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环状RNA(circRNA)研究经典案例

近年来,环状RNA以其新奇的功能迅速成为一线科研工作者的新宠,而且关注度是越演越热。但,我敢说目前大多数人对环状RNA的研究思路还不是很明朗,难以定下完美的解决方案。因为能供我们参考的文献和资料实在是太少了。不过,少并不代表没有。

今天小编就跟大家分享一篇最新发表在《EUR HEART J》(IF:15)上的关于环状RNA功能研究的文献(A circular RNA protects the heart from pathological hypertrophy and heart failure by targeting miR-223),文中几乎涵盖了研究环状RNA吸附miRNA相关的所有实验,个人认为非常值得参考学习!

●我们先看下研究背景:

●看来,作者将研究方向定在了近年来非常火爆的非编码RNA,接下来我们看看作者是如何一步步展开这个玄幻的故事的:

●很明显,作者幸运的挑到了miR-223(不得不说芯片结果挑选是一件令人惆怅的事),那功能到底咋样捏?

动物和细胞上的功能验证都很显著呢(不过这里个人窃以为作者实际操作应该是先验证的细胞水平,再验证的动物模型,至于原因嘛。。我想大家应该都懂的。。)。

●要研究miRNA,接下来自然少不了靶基因:

传统miRNA的研究套路,到这里基本就可以整理数据发表了,但在有环状RNA的世界里,现在才刚刚开始。

●作者通过已有数据库再次幸运的找到了具有miR-223结合位点,且在动物模型中验证了表达水平,真真让人羡慕嫉妒恨。。。

●不过,光有预测结果和验证了表达也还不够,必须有进一步的功能验证:

●Sponge功能非常明确了,回过来看看跟miR-223及其靶基因ARC的关系可靠不:

●既然这么靠谱,那就再看看环状RNA的生物学功能呗:

●到这终于可以松口气了,不得不佩服作者的强大脑洞及实验设计的细致,也很佩服各位看官能跟小编走到这一步!我们再简单看看结论吧:

●最后总结:

该篇文章之所以能赶在了大量同行的前面发表出来(我想目前国内大多数研究环状RNA的科研君应该都还是手揣数据,最多也只是投稿的状态,毕竟要完成这样一套课题即便昼夜不停的赶,没个一两年谈何容易),作者巧在将之前的miRNA研究结果与研究热点环状RNA完美结合,使文章档次大大提高的同时缩短周期,大力的把握住了这个好机会,真的不得不为作者的机智点赞!无论是从文章中的研究方法还是实验结果,都能看出来作者是下了不少工夫的。总的来说,作者这次无论是从战略还是战术来看,都堪称完美。

作者:永诺生物.老秦

来源:广州永诺生物科技有限公司

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