的影响,发现AsPC-1和PANC-1细胞在STC1敲低后表现出较低的增殖速率;(细胞水平,反向操作,增殖表型)

B:研究STC1对胰腺癌细胞增殖的影响,发现在STC1过表达后表现出较高的增殖速率;(细胞水平,正向操作,增殖表型)

C:不同浓度的GEM对siNC和siSTC1转染细胞的抑制率,发现用siSTC1转染的AsPC-1和PANC-1细胞对GEM的敏感性比转染siNC的细胞高得多;(细胞水平,反向操作,耐药表型)

D:不同浓度的GEM对空载体和STC1OE转染细胞的抑制率,发现过表达STC1的细胞对GEM表现出很大的药物抗性;(细胞水平,正向操作,耐药表型)

E-G:siNC和siSTC1注射荷瘤小鼠的肿瘤图像和肿瘤生长曲线,发现沉默STC1组对肿瘤的生长有明显的抑制作用;(动物水平,反向操作,增殖表型)

结论:STC1促进肿瘤生长并导致体外和体内吉西他滨耐药。

Fig 5. STC1 exerts its functions by activating PI3K/AKT and NF-κB signaling pathway

图5. STC1通过激活PI3K/AKT和NF-κB信号通路发挥其功能。

细胞】STC1调控PI3K/AKT通路,耐药表型

A:WB检测STC1敲低或过表达后总PI3K,磷酸化PI3K,总AKT,磷酸化AKT,总NF-kB,磷酸化NF-kB和STC1的水平,发现敲低后,全体蛋白表达下降,过表达则相反;(细胞水平,一正一反操作,STC1调控PI3K/AKT通路)

B:WB检测加入STC1重组蛋白后总PI3K、磷酸化PI1K、总AKT、磷酸化AKT、总NF-kB、磷酸化NF-kB和STC1的水平,发现整体蛋白表达水平与加入STC1重组蛋白浓度呈正比;(细胞水平,正向操作,STC1调控PI3K/AKT通路)

C-D:采用PI3K抑制剂(LY294002)处理用GEM处理后的空载体或STC1OE(STC1过表达)转染的AsPC-1细胞的抑制率,发现PI3K抑制剂可以逆转AsPC-1和PANC-1细胞中STC1OE引起的耐药性增加;(细胞水平,正正反,耐药表型)

结论:STC1通过激活PI3K/AKT信号通路来调节GEM抗性。

Fig 6. Clinical relevance and prognosis value of STC1

图6. STC1的临床相关性及预后价值。

生信】生信分析

A:TCGA数据集和GSE1数据集中STC71729低/高表达组的KM存活曲线,发现STC1表达水平与患者生存时间之间没有显著相关性;(生信分析)

B:GSE1、E-MTAB-85926、PACA-AU和PACA-CA数据集中STC6134低/高表达组的KM存活曲线,发现较高的STC1表达与更差的患者生存时间相关;(生信分析)

C:肿瘤组织和邻近正常组织的导管区域图像和相应的放大图像;(生信分析)

D:STC1在肿瘤组织和相应正常组织中的表达,发现胰腺癌组织中STC1的表达水平升高;(生信分析)

E:STC1低/高表达组在所有患者中的KM生存曲线,发现STC1表达与患者的总生存期无关;(生信分析)

F:接受吉西他滨治疗术后STC1低/高表达组的KM生存曲线,发现STC1表达与吉西他滨治疗组的生存率显著相关;(生信分析)

G:STC1低/高表达组患者术后未接受吉西他滨治疗的KM生存曲线,发现STC1表达与非吉西他滨治疗组与生存率无关;(生信分析)

结论:STC1在肿瘤组织中的表达升高,并与接受吉西他滨治疗的患者的预后相关。

论证规范
 
1. 主变量(STC1)的单变量论证:
 (1)主变量(STC1)抑制耐药、增殖:Fig1、4、6
 2. 变量间的调控关系论证
 (1)主变量(STC1)与效应变量(PI3K/AKT)的调控关系:Fig5
 (2)效应变量(HIF-1α)介导主变量(STC1)调控(吉西他滨耐药)表型:Fig4
 (3)主变量(STC1)与效应变量(HIF-1α)的调控关系:Fig2、3
 (4)效应变量(HIF-1α)介导主变量(STC1)依赖于效应变量(PI3K/AKT)调控耐   药表型:Fig5
套路归纳

本文优点:这是一篇三元间接机制文章,文章从组织水平、动物水平、细胞水平、生信分析多个维度进行论证,结合了耐药表型进行论证,提升了论证广度,工作量看起来饱满。
本文缺点:实验可以更完善,可以通过转染从基因层面降低PI3K/AKT机制表达,从而更明确STC1与PI3K/AKT通路的调控作用,进一步证实STC1与PI3K/AKT机制来发挥耐药抑制作用;此外,本研究未在动物层面证实STC1与PI3K/AKT机制来发挥耐药抑制作用。

END
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