来源:艾博思生物
人尿外体/微泡RNA的大规模并行测序揭示非编码RNA的优势组分
源于外体/微泡(统称为微泡,micorvesicles)的完整RNA发现引起了科研人员的极大兴趣,她们作为潜在生物标志物用于疾病的非侵入性分析。哈佛医学院的研究人员使用Illumina Genome Analyzer测序分析确定了尿液微泡中的核酸读取范围。微泡外的核酸用RNA酶和DNA酶进行消化处理,微泡内的核酸-“载货”在有和无DNA酶消化进行分析,研究包含在微泡内的DNA和RNA序列。结果显示,相当大比例(87%)的读取比对为核糖体RNA(rRNA)。非核糖体RNA序列中,60%比为非编码RNA和重复序列,包括LINE,SINE,卫星重复序列和RNA重复序列(tRNA,snRNA, scRNA和srpRNA )。剩余的40%非核糖体RNA为蛋白编码基因和剪接位点mRNA,涵盖了人类基因组已知的21892个蛋白编码基因中的将近13500个。集中分析肾和泌尿生殖道的蛋白编码基因发现包括肾元和集尿管的完整段,识别到了一些指示膀胱和前列腺基因。这项研究用微泡转录本分析的手段,揭示编码基因覆盖了整个泌尿生殖系统,包含在微泡内的大多数非核糖体RNA序列是具有潜在功能的非编码RNA,在细胞调控中扮演重要的作用。
实验流程:
1.微体RNA质检
2.样品处理
3.RNA组分比例
4.基因定位到器官
5.TOP50基因分析
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本次研讨会主要从以下几个方面展开讨论:1),生物标志物与检测,包括ncRNAs检测在癌症诊疗机制、miRNA 诊断标记、外泌体颗粒的提取、纯化和内容物分析等;2)外泌体与肿瘤,癌症早期诊断ncRNA分子标记物筛选、外泌体介导癌症诊断标志物的研究、exosome介导癌症转移及表观调控等;3)外泌体与疾病。除了外泌体在癌症方面的热点研究,在肺部疾病、心血管疾病等领域研究同样十分广泛;4)外泌体与干细胞。干细胞外泌体功能研究进展、外泌体调控干细胞的研究等。
编辑:沚夫
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