大家好，时间已经来到了10月份，国自然项目上个月放榜了，就又要开始准备下一年的基金申请啦（此处请有幸中标的粉丝自动忽略）。除了根据专家意见对自己的申请书进行调整以外，也需要仔细判断是否需要重新选择课题方向，适当关联热点，并立即开展预实验以初步确定科学假说。在选择热点时需要考虑以下几个方面： （1）热点和我想做的临床问题方向/科学问题有关吗？这个不用多说，申请过基金的小伙伴都知道，硬凑热点没有好下场（bushi），因此若要选择某个热点，要么后续有数据支撑，要么有文献支持，切忌毫无逻辑地拉郎配，毕竟强扭的瓜不甜。 （2）这个热点以我的工作条件能做吗？当然大部分热点对技术或设备的要求并没有那么高，但不排除有一些非常前沿的热点需要比较优越的硬件条件，比如相分离、空间单细胞组学、染色质结构相关方向等。 （3）这个热点的热度会不会过高？这里需要考虑的是会不会出现由于热点“过热”而扎堆申请的情况，这样的热点往往升温快，降温更快，比如前几年的ceRNA机制就是惨痛的教训。判断一个热点是否会“过热”，一方面可以看看该热点的进入门槛是否很低，另一方面也可以通过该热点往年中标数来评估。像“衰老”这样的热点，在近几年的中标数保持稳定，每年略有增长，说明趋势比较平稳，热度应该还能持续一段时间。
（衰老主题的历年国自然中标项目数统计。图片来源：网络）
因此今天花博就接着上次的主题，和大家聊一聊衰老的课题具体应该怎样切入和设计。
有小伙伴问，我的研究方向不是年龄依赖的疾病，也可以关联细胞衰老的表型吗？答案是有可能。让我们来看一看KEGG上细胞衰老的通路，从下图可以发现，细胞衰老的诱导因素除了常见的端粒缩短、致癌/氧化应激、电离辐射等造成的DNA损伤外（绿框），实际上还有（衰老相关分泌表型SASP包含的）TGFβ、雷帕霉素、压力引起的钙离子失衡，这些都可以关联到下游的SMAD、mTOR、内质网/线粒体钙信号通路，对应纤维化、能量代谢相关、内质网/线粒体异常相关的疾病，还可以结合自噬、糖酵解等其它热点。除了雷帕霉素，还有一些其它可以造成DNA损伤的药物同样能诱导衰老，因此药物副作用也是想要做衰老相关研究的比较好的临床切入点。
（KEGG细胞衰老通路图）
如果自己做的临床方向比较广，又对衰老相关表型比较感兴趣，那么可以根据以上衰老通路挑选临床问题，比如刚才所说的纤维化、肿瘤放化疗、药物治疗相关副作用、钙离子失调相关的疾病（最常见的是神经系统疾病，比如癫痫、偏头痛等）。如果自己已经确定要做的临床方向，那么比较好的方式是先查询是否有和自己疾病以及细胞衰老相关的数据，进行简单的生信分析后选择合适的目标分子和通路。这里为大家推荐一个国内比较好用的衰老数据库：Ageing Atlas。该数据库整合了衰老相关的转录组、表观遗传修饰组、单细胞转录组、蛋白组、代谢组、药物基因组、CRISPR/Cas9筛选等数据，可以根据不同需要选择相应组学，查看是否有对应的数据集，也可以直接输入感兴趣的基因名搜索衰老相关数据，数据量大，且可以获得多种组学数据进行综合比较，界面操作也十分友好。
（Aging Atlas数据库链接：Aging Atlas (cncb.ac.cn)）
如果自己已经积累一定的前期基础，有确定的临床问题和生信分析结果，只是想要挖掘一下不同热点表型是否能够融入到自己的课题中，那么最简单的方法就是返回去看一下生信分析中的通路富集结果，是否有上文提到的KEGG通路。如果没有的话也不用着急，可以在差异表达基因列表中搜索是否含有p21WAF1/CIP1（CDKN1A）、p16INK4a（CDKN2A）这样的衰老标志物，或是大量的细胞因子、趋化因子（代表SASP），再尝试通过实验方法明确。
一旦在数据中看到有细胞衰老表型的“苗头”，就可以通过简单的实验验证进一步确定。具体可以利用临床样本进行衰老表型检测（详见上一篇推文），然后选定发生衰老的细胞类群。
一般细胞衰老表型的课题设计思路有两种：
第一种是已知衰老在某种疾病中具有关键作用，研究重点放在某种因素或机制引起XX细胞的衰老，这种思路多见于年龄相关的疾病。
第二种是衰老对于疾病的影响未知，研究重点放在衰老产生的效应引起XX细胞XX表型，从而介导疾病的发展。这种思路通常与SASP挂钩，主要机制是SASP中的某因子通过某通路介导XX细胞的XX表型。
当然，这两种思路也可能出现在同一种疾病方向，最典型的就是肿瘤。按第一种思路就是XX因子通过促进肿瘤细胞衰老抑制XX癌增殖，按第二种思路就是肿瘤细胞衰老分泌的SASP通过XX因子促进T细胞耗竭。（以上均为举例，不代表实际情况）
大家可以根据自己的实际情况来搭建细胞衰老表型相关的课题思路，但是最重要的还是通过实验验证自己提出的假设，并不断调整优化，获得兼具创新性和可行性的科学假说。
如果对今天的内容有什么想法，欢迎在留言区讨论哦！
联系客服
