很多患者都会问他的疾病是什么原因，这也是医学本身需要解决的重大问题，如果大多数疾病都能找到确切的病因，那么会有很多的疾病被治愈，但事实上绝大多数的疾病并没有具体的病因。
作为不同的医学体系，对病因也有着不同的认识。
中医学认为疾病发生的原因，根本在于机体的内因，外因通过内因而起作用。《素问调经论》：“夫邪之生也，或生于阳，或生于阴，生于阳者，得之风雨寒暑，其生于阴者，得之饮食居处，阴阳喜怒。”这个论述成为后世三因学说的基础。
南宋·陈言撰《三因极一病源论粹》，简称《三因方》。陈氏“三因学说”将病因归为3类，把六淫致病归于外因，七情致病归于内因，不能归入内外病因的一律归于不内外因，使病因学说更加系统化，成为后世论说病因的规范。
三因致病的病因学说其实极为笼统，看似概括了所有的病因，跟现代患者讲的时候难度极大。
比如非常常见的更年期综合征，中医会告诉患者是因为气血失调导致的一系列症状，患者表示自己的症状太多了，头痛、脱发、失眠、月经不调、出汗多，关节痛等等，在中医来看属于内因为主的，患者往往会去看很多科室来找到所谓的“客观原因”。
头痛要做头颅核磁排除脑血管疾病，出汗多要看是不是甲状腺出问题了，失眠、焦虑要看心理咨询门诊看是不是得了抑郁症，关节痛那要看风湿科是不是得了风湿性关节炎，最后往往都是越治疗症状也就越重。很多症状并不是能通过仪器来找到病因的。
中医的病因学经过高度概括后往往像名言一样有着很深的哲学意义。邪气致病的关键，但是也要看正气的强弱。《黄帝内经》中的名言，“正气存内，邪不可干”，这句话不用做过多的解释，正气是什么气，浩然正气，自古正邪不两立，一个满身正气的人，不管在身体上还是心理上也都是更为健康的。
另外一句，“邪之所凑，其气必虚”，为什么有的人容易受到邪气的干扰，是因为他气虚，什么气虚，正气虚。
这非常有中国文化的特色，微言大义。很多中医把上面两句话当做人生格言，不少中医类院校的校园里也有这两句话的石刻，也挺有意思的。
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