艰难梭菌患儿的粪便移植可持续降低抗生素耐药性和潜在的病原体负担

粪菌移植背景

粪便微生物群移植 (FMT) 可治疗艰难梭菌感染 (CDI)。关于 FMT 儿科接受者中发生的抗菌素耐药性 (AMR) 基因和潜在病原体负担的变化知之甚少。

粪菌移植目标

调查儿童 FMT 的 AMR 基因、潜在病原体、物种和功能途径的变化。 方法 9 名患有复发性 CDI 的儿童接受了 FMT。FMT 前和 FMT 后纵向收集供体和受者的粪便长达 24 周。进行了鸟枪法宏基因组测序。使用 PathoScope 2.0 分析读数。

粪菌移植结果

所有儿童都有 CDI 的分辨率。FMT后AMR基因减少（P<0.001），多药耐药基因持续减少（P <0.001）。FMT后四环素抗性基因增加（P <0.001）。在捐赠者和接受者中发现的潜在病原体水平非常低，在 FMT 后总体下降（P <0.001）。普雷沃氏菌属 109 在 FMT 后的所有受者中扩大，没有受者有任何临床感染。FMT 前受者与供者相比，α 多样性较低（P <0.001），而 FMT 后则持续增加（P ≤0.002）。FMT 前后受者样本的 Beta 多样性显着不同（P<0.001)。细菌种类Faecalibacterium prausnitzii和Bacteroides ovatus在 FMT 后的扩增中在供体中的丰度高于受体（分别为P = 0.008 和P = 0.040）。生物合成途径在供体中占主导地位，在 FMT 后受体中增加。

粪菌移植结论

儿童 CDI 的 FMT 可减少 AMR 基因和潜在病原体，并改变微生物群的组成和功能。然而，在 FMT 后获得某些 AMR 基因以及在供体中发现的低水平潜在病原体表明，在 FMT 之前使用宏基因组测序筛选供体方面需要进一步研究。 本文的全文可以通过下面的来源信息访问。富玛特粪菌移植（fmt0019）。