是什么让人类如此特别——大规模基因研究揭开答案面纱
独特的视角
人类,与其他物种迥然不同,人类的基因组中必定隐藏着人类特殊性的线索。可是一直以来我们非常困惑不解,人类和其他灵长类生物的基因组高度类似,特别是编码细胞中某些蛋白的基因。ENCODE(DNA元件百科全书计划的缩写,同时意为“编码”)国际联合计划提供了一个崭新的角度去探索人类基因组的奥秘(见文),帮助我们寻找人类之所以为一个独特物种的潜在线索。美国麻省理工学院的卢卡斯·沃德(Lucas Ward)和马诺里斯·克里斯(Manolis Kellis)共同在《科学》期刊上发表了他们对人类基因组物种特性的研究报告。
这两位科学家首先利用ENCODE的数据定位基因组中的功能元件,之后他们又对照了1000个基因组计划的数据(这些数据记录了几百个人类个体的基因组多样性),比较这些功能元件在人与人之间的差异性。也就是说,他们在寻找功能元件在自然选择过程中是否被保留下来的证据。群体中重要元件的DNA序列中,随机的,变异性高的部分会进化过程中被淘汰,只有具有功能部分会保留下来,在群体中这样的序列会很一致,这一过程称为纯化筛选。
沃德博士和克里斯博士发现,5%人类DNA在哺乳动物中是保守的(即普遍存在),还有4%的人类DNA是独有的,这些独有的DNA很有可能是人类物种的纯化筛选遗留下的,在其他哺乳动物中被淘汰了。DNA的功能之一是调控基因活性,比如,控制某一个蛋白的合成的数量,但DNA不能改变蛋白本身的性质。这个发现和现在的理论不谋而和:进化改变的主要是调控元件,而非实际的蛋白结构。沃德博士和克里斯博士发现,人类的非编码长片段相当保守,并且是仅仅局限于人类中,而其他哺乳动物中的这类片段变异性高,这一点说明人类的非编码长片段是有功能性的。
他们的研究还阐述了其他一些方面:人类可以调节眼角膜上的锥形细胞(与视觉辨别颜色有关)和神经细胞生长。人类的灵长类祖先曾经很快地进化了这两个过程,如今,的强的进化选择让人类保留这样的有利的功能。这说明,人类最突出的物种特性是巨大的脑部。沃德博士和克里斯博士因此开发了一个强大的工具来,从细节中探究人类之所以为人类的证据。
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