NTFS、FAT 和 FAT32 都是文件系统的类型
文件分配表 (FAT)
MS-DOS 和其他基于 Windows 的操作系统用来组织和管理文件的文件系统。当您通过使用 FAT 或 FAT32 文件系统格式卷时，文件分配表 (FAT) 是 Windows 创建的数据结构。Windows 在 FAT 中存储关于每个文件的信息，这样它就可以在以后检索文件。其最大分区容量不能超过2GB。 FAT16分区创建的越大，磁盘上每个簇的容量也越大，从而造成的浪费也越大。所以，为了解决这个问题，微软推出了一种全新的磁盘分区格式FAT32，并在Windows 95 OSR2及以后的Windows 版本中提供支持。
FAT32
文件分配表 (FAT) 文件系统的派生文件系统。与FAT16相比，大大减少了磁盘空间的浪费，这就提高了磁盘的利用率。其缺点、：1)当分区小于512MB时，Fat32不会发生作用。 2)分区不能大于32GB。 3)单个文件不能大于4GB。
NTFS 文件系统
NTFS是随着Windows NT操作系统而产生的，并随着Windows NT4跨入主力分区格式的行列，它的优点是安全性和稳定性极其出色，在使用中不易产生产生文件碎片，NTFS分区对用户权限作出了非常严格的限制，每个用户都只能按着系统赋予的权限进行操作，任何试图越权的操作都将被系统禁止，同时它还提供了容错结构日志，可以将用户的操作全部记录下来，从而保护了系统的安全。但是，NTFS分区格式的兼容性不好，特别是对使用很广泛的Windows 98 SE/Windows ME系统，它们还需借助第三方软件才能对NTFS分区进行操作，Windows 2000，Windows XP基于NT技术，提供完善的NTFS分区格式的支持。 而且提供更大硬盘分区的支持
