2022年6月24日，财政部会计司发布了《关于增值税期末留抵退税政策适用<增值税会计处理规定>有关问题的解读》,对经税务机关核准的允许退还的增值税期末留抵税额、以及缴回的已退还的留抵退税款项，应当通过“应交税费——增值税留抵税额”明细科目进行核算的问题进行了进一步明确。
1、营改增试点当月月初不得抵扣留抵税额
纳入营改增试点当月月初，原增值税一般纳税人应按不得从销售服务、无形资产或不动产的销项税额中抵扣的增值税留抵税额，借记“应交税费——增值税留抵税额”科目，贷记“应交税费——应交增值税(进项税额转出)”科目。
2、待以后期间允许抵扣留抵税额时
待以后期间允许抵扣时，按允许抵扣的金额，借记“应交税费——应交增值税(进项税额)”科目，贷记“应交税费——增值税留抵税额”科目。
根据上述规定，增值税抵扣原理是每月计算出各类销售总的应纳销项税额，再计算本月累计各项可抵扣的进项税额之和，两者之差为本月应纳税额。而且税法只对纳税人适用不同税率或者征收率的，应当分别核算作出规定，并不要求进项税按照不同业务类型分别抵扣。
因此，在税收实务中，除上述营改增前留抵退税额不得抵扣应税服务的要求外，一般不用区分税率是否相同，可以合并一起进行抵扣。
根据《财政部 税务总局 海关总署关于深化增值税改革有关政策的公告》（财政部 税务总局 海关总署公告2019年第39号）规定，自2019年4月1日起，试行增值税期末留抵税额退税制度。
2022年以来，财政部、税务总局先后印发《关于进一步加大增值税期末留抵退税政策实施力度的公告》（财政部 税务总局公告2022年第14号）、《关于进一步加快增值税期末留抵退税政策实施进度的公告》（财政部 税务总局公告2022年第17号）、《关于进一步持续加快增值税期末留抵退税政策实施进度的公告》（财政部 税务总局公告2022年第19号）、《关于扩大全额退还增值税留抵税额政策行业范围的公告》（财政部 税务总局公告2022年第21号）等政策。增值税期末留抵退税政策实施力度进一步加大、实施进度进一步持续加快。
2022年6月24日，财政部会计司发布了《关于增值税期末留抵退税政策适用<增值税会计处理规定>有关问题的解读》,增值税一般纳税人应当根据《增值税会计处理规定》的相关规定对上述增值税期末留抵退税业务进行会计处理，对经税务机关核准的允许退还的增值税期末留抵税额、以及缴回的已退还的留抵退税款项，应当通过“应交税费——增值税留抵税额”明细科目进行核算的问题进行了进一步明确。
1、纳税人在税务机关准予留抵退税时，按税务机关核准允许退还的留抵税额：
借记“应交税费——增值税留抵税额”科目
贷记“应交税费——应交增值税（进项税额转出）”科目；
2、在实际收到留抵退税款项时，按收到留抵退税款项的金额：
借记“银行存款”科目，
贷记“应交税费——增值税留抵税额”科目。
3、纳税人将已退还的留抵退税款项缴回并继续按规定抵扣进项税额时，按缴回留抵退税款项的金额：
借记“应交税费——应交增值税（进项税额）”科目，
贷记“应交税费——增值税留抵税额”科目
同时，缴会留抵退税额：
借记“应交税费——增值税留抵税额”科目
贷记“银行存款”科目
【解读】
增值税留抵税额本质是企业缴纳的尚未抵扣的增值税，实质是属于企业对政府的债权。同时，由于增值税是价外税，税款的缴纳及退回均不会涉及损益调整，通过上述财政部会计司的解读，我们也得知增值税留抵税额的会计核算也不涉及损益，对于企业申请退回的增值税留抵税额，实质是企业债权的收回，并不属于企业的收益。在会计核算上也仅影响资产负债表科目，并不影响企业所得税。
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