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流式实验中的坑,我都帮你踩过了-第二坑

病例介绍

CytoFlex 2L6C的仪器,客户反馈做小鼠脾脏细胞检测,预实验发现PE和PC5通道的补偿怎么也调节不好。当把PE,PC5通道单染管按顺序调节成“横平竖直”了,回头发现PE单染管的某些通道补偿又明显不对了。PE-CD19,Percp-cy5.5-CD45.

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PE单染管(图一):

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Percp-cy5.5单染管(图二):

03

回头再看PE单染管(图三):

小贝问诊答疑

要来原始数据分析发现,制备的样本空白细胞管都有“阳性信号”,荧光通道组合会有对角线火箭峰细胞存在。如图四箭头部分。

PE-CD19单染管,明显多出来一群细胞,B细胞的特点明显不会有类似弱阳,强阳两群存在,而且看起来像强阳的那一群不像是目的细胞。(图五中绿颜色细胞)。

询问客户仪器质控及清洗情况了解到,已经好久没有做过质控,每次开机做实验会走清洗流程,但也好久没做过深度清洗,仪器平时做周期凋亡实验多。

04

空白管(图四):

05

PE单染管(图五)

小贝处方

对角线火箭峰细胞,可能是样本制备过程中本身产生的死细胞,死细胞会有很强的自发荧光,会有一种表现就像很多荧光通道组合会有对角线细胞。建议改善样本制备的过程。

也可能是由于仪器管路不干净,因为经常会做有PI染料的实验,PI染料粘性大,不好清洗,清洗不够会使管路比较脏,可能是管路里的脏细胞又被带出来。当以绿颜色细胞为基准调成“横平竖直”时,某些通道就过补偿了。

解决方法:让客户好好清洗仪器,做质控,确保仪器状态ok情况下,再重复实验看看结果怎样。经后续反馈,问题解决。

思维发散区

为了获得好的数据结果我们肯定需要在前期样本制备环节多做功夫,但如果有些样本自发荧光特别强,我们可以在哪些方面做改进呢?

大家可以根据自己所学流式知识思考一下,欢迎大家填表问答,我们将送出“解压神器“,答案下期公布。

点击填表问答

还记得上期问题吗?

点击回顾上期内容

文末福利 | 流式实验中的坑,我都帮你踩过了—第一坑

“为什么GFP强荧光的那群细胞群体,却是散射光图中SSC比较大的那群被P1门漏圈的细胞呢?”

答案:

从我们流式的角度思考这个问题的话,我们知道FSC代表前向散射光,主要反应细胞的大小,细胞越大,则FSC信号越强,而SSC代表侧向散射光,主要反应细胞的颗粒度,细胞内部越复杂,则SSC信号越强,上一期的案例中该老师的细胞转染了含GFP荧光的病毒,这些病毒颗粒被成功转染进细胞后,其实我们可以理解为细胞内部的颗粒度提高了,因此该细胞被检测时则SSC信号明显曾强,也就是原文中描述的点,当然大家可以有其他观点,本次解析仅供参考,不是标准答案,谢谢大家的关注!


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