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手把手教你用EXCEL做出高大上的GO分类图
小编最近在整理各种转录组数据,悲催的是小编不会编程,这不是难为人吗?不过好在我的excel分析用的还算说得过去,且看我们怎样通过excel画出高逼格的go分类图吧。
首先,我们先了解一下数据结构,GO注释包含三个主要分支,即:生物学过程(Biological Process),分子功能(Molecular Function)和细胞组分(Cellular Component),因此各个公司给出的结果图如下:
大图模式
这样我们就需要整理出二级分类及三级分类数据及每个分类数据的相应基因数(在此以不同的组合为例,想画哪个部分的图,可以随意组合或选择基因整理哦,☺),如下:
大图模式
注意:左侧两列数据格式一定要按照这个格式整理,否则会影响画图。
补充一点,数据统计可以 通过数据透视表实现,或者countif公式实现,若有需要详细了解的,小编可以下次专门给大家介绍数据统计工具。
第二步,画图。
大图模式
初步得到的图真是粗俗不堪,下一步就要进入美化阶段了。
(1)将图片放大到足够显示每个小的go分类,可以看清楚文字;
增加纵坐标标题,“设计”-“添加图表元素”-“轴坐标”-“主要纵坐标轴”,手动输入“Number of genes”;
大图模式
(2)删除图表标题,若需要可以保留,将图例拖至右上角;
大图模式
(3)设置网格线,选择“无线条”;
大图模式
(4)选择所有图表文字,字体“Times New Roman”,字号“10”;
(5)坐标轴设置,选中纵坐标-右键单击,选中“轮廓”,颜色:黑色;选中横坐标-右键单击,选中“轮廓”,颜色:黑色;
大图模式
补充:若想设置纵坐标最大值,可在修改“边界”处的“最大值”,标签数字间隔修改,可在坐标轴选项中的“单位”设置“主要”值。
大图模式
(6)设置坐标轴格式,右键单击,选择“设置坐标轴格式”,设置轴刻度标记。
大图模式
大图模式
(7)设置图片边框,选中图片边框,右键单击,“设置图表区域格式”,边框“实线”,颜色“黑色”。
至此,与初始图片已经有了天壤之别,离文章图片仅差最后一步图片保存了,选中图表,导出为pdf格式。
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