zotero简介
zotero（zotero.org）是Firefox浏览器下的一款扩展（add-on），虽然它的桌面版已经在开发中了，但短时间内只能通过打开浏览器来使用，好在对于现代人来说，使用电脑的大多数时间都在对着浏览器。(现在zotero standalone版本已经开发到beta版，支持safari和chrome）
在我看来，zotero的主要使用者应该还是科研人员，尤其是广大还在研究生院里挣扎的学生。作为一款浏览器扩展，简单的说，zotero就像是把Endnote这种专业的文献管理软件的核心功能整合到firefox浏览器中，通过在浏览器里简单的点击鼠标来收集论文，图书的信息（像是作者，期刊名等等等等）。通过在word里安装zotero的相关插件，可以在论文里方便的插入参考书目。作为一款免费扩展，zotero极其便捷的科学文献信息采集/输出功能应该是它对我们最大的吸引力。
其实，除了文献管理，zotero还有很多其他功能，它可用来当做网摘工具，可以直接存储本地文件，可以作为云存储方案，还可以通过创建Group Librery来共享文献。但这些都不像是zotero的核心功能。
科学文献管理
强大的抓取功能
zotero最引人注目的就是它便捷的文献引用信息（citation information）抓取功能，当你使用firefox打开任何论文，图书的网页时，zotero都可以自动感知citation information，并会在浏览器地址栏的右侧出现对应的小图标，只要点击一下，zotero就自动抓取该篇论文的所有引用信息存储于本地数据库中，所抓取的信息还自动附有原始的url，便于以后回来再次查看。
在论文页面：
（zotero最新版本在你保存引用信息的时候会尝试下载原文）
还可以采集书籍（我一般都是抓google book）：
如果网页上有多个文献（例如通过google scholar搜索到的页面），zotero会给出一个文件夹图标，点击它会跳出对话框，由你选择需要抓取的项目：
zotero的这种自动感知功能十分强大，journal的网页我目前还没有碰到过不能感知的。实际上自动感知所支持的网页还有Amazon，Nytimes（应该是给商科用的吧）等等，而且zotero支持的网页数目还在持续增长。
我没有用过endnote等其他的工具，但通过点击一下小图标就能完成抓取，应该算是够方便了吧。
（zotero有代理功能，比如你访问sciencedirect是通过学校图书馆的代理，此时zotero会提示你要不要记住这个代理，如果选择记住以后不管从哪里访问sciencedirect，zotero都会把页面重定向到那个代理，这样用google scholar搜索然后再找全文就比较方便）
便捷的笔记功能
做科研当然不能只是存储大量的文献，zotero也提供了很好用的笔记功能，你可以建立stand alone类型的笔记：
或者是作为一篇文献的子文件（这也是我最常用的）：
Zotero还提供了tags（通过标签来对文献分类），related to（在文献之间建立超链接）来进一步管理文献。感兴趣的同学可以自己查看。
我自己在zotero里组织文献的方式使用的是最土的文件夹方式：
每一个子文件夹内都是某个小项目的的文献，点击父文件夹Research可以看到所有的条目，然后可以通过zotero强大的搜索快速定位自己感兴趣的条目（像是某一位作者的论文）。这个下面还要提到.
输出功能
Zotero可以由你选取若干条目来生成Bibliography（文献目录）：
这个是点击后选择rtf格式输出的效果：
与其他软件的整合（word，latex等）
除了直接生成Bibliography, zotero还提供了与多种软件的整合，例如MS word, 官网的一段视频最好的说明了这个功能。
简单的说，在安装了这个Word Plugin之后，你的word工具栏上会多出几个按钮，通过点击它们，你可以在文档的任何地方插入引文，在文章末尾生成Bibliography。而且你可以随时改变引文的格式，以适应不同的要求。对于要写论文的人，应该是很省力的。
为了推广zotero，开发者推出了一系列与其他软件整合的工具，像是latex，word等，甚至还有wordpress，点击这里可以看到所有的plugin。
如果你是从Endnote转来的用户，zotero也可以导入endnote里文献信息，可以看这篇博文。
Metadata retrieve功能
如果手头只有pdf版的论文，想要获取引用信息，怎么办？zotero提供了很好用的自动通过网络抓取引用信息的功能（Retrieve Metadata for PDF）：
这个是原始文档：
（实际上可以把自己的文献库同步到zotero的服务器上，并且好像可以和其他研究者合作，具体请查看官网）
其他功能
网摘
除了对科学文献进行管理，zotero的抓取功能对一般的网页也有效，它可以保存当前的网页快照，结合firefox的其他有趣的插件，可以有很好的效果，完全可以胜任一个优秀的网摘的软件：
这是原始网页：
这是经过Readability插件处理过，由zotero抓取的网页快照，你甚至可以在上面添加自己的note，以及高亮文本：
效果还是不错的,在zotero面板里可以看到该条目：
本地文件管理
除了通过浏览器添加内容，zotero也支持添加本地文件，你可以将电脑上的电子书，照片，甚至是视频添加进来，进行管理。（只要把文件拖拽进zotero就行，也可以把文件从zotero里面拖拽出来）
下面这个就是我这个学期数学课的所有相关文件：
（我的建议是使用PDF xchange viewer在firefox里面内嵌查看PDF，还可以加批注。不需要批注的话PDF阅览器推荐Sumatra PDF，快得发指）
善用检索功能
zotero有很好的全文检索功能，这里的全文检索是真正的连pdf文件内部都能搜索到（win下需要安装pdfinfo及pdftotext两个小软件，在preferences-search里），下面是个例子，搜索所有与关键词相关的项目：
（zotero还有保存搜索的功能，类似iTunes里面的智能播放列表）
可以看到，pdf的文件名，用户添加的note，pdf内部都能被搜索到。
对于研究生，难免要读很多论文，对每一篇论文，都顺手写上自己的认识，zotero自动帮你把笔记与pdf文件收纳于一个项目里，这样以后也便于查找，能做到这样，可能是做好文献管理的第一步吧。
待改善的地方
Zotero有一些小问题，譬如当你存储的文件越来越多，在firefox里打开zotero就变得越慢，这可能短时间没办法解决，只能期待桌面版了。
（对中国期刊网，中国知网目前支持不好，只有通过下载引文信息来添加）
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