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有机硕士学姐告诉你CRO的工作流程(干货长文)

本人有机化学专业小硕一枚,收到第一份工作的offer还是六年前的事,虽然这会暴露我的年龄,但是大妹子我豁出去了!想来想去,这几年下来,给我印象最深的也就是刚走出校门,自己在一个陌生城市工作的境况和在工作中与公司一起成长的经历。值得庆幸的是我这个人很容易满足,虽然觉得工作很累,但很快乐,呃,有点扯远了!回归正题。

我的工作头衔是有机合成研究员,雇主是北京一个药物研发外包服务公司叫得“高大上”一点就是CRO制药公司。虽然恶劣但是和在学校的条件相比,学校的条件简直弱爆了。这里至少有几台LC/MS可以用来检检测反应进程。人力资源部签完合同、报到手续完成后,我就被人事管理人员带去见主管(director),简单的自我介绍后,马上就被分到各小组组长手下,也就要开始课题的研究了。脾气好的领导可能会给你一些指导和一两天的环境熟悉时间,遇上变态的领导,你就只能自认倒霉。

入职后,还会被按接手课题类型打上一个标签,我当时就被打上了FTE。所谓的FTE就是Full Time Employee的简称,它是CRO提供的服务模式。基本上是客户提供一系列目标化合物结构,要求平均一天投几个反应,成功几个反应,一个月要完成和提交几个化合物。这种类型的课题一般都有化合物合成库,针对某个靶点或适应症。

FTE大概的工作流程如图1所示,客户设计好化合物结构后,公司信息部门会建立该课题的化合物库,领导会把两到三个该课题的结构信息和以及初步的合成路线交到每个研究员手上。拿到路线后就可以开始查找具体的操作和所需的原料(试剂,溶剂等),接下来就该预定原料,一般先在公司库房内部系统查找,如没有,就像采购部门申请购买。如果实验室里面有所需的原料储备,就不需要公司内部网上预订。向库房下发需求菜单后就可以去领料。财大气粗的客户为了方便实验人员实验需求可能会给配置一名库房送货员,直接将原料送到实验室。拿到原料就可以进行实验,实验完成后每步都要数据表征,拿到最后目标化合物且纯度符合客户要求就可以向QC部门提交表征数据和交货,书写结题报告,然后又得进行下一个课题,如此反复循环。


关于合成路线:像我们这种级别的小硕根本没有资格来设计,一个新化合物的合成初始路线往往是由team或group级别的领导完成,他们会用反推法画出大概的过程和每步的中间体,可能会附带一些文献信息。具体的操作要自己去查找,特别是需要做几个平行反应时,不同文献的反应条件有时差别比较大,往往需要细心查找和对比。一般在Reaxys数据库查找(这个可以根据公司能够提供数据库类型选择)或公司自己内部数据库查找(公司自己把已完成实验的E-note集合在一起生成的库,一般按照反应式查找,就可以调出整个公司关于该反应的具体实验信息,刚开始对每个员工都开放,后来因为涉及知识产权保密问题就没有开放)。

关于实验:刚开始实验都要先进行小试,原料投几百毫克到几克不等,这个要根据原料的价格来确定,比较贵的试剂甚至只能先投10毫克试试,反应过程还要不断监测。一步反应尝试几个条件后实验不成功的话就会考虑换路线。监测反应有两种方法,首选LC/MS(液相色谱-质谱联用仪,针对有质谱信号和紫外吸收的化合物监测),反应液猝灭后,经过滤就可以拿去检测,一般三四分钟就可以拿到结果,这种方法比较靠谱,缺点是若前面排的样品比较多的话,等待过程会比较煎熬。另一方法是用TLC (thin­layerchromatography),只要有薄层板和展缸就可以进行,展开剂若文献已给出,直接按照文献提供的试剂种类和比例配置再稍微调整即可;若文献没有给出相关信息,可以根据中间体的结构特点,猜测其极性大小,再选择溶剂类型,不断尝试,这是一个非常艰难的过程,往往在首次合成时会比较费劲。

有些实验是比较危险的,偶尔听到甚至亲眼见到实验台起火,搞得我们做某些实验时总觉得“心惊肉跳”的,实验中遇到易燃易爆的试剂可尽量避免使用,有些实在是无法避开,所以实验过程中细节非常重要,除了保证实验桌面干净整洁外,各个实验操作都要严格按照规范进行,养成良好的实验习惯,做好实验记录、写实验记录本和E-note。在反应结束后就不得不进行后处理了,这是整个实验最后的关键环节,细节决定成败,后处理更是要处处小心。在溶剂浓缩环节要特别注意等到旋转蒸发仪的压力上去之后才能走开,不然的话悲剧就会发生,旋转瓶随时都有可能掉到水浴锅中,像我这种处女座的谨慎派就发生过此类“杯具”,此时的心情可想而知,药品、试剂、时间、精力...,所有的一切都白费了,此时只剩心里在默默的流泪。此外该过程还要防止液体喷到接收瓶中,虽然中间有缓冲球,但如果旋蒸轴不干净,也会引入一些未知的杂质,给分离和提纯带来很多的麻烦。实验中遇到的疑问可多请教一些前辈,他们往往知无不言,言无不尽。

关于产品:最后产品经过柱层析或薄层层析(俗称“爬大板”)纯化后浓缩,若为固体可以再进行简单的重结晶,就可以送去检测纯度,一般紫外吸收达到95%就可以(纯度一般按客户要求)。经真空干燥后可送去进行核磁测试,运气好的话可一次就拿到漂亮的谱图,运气不好的话,产品纯度可能不够或者含有其它高沸点无紫外吸收的杂质时,就得再次重结晶或通过Pre-HPLC纯化。

关于交货结题:激动人心的时刻终于要到了,交货结题意味着一个课题的完满结束。合成的目标化合物经过LC/MS和核磁数据的表征确认后,如果能达到客户要求,就可以写实验记录,向QC部门提交课题、结构、LC/MS和核磁PDF等信息,等待反馈意见。这些完成后基本该课题就可以结束了。如果QC部门没有意见,谢天谢地,就可以去领取专门的装货瓶。装瓶也是个技术活,特别是对冻干后状态蓬松的化合物,春天和夏天还好,秋冬两季干燥时节,身上静电多,在通风橱一不小心就会飞掉,也只有干着急和肉疼了。在这种情况下,找个无风的地方,把产品用刮刀压实,再装瓶可减少损失。货装好经QC部门签字,就可以写结题报告。此时,你以为一切都大功告成,可以好好休息了吗?No,别高兴得太早,下一个课题已经在向你招手了。


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