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国自然经验分享| 猴哥中了国自然,用meta 生信作为前期基础

2019年度国家自然科学基金申请项目评审结果公布,你是不是也迫不及待的想要查下自己的项目有没有中了?

快来看看具体的查询渠道时间及申请复审流程吧!

猴哥自己也申请了青年项目,可能运气比较好,中奖了。

作为一个没有什么基础的临床医生,猴哥整天夜班、急诊班、体检班连轴转,上班10年没有公休假。作为一个无平台、无背景、无基金、无经费的科研屌丝,猴哥是怎么做到拿基金的?

无他,唯有生信 meta!快来参加8月24-25日杭州的生信 meta线下班吧。这里,猴哥带你飞起。。。。。。

看看猴哥的标书吧,其实就是几个生信中的热图和meta中的森林图:前期基础 图 1是三个 热图(如下图)

前期基础图2是柱状图、相关关系图、ROC曲线(如下图)

前期基础图3生存曲线(如下图)

前期基础 图4 是 网站上预测的lncRNA的结合位点(如下图)

前期基础 图5 做了一些简单的基因的功能实验:周期、凋亡、侵袭、迁移(图形很丑,不好意思放上去)。

有人说,猴哥你这不够吧。是的,猴哥也想到了,于是猴哥之前攒了一些meta文章,放在前期文章基础里面。生存meta分析、网状meta分析都算作很强大的前期基础了。

(向上滑动启阅)

1. Sun M, Du M, Zhang W, Xiong S, Gong X, Lei P, Zha J, Zhu H, Li H, Huang D, Gu X. Survival and Clinicopathological Significance of SIRT1 Expression in Cancers: A Meta-Analysis [J]. Front Endocrinol (Lausanne), 2019, 10:121.(第一作者,IF: 3.6750,PMID: 30930849 doi: 10.3389/fendo.2019.00121)

2. Huang JJ, Sun M, Wang ZT, et al. Induction treatments for acute promyelocytic leukemia: a network meta-analysis. Oncotarget. 2016 Nov 1; 7(44):71974-71986. (共同第一作者,IF=5.168, DOI: 10.18632/oncotarget.12451, PMID: 27713127)

3. Li Z, Sun M, Wang F, et al. Association between pioglitazone use and the risk of bladder cancer among subjects with diabetes mellitus: a dose-response meta-analysis. Int J ClinPharmacolTher. 2017 Mar; 55 (3):210-219.

4. Zhu GQ, Sun M, Liao WT, Yu WH, Zhou SL, Zhou ZJ, Shi YH, Fan J, Zhou J, Qiu LX, Dai Z. Comparative efficacy and safety between ablative therapies or surgery for small hepatocellular carcinoma: a network meta-analysis. Expert Rev GastroenterolHepatol. 2018 Jul 25:1-11. doi: 10.1080/17474124.2018.1503531.

前期基础里面的核心内容就是这样了。左手生信,右手meta,就像胡萝卜炖牛肉,端到了评审专家的面前,专家笑了笑,说了句:“让你过算了”。

来杭州,猴哥告诉你后面的故事。世间没什么,唯有酒还行。就着西湖美景,啜一口绍兴黄酒,聊聊生信和meta吧。

猴哥之前还分享过一个经验,供大家参考:网状Meta发SCI,念复旦PHD、拿基金,不难!猴哥证明给你看(ಡωಡ)

另外,感谢大家对猴哥这次培训班的热情支持,还有一些获得纪念奖、但未联系后台的读者,请尽快联系后台,通知:杭州线下课集赞活动获奖名单;增设纪念奖,每位参与集赞活动的读者都有我们将于2019.08.26统一寄出纪念奖。

培训班详情


实操SCI文章—生物信息数据挖掘和网状meta分析(杭州)

课程介绍:

目前,不做实验发表医学SCI文章有两种方式:生物信息数据挖掘和Meta分析。本课程专门为没时间进行「湿实验」的临床医生或医学生量身打造。从生物信息学分析和网状Meta两种文章类型出发,结合文献实例的学习和动手操作,带领大家一步步从数据分析的「门外汉」到自己动手整理出一篇可以发表的文章。通过「接地气」的套路学习和丰富的案例分析,真正掌握分析的方法并运用于实践。

本次培训集结Freescience联盟生物信息版主赵老师和网状Meta分析版主猴哥,两位大神共同打造本次课程,以第一或共同作者发表的文章为例,手把手复盘文章的分析、写作及投稿过程。

课程目标:

1. 熟练掌握生物信息数据挖掘和网状meta分析的方法。
2. 能独立复盘2篇SCI的分析结果并应用于其他研究领域。

课程亮点:

1. SCI作者,专业讲解
2. 串联知识,复盘全文
3. 一次购买,永久听课(仅限本人此班)
4. 课后答疑,持续免费

内容安排


第一天 上午:8:30—11:30

数据挖掘太高深?手把手带你入门

1. 数据挖掘在医学科研和临床中的应用
2. 常用科研数据库介绍及实例分析(表达谱数据库GEO、肿瘤数据库TCGA和SRA等)
3. 基因芯片和高通量测序介绍及下游实例分析(Genechip和RNAseq)

第一天 下午:1:30—5:00

一作讲者专业剖析,复盘4.4分生信SCI

1. 文章整体解读和亮点分析

2. 数据下载和整理
3. 基因分析软件实操(BRB-ArrayTools)
4. 生物网络构建和功能模块识别(Cytoscape)
5. 临床相关数据分析和绘制 (SPSS&GraphPad)

6. 生信写作方法和投稿技巧
7. 如何回复审稿人意见

生信SCI图表

Zhao X,Xu M, Cai Z, Yuan W, Cui W, Li MD. 2019. Identification of LIFR, PIK3R1, andMMP12 as Novel Prognostic Signatures in Gallbladder Cancer Using Network-BasedModule Analysis. FRONT ONCOL 9:325.

第二天 上午:8:30—11:30

基础知识引入,由简入深
1. 网状meta的概念、适用场景和流程
2. 三个基本假定(同质性/相似性/一致性)
3. 间接比较的基本原理(频率学方法、贝叶斯比较)
4. 数据的提取和录入
5. Cochrance风险偏倚评估
6. GRADE质量评估

第二天 下午:1:30—5:00

讲者文章实操,手把手练就meta分析从0到1
1. 贝叶斯/频数学分析的软件实操
2. 相关图形的绘制(STATA & R/WinBugs)

3. 网状meta分析常见误区辨析
4. meta分析论文写作方法和技巧
5. 如何回复审稿人意见

网状Meta分析SCI图表

Huang J, Sun M, WangZ, Zhang Q, Lou J, Cai Y, Chen W, Du X. Induction treatments for acutepromyelocytic leukemia: a network meta-analysis. Oncotarget 2016; 7:71974-86.

讲师简介

赵忻艺浙江大学医学院附属第一医院精准医学中心生物信息分析工程师,从事生物信息学和医学相关研究,主要致力于医学大数据挖掘,发表SCI论文13篇;参与5项863、973和精准医学等国家级重点项目;8年数据分析经验,30多场讲座,拥有丰富生物信息学授课经验。目前,已建立浙大医学数据挖掘团队,旨在降低研究者学习大数据的门槛,推动大数据共享与研究协作,发表更高质量的研究成果,为科研决策提供精准的预测和实验证据。

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