近来生命科学圈最大的新闻,就是这些年风光无限的CRISPR手段突遭质疑。其造成的危害被认为不可控、不可逆,“杀敌一千自损一万”,令业界一片哗然。如今,这项“质疑”本身又遭诟病。
最近,两家新兴的医药企业Editas药物和Intellia制药的科学家们分别写信给《Nature》编辑部,认为Nature Methods 最近发表了一篇题为“Unexpected mutations after CRISPR–Cas9 editing in vivo”的论文结论不正确,要求将该论文撤稿,并从科技文献中删除。
“Unexpected mutations after CRISPR–Cas9 editing in vivo”文中显示,在预先设计之外的基因位点进行剪切与编辑,这一现象被称为“脱靶效应”。科学家们之前的解决方案是利用计算机算法提前找到基因组中序列接近的同源区域,这样在设计时就可以有针对性地进行选择,并且还便于进行验证。而且,在细胞系与培养皿中的组织里中进行的CRISPR基因编辑实验结果也证实了这些预测性算法的可靠性。为了证明CRISPR技术在活体动物中也一样可靠,研究人员在小鼠体内进行了实验,但结果让人吃惊——在对两只接受CRISPR基因编辑的小鼠以及一只未接受编辑的小鼠进行全基因组测序后,研究人员观察到了比预计高出许多的基因突变。而且这些预计外的突变中,有68%在两只小鼠中都出现了,也意味着这些突变并不是随机产生的,而且这些突变大约一半和已知基因相关。它们可能会影响蛋白编码、基因转录、或是基因调控。
上述论文发表后,业内不少科学家通过社交媒体指出,虽然进一步改善CRISPR技术的精准度是十分重要的,但该论文作者可能还不清楚造成这一问题的关键,而且论文存在基因识别错误、实验动物数量偏少等基本性错误,更严重的是,论文将动物之间正常的遗传性差异误认为是CRISPR编辑导致的结果。
Intellia制药的科学家在信中表示:“这篇备受媒体和公众关注的论文已经对我们公司造成了巨大损失。但其实验设计和结论都存在问题,研究结论缺乏科学性,应该将其撤稿。”Editas药物首席技术官Vic Myer与哈佛大学教授George Church等11位科学家联名写信称,该论文的实验数据不能支持其结论。“论文应该被撤稿,至少应该更新承认其中的重大误导。”
Springer Nature的发言人回应称,他们已收到大量与这篇论文有关的反馈,会认真考虑所有来信并与论文作者就相关问题展开讨论。而目前论文作者还没对这些反馈作出回应。
原文作者:
Antonio Regalado,Senior Editor, MIT Technology Review
原文链接:
https://www.technologyreview.com/s/608073/gene-editing-companies-hit-back-at-paper-that-criticized-crispr/
相关论文:
“Unexpected mutations after CRISPR–Cas9 editing in vivo”
http://www.nature.com/nmeth/journal/v14/n6/full/nmeth.4293.html
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