黄巾将领彭托死后，汝南郡态势也被官军所稳定。朝廷遂下令黄埔嵩北上驰援官军董卓平定冀州的黄巾军，朱骏则率部讨伐南阳的黄巾军。
自从三月间南阳太守褚工被黄巾军张曼成不斩杀后，南阳黄巾军声势大涨，张曼成称“神上使”在黄巾军中影响甚大。于是集结黄巾军，攻打南阳，去屯兵南阳郡郡治宛县城下。
双方对峙一百余日，宛县已岌岌可危。不过，新到任的南阳郡守秦颉是个猛人，他迅速组织义兵联合郡兵一同对黄巾军发动进攻，竟一战斩杀了黄巾军的神上使张曼成。然而张曼成之死并未造成黄巾军祸乱。他们很快拥立赵弘为统帅，加上各地战败的黄巾军推入南阳，人数反而再度扩大，拖家带口算上多达十万之众。黄巾大军在赵弘率领下攻占宛城，将此地作为根据地。朱骏率军抵达后，与秦颉商讨战略方针，决定会同荆州刺史徐璆之兵合围宛城。宛城城高池深，加上黄巾军人数众多，官军围攻两月也未能越雷池一步，但宛城的黄巾统帅赵弘也在激战中阵亡。众人又推举韩忠为统帅，继续抵抗官军。官军一方，朝廷多次催促朱骏加急攻城，甚至想临阵换将，多亏晁中、司空、张温力保，朱骏才未被撤换。朱骏见围攻多日不成，便假装撤围，引诱黄巾军突围。韩忠果然中计，一出城突围便被官军的伏兵杀的片甲不留。韩忠招架不住，只得投降。原本以为宛城之战就此结束，没想到秦颉下令斩杀了已投降的韩忠。这次杀降事件导致宛城黄巾军再一次凝聚，推举孙夏为统帅继续殊死抵抗。不过此时黄巾军已元气大伤，破城只是时间问题，官军加大攻势，在最后的攻坚阶段，朱骏帐下的一名将领表现异常英勇。这一名将领任佐军司马一职，他率领手下的淮泗精兵对宛城发起猛攻。在官军连日攻击下终于破城。宛城被攻破后，孙夏率部向南阳郡西部的山区转移，最后被官军剿灭于金山南阳黄巾随告平定。而朱骏账下那名勇猛的佐军司马，就是日后江东霸业的第一代开创者孙坚。
最为核心的作战区域是北中郎将卢植负责进攻的冀州黄巾军，这一地区的黄巾军由天公将军张角亲自统帅，也最不好对付。不过，随着各地黄巾被官军击破，张角率领的黄巾军也转攻为守，决定采取固守战术。与三弟张梁一同退守广宗。二弟张宝屯军曲阳互为犄角之势，企图拖垮冠军。张角的战术在前期的确起到作用，卢植率部打了三个月也没有进展，反而因此被朝廷降罪，将其撤换。派董卓接替他的职务前来作战。董卓打了两个月，仍然未能攻下，朝廷于是八月调皇甫嵩前来支援。人算不如天算，张角企图拖垮官军，却想不到自己先被拖死了。在围城期间，张角一病不起，不久便命归九泉，等到皇甫宗率军前来之时，广宗黄巾军的实际领导者已是张角的三弟人工将军张梁。
进入冬季十月，黄埔嵩率部攻城，张梁率领下的黄巾战力不减，勇往直前。几个回合下来，皇甫嵩未占到丝毫便宜。从卢植到董卓，再到黄埔嵩，都拿固若金汤的广宗城没办法。既然强攻不成，黄埔嵩只能改变战法，遂下令关闭营门，休养生息，同时观察张梁军的变化。黄巾军被围城数月，本身就很疲惫，现在见到官军偃旗息鼓，难免松懈。皇甫嵩巧妙通过了黄巾军一鼓作气的锋芒。在其再而衰三而竭之际，忽然发动猛攻，终于一举攻破广宗。张梁率领三万黄巾军与官军进行殊死血战，最后全部阵亡，并有五万余黄巾军家眷投河自尽。广宗城破张梁战死，此前已病故的太平道首领张角也被挖了出来，开棺戮尸，枭首传至京师。接下来，官军直捣曲阳，失去广宗的掩护曲阳迅速于十一月被皇甫嵩攻破，地公将军张宝也在混战中阵亡。
至此，张氏三兄弟全军覆没。随着张角兄弟的相继殒命，也标志着甲子年历时十个月波及八州，影响全国的黄巾之乱被朝廷平定。
黄巾军带来的统治危机总算过去了， 东汉王朝也以平定黄巾为寄，改元中平，光合七年也是中平元年。然而，张角之死并不意味着这场动荡的终结。
黄巾军转入地下，太平道仍在顽强传播黄巾之乱的同时，蜀地五斗米道的张修也发起起义。东汉疆土之上，此起彼伏的民变并未消失，反而愈演愈烈。自甲子年的黄巾之乱以来，各地变民纷纷起事，大集团两三万，小集团六、七千不可胜数。例如，张角死后，次年冒出个张牛角率领变民与另一首领褚飞燕合攻巨鹿郡的颍陶。张牛角战死后，楚飞燕统领其部，转战数地，成为了让朝廷极为头疼的黑山贼。
中平五年，全国范围内又爆发第二次黄巾起义，首领为郭太，人员仍是太平道的信徒，队伍一度多达十万余人。此外，豫州、青州、徐州等地区先后出现多支黄巾军，尽管后来的黄巾军起义都没有再像当初那般规模庞大。张角及其太平道却一直阴魂不散。直到汉献帝初平三年，曹操收编了青州黄巾军后，大规模的黄巾军集团才算被评定。但一些零散的小规模黄巾军武装一直持续抵抗，直到东汉灭亡，朝廷为镇压民变，给予地方官员及门阀豪强组织武装编练军队的机会，直接导致了汉末地方军阀的兴起。最终将帝国推向毁灭。黄巾之乱是东汉帝国始终未能摆脱的梦魇。
（下一篇介绍三国奇人，才华不输诸葛亮却含恨离世）
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