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如何正确绘制结构式以准确预测化合物的核磁谱图

ACD/NMR Predictors 是ACD/Labs 提供的业界最精准的核磁谱图预测工具,可依据用户提供的候选结构快速获得对应预测谱图((1H、13C、15N、19F、31P、2D NMR),并与实验谱图进行比对,辅助确认候选结构。

往期介绍文章:

NMR谱图预测准确性评测(ACD/NMR Predictors VS. ChemDraw)

对于化学研究者而言,都能轻松快速地绘制出化合物结构式,但是在使用NMR Predictors软件进行核磁谱图预测的时候,用户需要遵循一些规则进行绘制结构式,以获取精确的预测结果。以下我们将举一些典型的例子,以便用户参考学习。

一、含有双键的化合物

01

避免使用立体键来定义双键的构型。

软件通过计算穿过双键虚线两边取代基的单键之间的角度来确定双键的构型(如下图所示)。如果这个角度不是0◦这样的结构被定义为特定的异构体:E或Z。

02
双键的一边不能画两个取代基

03
环状结构中的双键用z构型绘制(非e构型)

二、其他类型的异构现象

酰胺同分异构体应该用确定的取代位置来画。

类似的规则也适用于肟、腙和亚硝胺的异构体。

三、立体键和取代基的取向
01
取代基的方位应该借助立体键来画

02
除了取代基的取向,在双环结构中还需显示桥的方向。

03
立体键指定方式

立体键的指定方式应使它们显示环中取代基的相互取向,以及所有手性碳中心(如果可能的话,磷,硫等)的构型。

避免绘制连续的立体键(“头”到“尾”)。换句话说,最好绘制两个相邻的不对称中心,使它们与单键连接,但是每个构型显示不同。

 

04
不要仅仅为了显示而使用立体键

05
所有的糖和它们的衍生物都应该用立体键画出来

四、显氢(Explicit Hydrogens)

进行NMR谱图预测的时候,除在某些特殊情况外,不要使用显式绘制的氢(显氢)。

使用显氢的例子 


01
定义稠合环中稠合原子的构型

02
避免一个接一个地绘制立体键

03
在H&CNMR Predictor中使用神经网络算法时
五、盐型化合物

为了更准确地对盐型化合物进行NMR谱图预测,如苯胺盐酸盐或钠苯甲酸酯,结构必须以离子形式绘制。具有中性组件和盐组分间的共价键绘制方式会使得预测精度降低。

 

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