清标程序一般在电子标项目、公路项目评审中使用，目前关于清标的时间结点和重点内容尚无明确的国家层面的法律规定，《中华人民共和国招标投标法》、《中华人民共和国招标投标法实施条例》、《中华人民共和国政府采购法》、《中华人民共和国政府采购法实施条例》对清标工作没有提及。个别地方法规和部门规章对清标有所涉及，近期政府采购项目的电子辅助评标系统的逐步使用，清标工作被越来越广泛的运用。由于没有国家层面的法律规定，各地方、各系统的清标程序、清标内容不尽相同，综合分为以下六种情况，现详细分析他们的实用性、合规性。
（1）先进行资格审查，再先进行清标，再进行符合性评审，对清标时发现的重大偏差，出具无效标说明，符合性性评审汇总表对以上无效标企业进行了不通过处理。这是清标工作最合理最佳的程序。
《山东省房屋建筑和市政基础设施工程施工工程量清单计价招标投标暂行规定》第二十六条规定，“评标按照下列程序进行：（一）实行资格后审的，对投标人进行资格审查；（二）组建评标委员会；（三）评标准备及清标；（四）初步评审；（五）详细评审；（六）推荐中标候选人，撰写评标报告。”第二十九条,“清标工作的主要内容：（一）按照投标总价的高低或者招标文件规定的其他方法，对投标文件进行排序；（二）按照招标文件规定的方法和标准，对投标报价进行换算；（三）对投标报价进行校核，列出投标文件存在的算术计算错误；（四）根据招标文件规定的标准，对投标报价进行比较、审查，并列出过高和过低的投标价格；（五）形成书面的清标情况报告。”第三十条，“清标情况报告应当包括以下内容：（一）对投标报价进行换算的依据和换算结果；（二）投标文件存在的算术计算错误和修正结果；（三）列出投标价格过高或者过低的清单项目的序号、项目编码、项目名称、项目特征、工程内容；（四）在清标过程中发现的其他问题。”
从以上规定来看，山东省房屋建筑和市政基础设施工程施工工程量清单计价招标的项目评标，使用资格后审的应首先进行资格审查，然后对资格审查合格投标人再进行清标工作，清标的主要内容是报价部分。
《山东省房屋建筑和市政基础设施工程施工工程量清单计价招标投标暂行规定》第三十一条初步评审阶段，评标委员会应当按照下列程序，对投标文件的内容进行初步评审。（一）听取招标人或者招标人委托的招标代理机构的工作人员对招标工程项目的情况介绍，阅读、研究招标文件和清标工作组提交的情况报告，获取评标所需的重要信息和数据，了解和熟悉评标的要求；（二）核对并确认清标情况报告对投标价格进行换算的依据和结果；（三）核对并确认清标情况报告提出的投标文件算术计算错误的修正方法、标准和结果；（四）根据招标文件的规定，列出投标文件在符合性、响应性和技术方法、技术措施、技术标准等方面存在的所有偏差，并确认重大偏差、细微偏差和对细微偏差进行补正的方法和标准；
（五）对算术计算错误的修正、细微偏差的补正及投标文件中其他含义不明确、对同类问题表述不一致的内容，向投标人提出书面澄清、说明或者补正要求；（六）分析投标人对澄清、说明或者补正要求所作的书面材料，并予以认定；（七）对过低投标报价的投标人提出书面澄清要求，分析其做出的书面说明和提供的相关证明材料，并认定其投标报价是否低于成本；（八）评标委员会形成初步评审结论。依据本条规定，在初步评审阶段确认重大偏差，对不符合招标文件要求有重大偏差的做无效标处理，然后再对其他合格投标人进行详细评审。
适用以上类似法理招标的基本工作流程是开标；资格审查；评标准备及清标；初步评审；详细评审；推荐中标候选人，撰写评标报告。
(2)电子标项目，先进行清标，清标时有重大偏差的，出具了无效标说明，无需再进行资格评审，符合性评审。这是最不合规的程序。
清标工作的主要内容，一是偏差审查，对照招标文件，查看投标人的投标文件是否完全响应招标文件；二是符合性审查，对投标文件中是否存在更改招标文件中实质性内容进行审查；三是合理价分析，对工程量大的单价和单价过高于或过低的项目进行重点审查；四是计算错误审查，对投标文件的报价是否存在算术性错误进行审查，然后对算术性错误的复核与整理、不平衡报价的分析与整理、错项、漏项、多项的核查与整理；综合单价、取费标准合理性分析和整理；投标报价的合理性分析和全面性分析与整理，投标文件中含义不明确、对同一问题表述不一致、明显的文字错误的核查与整理，有重大偏差的，出具了无效标说明，对无效标企业不再进行资格评审，符合性评审，这样的做法快速高效，极大的提高了评标效率，特别是使用电子标的项目，清标工作是计算机软件自动筛查，省了不少人力劳动，电子清标是把以前经济评委人眼查看各家标书是否有错误的过程用计算机代替，同时也是为更快更准的完成评标工作。清标不能代替评标，在清标阶段做无效标的企业，还应进行评标阶段的确认。
（3）电子标项目，先进行清标，清标时对重大偏差的，出具了无效标说明，，资格评审汇总表对无效标企业进行了不通过处理，符合性性评审汇总表未体现以上无效标企业。如果清标内容是资格不合格的，这也是比较合规的程序；如果清标内容是不是资格不合格的，这个程序就有原则性错误。
（4）电子标项目，先进行清标，清标时对重大偏差出具了无效标说明，资格评审表对无效标企业进行了通过处理，符合性性评审汇总表对以上无效标企业进行了不通过处理。如果清标内容是资格不合格的，这个程序有原则性错误；如果清标内容是不是资格合格的，这个程序是比较合规的。
（5）在评标委员会评标后，对投标文件进行清标，这是无意义的，也是不符合国家大法的。
有的地方实行的是标后清标，招标人可以在评标委员会评标后，组织本单位或社会专业人员对投标文件进行清标，并向定标委员会或招标人提交清标报告。评标委员会评标后表明招投标已经完成，双方就要按照招投标文件签订合同，并按照合同履行。如果清标再出现偏高或者偏低，可能是招标文件和评标工作没有做好。评标委员会评标后必须要对中标结果进行公示，在公示期内，招投标相关当事人对相关问题可以提出异议或投诉，如果以清标处理这些事情，合理性和合规性和合法性值得怀疑。
（6）电子标项目，先进行清标，清标时有重大偏差的，只出具清标意见仅供参考，不出具无效标说明，再进行资格评审，符合性评审。这也是比较合规的程序。
《公路工程施工招标评标委员会工作细则》（交公路发[2003]70号）第二章，评标工作的组织与准备，第六条规定，“评标工作应按以下程序进行：（一）组建清标工作组；（二）组建评标委员会；（三）初步评审；（四）详细评审；（五）撰写评标报告。”第七条规定，“清标工作组由招标人选派熟悉招标工作、政治素质高的人员组成，协助评标委员会工作。评标委员会由评标专家和招标人代表共同组成，人数为五人以上单数。其中，评标专家人数不得少于成员总数的三分之二。评标专家按照交通部有关规定从评标专家库中抽取。清标工作组和评标委员会人员的具体数量由招标人视评标工作量确定。”
中价协标准2012年颁发的《建设工程造价咨询成果文件质量标准》第10部分10.2.“全过程造价管理咨询”中对清标工作组成和要求有相关的规定和质量标准。10.2.2“承担全过程造价管理咨询业务的工程造价咨询企业应在开标后、评标前，对投标报价进行分析，编制清标情况报告的成果文件……”
工程量清单招投标的基本流程是开标、清标、评标、定标。所谓清标就是通过采用核对、比较、筛选等方法，对投标文件进行基础性的数据分析和整理工作。找出投标文件中可能存在的疑义或者显著异常的数据，为初步评审以及详细评审中的质疑工作提供基础。
随着电子招标的推进，面对投标人数量比较多、庞大的工程量清单子目分项，评标专家无法在较短的时间里完成对数量、参数、价格过高或者过低的全面分析，采用电子清标大势所趋，特别是在利用技术手段解决弄虚作假、暗箱操作、串通投标、限制排斥潜在投标人等招标投标领域突出问题方面，有着独特优势。
依据法规：
1、《建设工程造价咨询成果文件质量标准》
2、《公路工程施工招标评标委员会工作细则》（交公路发[2003]70号）
3、《山东省房屋建筑和市政基础设施工程施工工程量清单计价招标投标暂行规定》
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