错义突变可以影响蛋白质的热力学稳定性(thermodynamic stability)、弹性(flexibility)、构象动力学(conformational dynamics)。事实上，尽管良性的错义突变，也会影响了蛋白质折叠状态和未折叠状态的自由能。
错义突变所以引起严重的致病性通常由非保守性氨基酸的突变引起（即当野生型氨基酸残基被具有截然不同的物理化学特征的氨基酸残基替所换换），影响埋藏在蛋白质折叠结构中氨基酸残基的相互作用。在临床中，众所周知错义突变会降低蛋白质热力学稳定，许多遗传疾病、癌症和神经退行性疾病是错义突变引起的氨基酸改变，导致相应基因产物的空间不正确折叠。另一方面，突变也可以增强蛋白质稳定性，尽管这不太常见，但也可能会导致疾病发生。因此发掘疾病的蛋白质分子水平的致病性机制是至关重要的。但是通过实验方法直接测量每一个突变对蛋白质稳定性的影响，根本忙不过来。为了克服这种限制，多年来已经开发了许多计算方法来预测突变后蛋白质的热力学稳定性变化。蛋白质是高度动态的分子，其功能与分子运动内在联系。尽管蛋白质动力学起着至关重要的作用，但考虑到计算机模拟(computational simulation)成本，大多数方法是基于静态的蛋白质结构，去评估突变对蛋白质结构和功能的影响。在这里，介绍的DynaMut，实现两种不同的，建立良好的正常模式方法的Web服务器，可以通过采样构象来分析和可视化蛋白质动力学，并评估由振动熵变化引起的突变对蛋白质动力学和稳定性的影响。这个图放在文章、paper 是很不错的选择。赶紧动手试试吧。
参考文献：Marabotti A, Scafuri B, Facchiano A. Predicting the stability of mutant proteins by computational approaches: an overview. Brief Bioinform. 2021;22(3):bbaa074. doi:10.1093/bib/bbaa074
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