汇总分析pubmed查询结果的免费工具

现在对PubMed查询结果进行汇总分析的工具有很多，有不少分析工具是收费的，现在向大家介绍一个免费分析的工具——PubReMiner（或许有些人用过这个工具），其不仅可以对PubMed的查询结果进行高效率的汇总分析，还会对分析结果按照年份、期刊、作者、关键字、文献类型等分类分析。

 

1. 首先进入https://hgserver2.amc.nl/cgi-bin/miner/miner2.cgi网站，如下界面，输入检索关键字或者pubmed的高级检索式，根据需要修改出版日期，同时一定要将Abstractlimit设为10000，才可以进行检索。

 

 

2. 有些关键字如cancer检索结果会出现以下情况，这个时候得先修改出版日期，可改为最近三个月或者更短时间（这不会影响到检索结果，因为有助于筛查出更适合自己的期刊），同时一定要将Abstractlimit设为10000，重新检索；

 

 

3. 关键字"circRNA" or "circular RNA"的检索结果：按年份、期刊、作者、涉及关键字、主题词和文献类型等分类，“#”指的是对应项目的文献数量；同时我们也可以对右上角的选项勾选，选择展示的内容；根据关键字检索，可以看到2016年到2018年circRNA相关文献发表数量递增；可以看到自己想投的期刊出版有关circRNA研究的情况；

 

 

 

4. 我们可以对不同期刊的出版数量进行统计分析，选择适合投的期刊，例如其中高分期刊Nucleic Acids Res发表有关circRNA研究数量为40篇，点击蓝色的“P”，可以链接到pubmed的检索结果，但是这个链接需要在此基础上加上("circRNA" or "circular RNA")一起检索，才可以看到该期刊发表过的有关circRNA的研究；

 

 

5. 对于author分类项，点击作者那栏的“P”后，也可以链接到pubmed，再加上（"circRNA" or "circular RNA")一起检索，可以发现对应作者发表的具体文章，但有个缺点就是作者不一定就是文章的通讯作者或者第一作者。

 

 

 

6. 通过分析检索结果中的word和Mesh，我们也可以发现circRNA研究涉及的内容和研究方向，可以为研究人员提供一定课题方向和思路；同时可以对不同的文献类型的数量进行统计。

 

 

总结: PubReMiner这个汇总分析网站不仅可以对pubmed的检索结果进行初步过滤和分类汇总，更重要的方面还在于为研究者提供研究趋势的预测，根据年份汇总结果分析文章发表趋势，根据期刊文章发表数量预测投刊的命中率，根据发表文章涉及的关键字可以预测研究热点，根据作者发表文章的结果了解该研究领域的大牛，有一定的辅助功能，有兴趣的同学可以了解一下。