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Caspase酶抑制剂,可逆不可逆?
什么是胱天蛋白酶?
胱天蛋白酶(Caspases)是含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶,它们是为细胞凋亡的主要介质。多种受体,例如TNF-α 受体,FasL受体,TLR和死亡受体,以及Bcl-2和凋亡抑制剂(IAP)蛋白家族参与并调节该caspase依赖性凋亡途径。一旦Caspase受到上游信号(外部或内在)刺激被激活,即会参与执行下游蛋白底物的水解作用,并触发一系列事件,导致细胞分解,死亡,吞噬作用和细胞碎片的清除。
人Caspases酶
人的Caspases家族基于序列相似性和生物学功能等共性主要可分为三大类:类由具有长胱天蛋白酶募集结构域的“炎症”胱天蛋白酶组成,他们对P4位上的较大的芳香族或疏水性残基具有亲和力。第二类由具有短的前体结构域的“细胞凋亡效应”胱天蛋白酶组成,而第三类由具有长的前提结构域的Pap位置具有亮氨酸或缬氨酸底物亲和力的“凋亡引发剂”胱天蛋白酶组成(表1)。
表1. 人胱天蛋白酶的功能分类:
细胞死亡途径
半胱天冬酶类型
酵素
物种
细胞凋亡
启动器
Caspases 2
人与鼠
细胞凋亡
启动器
Caspases 8
人与鼠
细胞凋亡
启动器
Caspases 9
人与鼠
细胞凋亡
启动器
Caspases 10
人的
细胞凋亡
效应器
Caspases 3
人与鼠
细胞凋亡
效应器
Caspases 6
人与鼠
细胞凋亡
效应器
Caspases 6
人与鼠
细胞焦亡
炎性的
Caspases 1
人与鼠
细胞焦亡
炎性的
Caspases 4
人的
细胞焦亡
炎性的
Caspases 5
人的
启动器Caspase和效应器Caspase酶
根据其在凋亡胱天蛋白酶途径中的作用,胱天蛋白酶可分为两类:启动器和效应器Caspase酶。启动器和效应器Caspas酶都具有由小亚基和大亚基组成的催化位点,Caspase酶的识别位
凋亡启动器Caspase酶,例如caspase-2,-8,-9和-10可以启动caspase激活级联反应。Caspase-8对于形成死亡诱导信号复合物(DISC)是必不可少的,并且在激活后,Caspase-8激活下游效应子Caspase(例如Caspase 3)并介导线粒体中细胞色素c的释放。Caspase-8已被证明对IETD肽序列具有相对较高的底物选择性。凋亡效应胱天蛋白酶例如Caspase-3,-6和-7虽然不负责启动级联途径,但是当被激活时,它们在级联的中间和后续步骤中起着不可或缺的作用。Caspase-3(CPP32 / apopain)是关键效应器,因为它放大了来自启动器Caspase的信号,使用对Caspase-3有选择性的DEVD肽序列对活化的Caspase-3进行检测,可以检测Caspase-3的活性。
Caspase酶底物和抑制剂
Caspase底物和抑制剂由两个关键成分组成:Caspase识别序列和信号产生或蛋白酶抑制基序。不同Caspase识别序列不同,一般由三个或四个氨基酸组成(表2)。Caspase酶识别序列的N端通常有乙酰基(Ac)或碳苯甲氧基(Z)基团修饰,以增强膜的通透性。对应的Caspase识别特定的肽序列为其酶促反应切割位点,释放产生信号或抑制信号的基序。Caspase的显色和荧光底物均以相似的方式起作用,其中底物的信号或颜色强度与蛋白水解活性成正比。
表2. Caspase的底物及其序列
多肽
氨基酸序列
对应的Caspase的种类
IETD
Ile-Glu-Thr-Asp
Caspase 8,颗粒酶B
DEVD
Asp-Glu-Val-Asp
Caspase 3、6、7、8或10
LEHD
Leu-Glu-His-Asp
Caspase 9
VAD
Val-Ala-Asp
Caspase 1、2、3、6、8、9或10
Caspase酶的显色底物
Caspase的显色底物是有Caspase识别序列及生色基团组成,常见的生色团有pNA(对硝基苯胺或4-硝基苯胺),可使用酶标仪或分光光度计在405 nm处进行光密度检测。
表3. Caspase的显色底物
底物
Caspase
吸收(nm)
颜色
Ac-DEVD-pNA * CAS 189950-66-1 *
半胱天冬酶3
405 nm
黄色
Z-DEVD-pNA
半胱天冬酶3
405 nm
黄色
Z-IETD-pNA * CAS 219138-21-3 *
半胱天冬酶8,颗粒酶B
405 nm
黄色
Caspase的荧光底物
Caspase的荧光底物的结构包含与半胱天冬酶识别相关的荧光团,例如7-氨基-4-甲基香豆素(AMC),7-氨基-4-三氟甲基香豆素(AFC), Rhodamine 110(R110)或ProRed™620。R110的Caspase底物比基于香豆素的Caspase底物(例如AMC和AFC)更敏感,但由于两步裂解过程,其动态范围更窄。 建议将R110标记的Caspase底物用于终点法测定,而将AMC和AFC标记的 Caspase底物用于动力学测定。
图.从左到右,分别是AMC(7-氨基-4-甲基香豆素),AFC(7-氨基-4-三氟甲基香豆素),Rhodamine 110(R110)和ProRed™620的激发和发射光谱。
表4.荧光半胱天冬酶底物
底物名称
对应的Caspase
Ex(nm)
Em(nm)
ε¹
Φ²
Ac-DEVD-AFC * CAS 201608-14-2 *
半胱天冬酶3、7
376
482
17000
0.53
Ac-DEVD-AMC * CAS 169332-61-0 *
半胱天冬酶3、7
341
441
19000
N / D
Z-DEVD-AFC
半胱天冬酶3、7
376
482
17000
0.53
Z-DEVD-AMC * CAS 1135416-11-3 *
半胱天冬酶3、7
341
441
19000
N / D
Z-DEVD-ProRed™620
半胱天冬酶3、7
532
619
N / D
N / D
(Z-DEVD)2 -R110 * CAS 223538-61-2 *
半胱天冬酶3、7
500
522
80000
N / D
Z-DEVD-ProRed™620
半胱天冬酶3、7
532
619
N / D
N / D
Ac-IETD-AFC * CAS 211990-57-7 *
半胱天冬酶8,颗粒酶B
376
482
17000
0.53
交流电-IETD-AMC
半胱天冬酶8,颗粒酶B
341
441
19000
N / D
Z-IETD-AFC * CAS 219138-02-0 *
半胱天冬酶8,颗粒酶B
376
482
17000
0.53
注意:
1.ε=在其zui大吸收波长处的摩尔消光系数(单位= cm -1M -1)。
2.Φ=水性缓冲液(pH 7.2)中的荧光量子产率。
Caspase抑制剂
Caspase抑制剂能与Caspase的活性位点结合并形成可逆或不可逆的连接,通常,Caspase抑制剂的结构由Caspase识别序列,诸如醛(-CHO)或氟甲基酮(-FMK)的官能团组成。具有醛官能团的胱天蛋白酶抑制剂是可逆的,而具有FMK的抑制剂是不可逆的。半胱天冬酶底物和抑制剂都具有较小的细胞毒性作用,因此,它们是研究半胱天冬酶活性的有用工具。
表5. 可逆和不可逆的Caspase酶抑制剂
抑制剂
Caspase的种类
是否可逆
Ex(nm)
Em(nm)
Ac-DEVD-CHO * CAS 169332-60-9 *
半胱天冬酶3、7
可逆的
--
--
Ac-IETD-CHO * CAS 191338-86-0 *
半胱天冬酶8
可逆的
--
--
mFluor™450-VAD-FMK
半胱天冬酶1,2,3,6,8,9,10
不可逆的
406
445
mFluor™510-VAD-FMK
半胱天冬酶1,2,3,6,8,9,10
不可逆的
412
505
FITC-C6-DEVD-FMK
半胱天冬酶3、7
不可逆的
491
516
FITC-C6-DEVD-FMK
半胱天冬酶3、7
不可逆的
491
516
FITC-C6-LEHD-FMK
半胱天冬酶9
不可逆的
491
516
FITC-C6-LEHD-FMK
半胱天冬酶9
不可逆的
491
516
FAM-VAD-FMK
半胱天冬酶1,2,3,6,8,9,10
不可逆的
493
517
SRB-VAD-FMK [磺胺丁胺B-VAD-FMK]
半胱天冬酶1,2,3,6,8,9,10
不可逆的
559
577
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