德意志第二帝国时期，各邦和帝国之间虽然也有矛盾，但没有爆发过军事上的冲突。 德意志第二帝国是一种联邦制与中央集权制的混合体，表现为一种松散的联邦制。各邦君主是国家主权的共同享有者，仅仅在国际交往中皇帝才是德国的唯一代表。但事实上，各邦国在对待外国的关系上仍然保留派遣和接受使节的权利，比如巴伐利亚，直到1918年还在奥匈，法国，梵蒂冈派驻自己的外交代表机构。帝国成立时威廉一世试图使用“Kaiser von Deutschland（德国的皇帝）”这一称号，但由于这一称号含有对其他邦国拥有主权的意思而被巴伐利亚和符腾堡拒绝，最终改为只具有民族意义的称号“Deutscher Kaiser（德意志皇帝）”。
第二帝国的陆军由主要邦国的陆军拼凑而来，巴伐利亚的军队只有在战时才听从皇帝的命令，和平时期皇帝只有权视察巴伐利亚的要塞和培训军队的工作。另外，一些军事机构也属于各邦，比如总参谋部，它的真名叫做“普鲁士总参谋部”，巴伐利亚，符腾堡，萨克森都保留有各自的陆军部。普鲁士国王就是帝国皇帝，帝国宰相除了两次短暂的中断外（1873、1892—1894），一般都由普鲁士首相担任。在帝国中，普鲁士几乎享有绝对的话语权，联邦议会中的58席，普鲁士占有了17席，第二大邦巴伐利亚占有6席，萨克森占有4席、符腾堡占有4席，其余二十来个小邦和自治城市只有一两席。只需14票，就可否决议案。所以联邦参议院中从未出现过中等邦国反对普鲁士的联合阵线，普鲁士只是在从属问题，比如帝国最高法院地址，电力税这类问题上被多数票击败。
在帝国成立的前25年内，帝国的内政政策都是由普鲁士策划的，最重要的帝国法律草案也都是由普鲁士的相关部门制定。 尽管德意志帝国不是全体德意志人的德意志，只是普鲁士霍亨索伦王朝的德意志（甚至关于俾斯麦是否想过要统一德意志，都是一个有争议的问题）。但普鲁士是除奥地利外德意志最强邦国，又在前两次王朝战争中获得了石勒苏益格、荷尔施泰因、汉诺威、法兰克福等地区，作为帝国最大的邦国，从帝国最东部横贯到最西部，在帝国中居于领导地位。甚至一些小邦完全被普鲁士包围。虽然几个较大的邦国在德意志帝国中俨然几个半独立的国家，但没有一个邦国有足够的力量和普鲁士对抗，这也就杜绝了邦国和帝国之间爆发军事冲突的可能性。
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