天顺七年
也先死于1454年，阿失帖木儿却在十年后才回到漠北。为什么阿失帖木儿那么晚才回师？
有一种说法认为，也先是被阿剌知院杀死的。阿剌知院又被孛来所杀。阿失帖木儿的直接仇人已经死了，且孛来本就是也先的部下。所以，阿失帖木儿与孛来做出了妥协。
可是，孛来是喀喇沁部首领，喀喇沁是鞑靼阿鲁台的直属部众。阿鲁台被瓦剌击败，喀喇沁部才由伯颜帖木儿带领投降了瓦剌。伯颜帖木儿死后，才使得孛来脱颖而出。所以，孛来算不上也先的部下。
孛来顶多算是帮助阿失帖木儿报了杀父之仇。但经过此前的内讧，瓦剌人不仅领土丢失，部众也四散奔逃。
一部分由也显得弟弟伯都王带领，投奔哈密卫。一部分是阿剌知院的巴图特部，被孛来吞并。主力部分则是西征的阿失帖木儿。
所以，阿失帖木儿回归漠北，目的很明确，就是收复失地。
但阿失帖木儿西征的中亚，却不是个好收拾的烂摊子。此时，帖木儿帝国早就崩溃，一群军阀各自为政。阿失帖木儿一旦撤军，可能会给自己后方造成威胁。所以，收拾烂摊子成了当时的头等大事。这又间接催生了哈萨克汗国。
直到中亚没有后顾之忧，阿失帖木儿才会安心回师。以此观之，阿失帖木儿显然不像也先那么冲动，是个有战略定力的人。并且在回师漠北三年间，阿失帖木儿就将汗廷势力全部赶出漠北，重新占领哈拉和林，控制哈密卫，向明朝遣使通好。
由此可见，阿失帖木儿在能力上也是相当的强。
漠南诸部
而感受到威胁的孛来，在阿失帖木儿回师的第二年，就挥兵讨伐，却遭到惨败。实力受挫之后，孛来的威信也随之降低。
首当其冲的就是小王子马可古儿吉思，对大权独揽的孛来越来越不满，以致于矛盾爆发。外战失败的第二年，孛来又昏招迭出的引发了内战——将小王子杀掉了。这成为蒙古本部再次内讧的导火索。
当时的势力划分，大体如下：
东北的兀良哈三卫，在明朝与蒙古之间，处于半独立状态。
西北的哈密卫，早就被瓦剌人控制，同时也向明朝朝贡，也独立于蒙古本部。
漠北的瓦剌人阿失帖木儿。
另有鄂嫩河流域的科尔沁部，由成吉思汗弟弟哈萨尔后裔孛罗乃、乌讷博罗特兄弟统领。
最热闹的地区则是以河套为中心的漠南。河套以西是乜力克人聚居的亦集乃，河套以东到大同宣府的边外。脱欢战胜阿鲁台后，曾经强行将东道诸王后裔各部、五投下部众、兀良哈三卫部分部众，迁徙到了河套地区。河套，也就成了各个部落势力杂处之地。
此前，孛来的实力最强，是因为他统领的喀喇沁部本就是北元鞑靼的中央军，又带领鞑靼各部战胜阿剌知院，收服巴图特部，实力增强。同时，孛来拥立小王子，也有了号令各部的名义。
此后，孛来被阿失帖木儿战败，自身实力减弱；杀了小王子，号令各部的名义也没有了。
这下，其他各部就坐不住了。原本与孛来结盟的阿罗出，转而与翁牛特部首领广宁王毛里孩结盟。毛里孩又与科尔沁部的齐王孛罗乃遥相呼应，打着为小王子复仇的名义，各部联合讨伐孛来。
1465年冬，孛来战败被杀。
成化五年
在讨伐孛来之前，众人曾经提议由毛里孩继任蒙古大汗。但毛里孩推让，拥立脱古思猛可，即摩伦汗。
只是，摩伦汗此前就生活在毛里孩的部落里。所以，摩伦汗更像是个幌子，掌握大权的还是毛里孩。
摩伦汗，是脱脱不花的长子，马可古儿吉思的异母兄。
当年，脱脱不花汗被也先打败，仅带着十余骑出逃到肯特山。肯特山中的起辇谷，是黄金家族的祖先墓地。那里由兀良哈千户世代守护。
这个兀良哈千户，与辽东的兀良哈三卫是两码事。尽管双方都起源于林中百姓，但分开的时间很早。兀良哈千户的首领是沙不丹。沙不丹的女儿是脱脱不花的原配，摩伦汗的生母。
但是，脱脱不花早就把这个妻子休了，却在落魄后跑到了沙不丹的地面上。沙不丹既怕也先追究，又因为女儿受辱产生的愤恨，索性就将脱脱不花及其随从十余人全部杀死——其中两人还是后来的蒙古少师脱火赤的兄弟。
摩伦汗因为是沙不丹的外孙，被留在了兀良哈千户中。之后，相邻的翁牛特部毛里孩又将摩伦汗接到自己的部落中。
毛里孩是成吉思汗异母弟别勒古台后裔，家族爵位广宁王。他的领地，正是呼伦贝尔草原一带。元朝灭亡后的蒙古汗廷，就设在他的领地上。阿鲁台统领东蒙古鞑靼时期，也以此地为中心。这么说，毛里孩算是房东，北元以及鞑靼历代大汗都是他家的房客。
但脱欢战胜鞑靼之后，也不管房东房客，一起从呼伦贝尔被迁到了河套。
尽管，摩伦汗投靠的是毛里孩，称汗也是由毛里孩扶持。但在成为大汗后，摩伦汗身边也聚集了一些其他部落的人员，并与少师阿罗出结交。这也引发了毛里孩的猜忌。
随后，鄂尔多斯部人孟克、高丽人和托不罕挑唆摩伦汗先发制人，进攻毛里孩。摩伦汗也是不自量力，最终死在了乱军之中。
而曾经与摩伦汗结交的阿罗出，在进攻明朝时，也遭到毛里孩在背后偷袭老营，也被逐出河套。
科尔沁部
毛里孩杀摩伦汗，驱逐阿罗出，独占河套。
河套地区，北面以黄河为屏障，抗衡瓦剌，南面则可以进攻明朝。但自从毛里孩驱逐了阿罗出之后，就不敢再度过黄河向北了。因为，黄河以北不仅有新仇阿罗出，还有旧恨阿失帖木儿。来自北方的双重压制，也等于给毛里孩断了后路。
由此，毛里孩改变策略，选择与明朝通好。成化三年三月，仅仅一个月时间，毛里孩就三次遣使要求与明朝通贡互市，显然很急切。
而在这之外，似乎一直置身事外的科尔沁部，则在孛罗乃的率领下，与阿罗出结盟，共同对抗毛里孩。
阿罗出是蒙古兀鲁部人。兀鲁部是最早被成吉思汗征服的五个部落之一（扎剌亦儿、兀鲁兀惕、忙兀惕、亦乞列思、弘吉刺惕）。这五个部落，称之为五投下。在蒙古与金朝作战时，驻守在长城一线，后由主管华北地区的木华黎及其家族节制。
元朝灭亡后，五投下跟着逃回草原，也属于鞑靼的主力之一。孛来死后，阿罗出又接管了喀喇沁部，实力仅次于毛里孩——在摩伦汗的汗廷，毛里孩是太师，阿罗出是少师。但因为遭遇毛里孩偷袭，阿罗出才被迫出逃。
这一次为大汗报仇的各部，以科尔沁部的孛罗乃为首，包括阿罗出、巴彦蒙克、满都鲁及兀良哈各部。
双方经过五年鏖战，最终以毛里孩兵败，困渴而死收场。
得胜之后，孛罗乃并没有像孛来、毛里孩那样拥立一个大汗做傀儡，自己做权臣；反而再次起兵，讨伐阿失帖木儿。可能孛罗乃想一步到位，收复漠北之后，自己做大汗。
因为，这个家族是出过大汗的。孛罗乃的父亲锡古苏特是阿台汗身边的重要将领，后被也先所杀。而阿台汗，就出自科尔沁部。孛罗乃曾被瓦剌扣押，父亲也是被瓦剌所杀。
所以，家仇国恨在一起，孛罗乃也要讨伐阿失帖木儿。
可结果是，就在同一年，阿失帖木儿再次卫冕成功，将孛罗乃击败。此后，孛罗乃不再有消息，代之而起的则是其弟乌讷博罗特。
摩伦汗死了，毛里孩也死了，孛罗乃失踪，阿罗出难以服众，一时间河套地区群龙无首，新的大汗在多年后才出现。
这一切，还要从蒙古西面的哈密说起。也就是毛里孩困渴而死、孛罗乃挑战阿失帖木儿失败的同一年，蒙古的西侧哈密也出事了。
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