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点小板很纯,过完柱子产品却很少,发生了什么?
北极熊_
>《工具箱》
2020.12.17
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做合成的我们都有这样一个期待:反应干净,后处理简单,产品纯且收率高。例如当我们做手性化合物时,期待反应选择性好,ee值都能大于99.5%,;当我们做长的合成路线时,期待路线中间不要出幺蛾子,能顺顺利利做到底;当我们做有机金属化合物时,期待能快速的长出晶体,不折腾。。。
不管是做全合成,还是做有机中间体,我们做实验时,点小板都是必不可少的,期待没有杂点,白白的小板上最好只有一个又大又圆的产物点,这个过柱子就很舒服了。
但是,化学的精彩不仅在于其神奇的创造未知化合物,还有什么事情都会发生,在任何一个环节都有变数。
今天就和大家分享几个很小的细节,一些很容易被大家忽略的细节,但是这些细节往往决定着反应的成功和失败,如果没有注意到,往往会造成很多不必要的工作。
有这样一个大家经常会遇到的现象:点小板很纯,有的时候送LCMS也很干净,然后我们就兴冲冲的去过柱子,高高兴兴的过完柱子,但是拿到手的产品却很少?这是怎么回事呢?小编今天就分享一下自己的经验,希望能对小伙伴们的科研路上提供些许帮助。
我们分析一下从点小板到过柱子到旋干称重的全过程,发现有很多环节可以出现问题,小编主要从以下三个环节来说:1,萃取环节;2,过柱环节;3,旋溶剂环节。
关于萃取环节
,首先强调的一点就是:没有确定拿到产物之前,水相一定不要丢,不要丢,不要丢。这个环节比较好理解,产物要么在水相没有被萃取出来,要么水相有机相都有,或多或少而已;要么在有机相。假如产物在有机相,水相里面没有,那么萃取环节可以排除了。
关于过柱环节
,同样首先强调一点,没有确定拿到产物之前,柱子一定不要丢/洗,不要丢/洗,不要丢/洗。一般得到产物比较少,在过柱子环节有可能出现的问题,有以下几种情形:
1,
化合物极性太大,比如胺类化合物,含有羧基,羟基这类的化合物,可能是被柱子吸附了,因为我们常用的硅胶是酸性的,这种情况下,一般使用大极性溶剂冲,可能会将产物冲洗下来(含氨基的化合物,可以加点TEA或者氨水)。
2,
化合物溶解性不好,比如一些杂环化合物,刚性强的化合物,用点小板的体系可能溶解性不好,大部分都还留在柱子上,一般更换过柱溶剂体系,换溶解性好的溶剂洗脱。
3,
化合物对硅胶不稳定,可能在拌样或者在硅胶柱里就分解变质了,一个点变成了一堆点,或者干脆就变成了极性很多的未知杂质,根本淋洗不下来。
4,
化合物含有对硅胶不稳定的官能团,比如一些硅醚类保护基,Boc_保护基团等,这时候极性变大,要换大极性溶剂淋洗才行了。
5,
点小板的展开剂不对,点小板的展开剂体系过大或过小,然后用点小板的展开剂体系过柱子,过大一下子全出来,白费力气,只能重新来过;过小产物出不来。
6,
还有一点就是,在过柱子的时候,你除去接个电话,抽根烟这类,忘了关柱子,结果产物全漏了(这个骚操作,我相信小伙伴不会有的)。
关于旋溶剂环节
,这个小伙伴肯定会说这个环节不会有问题的。小编以前也是这么认为的,直到出现过好几回旋着旋着,东西都没有了。其实,在旋溶剂环节,大家一定要注意产品的沸点,有的时候不仅仅是分子量100-300的小分子化合物,也不仅仅是脂肪类化合物,有的时候芳香杂环化合物沸点也不高。比如有一次,小编做过一个吡啶的三氟甲基的衍生物,点板和LCMS都很干净,水相里也没有产物,过柱子点也出的很好,但是一旋干产品就很少,想来想去找来找去找不到原因,后来还是无意间看到防爆球口边有一点油油的东西,小编秉着不怕苦不怕累的精神,去送了一个LCMS,发现就是产品,很纯的产品,然后我又把储液球里的液体送了个LCMS检测,发现里面也有产物,到这时候才发现原来产物都被抽走了。
所以,在旋蒸溶剂的时候,对于一些分子量较小100-300的化合物,还有一些杂环化合物一定要当心,一定要把沸点这个因素考虑进去。还有一点需要提醒的是,小心产物和溶剂共沸,有些产物单独沸点可能有一百多度,但是共沸点可能会低很多。(共沸是一个很有意思的现象,有空和大家聊聊共沸或共挥发的事。)
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