这项研究通过外显子捕获RNA测序(exome capture RNA sequencing)的方法测了2000多肿瘤样本和细胞系,共涉及到肺癌、乳腺癌、肝癌、胰腺癌等10几种肿瘤:
并建立了一个迄今为止最全的多肿瘤circRNA数据库:MiOncoCirc
数据库的网址为:https://nguyenjoshvo.github.io/,我们可以下载分析和挖掘:
由于circRNA的稳定性,可在尿液中检测到:
另外,研究团队还发现了一类circRNA:rt-circRNA(read-through circRNAs)
看到这里,嗅觉敏感的同学可能立马想到这是一个大宝藏了吧!
另外一篇发表在同期cell杂志上的文章:Widespread and Functional RNA Circularization in Localized Prostate Cancer.Cell. 2019 Feb 7;176(4):831-843.e22. doi: 10.1016/j.cell.2019.01.025.
在这项研究中,对144例局限性前列腺癌(Localized Prostate Cancer)中circRNA的表达、功能、对细胞增殖的必要性(essentiality)进行了研究:
从融合基因(Fusion Genes)与局限性前列癌进展:
从circRNA的表达丰度用于肿瘤分型等角度进行研究:
另外,研究团队还挑选2000条表达丰度最高的circRNA通过shRNA进行干扰,并研究其对前列腺癌细胞增殖的影响:
并选取circCSNK1G3对其功能和吸附miR-181b/d 的机制进行探索:
好了,两篇文章就简单介绍到这里。
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