耳穴是耳廓诊断疾病和治疗疾病的特定点。因为耳穴是耳廓皮肤表面与人体脏腑、组织器官与四肢百骸通过经络相互沟通的部位，也是脉气输注的所在，所以耳廓能反映机体生理功能和病理变化的部位均通称为耳穴。
当机体脏腑或组织器官发生病变时，通过经络在耳廓上的相应部位的耳穴就会出现各种阳性反应，望诊有变形、变色、脱屑等，切诊(即触诊)，有结节或压痛敏感点等，闻诊(即听诊)可听到探测仪的病理性发声等，再结合必要的问诊，以了解病情和病史，这种以中医四诊的办法，在了解病情的基础上，再以八纲为指导综合分析归纳，辨析疾病属何脏腑，何经络，何组织器官，辨析疾病的表里阴阳寒热虚实，然后，运用耳穴这种外治法，包括耳穴针刺法、耳穴贴压疗法、耳穴注射疗法和耳穴贴膏疗法等多种方法给予选择的治疗，以达到治疗疾病的目的，这可简而言之为耳穴诊治法。
1.耳穴与经络脏腑的关系。
耳穴与经络脏腑关系密切。早在2100 多年前的《足臂十一脉灸经》和《阴阳十一脉灸经》这两部我国最早的经脉学和灸疗学专著中就记载有与上肢、眼、颊、咽喉相联系的耳脉。之后到《内经》时期对耳与经脉、经络、经筋的关系都有了较详细的记载，如《灵枢邪气脏腑病形》篇记载：“十二经络三百六十五络，其气血皆上注于面而走空窍……其精阳之气，上走于目而为睛，其别气走于而为听”。又如《灵枢.海论篇》记载:“夫十二经脉者、内属肺腑、外络于肢节”。根据《灵枢》记载，十二经脉内属肺腑，外络肢节，经络系统遍布全身，无处不到，其六阳经与六阴经都分别直接或间接与耳相连，正如《灵枢.口问篇》云“耳者，宗脉之所聚也”……因此经络系统把人体各肺腑及组织器官联系成一个有机的整体。
耳穴与经络关系的研究，耳穴与肺腑及组织器官相关性的研究，近代各大专院校基础部、生理教研室、中医研究院、耳针研究所、经络研究所等单位做了大量的工作，大量的资料和实验结果均证明：耳廓与肺腑、耳廓与经络有着密切的关系。
在生理上经络科沟通内外、运行气血、调理阴阳、抗御病邪、保卫机体的作用，在病理状态下，邪气侵入机体的肺腑组织时，经络则是传注病邪反映病候的通路，根据中医“有诸内必形诸外”，在耳廓的特定穴位上回出现阳性反应点，如疼痛敏感，电阻低、导电量高，甚至变形、变色等，这种反应为疾病诊断提供了依据，耳针工作者据此可进行诊断疾病。
根据文学与各肺腑之间不仅存在相关性，而且具有相对的特异性，这种相关性和特异性，正像上面说的那样可在耳穴表现出来，因此，在四诊八纲及中医基本理论指导下，针刺或贴压耳穴可调节相关脏腑和器官功能，改变其病理状态，达到治疗疾病向愈的目的。
2.耳穴与生物全息律的对应关系。
“生物个体是一个大系统，它由许多相对独立的小系统组成。在大系统和小系统之间存在着全息对应关系”。即生物体每一个相对独立的部分是整体的缩影，包含了整个机体的全部信息。张颖清在《全息生物学研究》中称这样的现象为生物全息现象，并称这样的规律为生物全息律。生物全息律是张氏在1973年发现并提出来的。
根据这一理论的深化研究和探索，张氏首先提出了第二掌骨侧诊疗疾病的方法、其他掌骨系统疗法、桡尺骨系统疗法、肱骨系统疗法、胫腓骨系统疗法以及中医已经长期使用了的耳针疗法、面针疗法、足针疗法、鼻针疗法等通属“生物全息疗法”的范畴。
当人体某- -脏腑或某组织器官发生病变时，处于较高级上的与整体具有较高的全息相关度的各全息元的与主体这一部位全息相对应的部位必须也会发生某些可以检测到的病理反应，如出现痛阈降低、电阻降低、变色、变形等病理反应，根据这些反应点(较高级全息元的反应点)，即可诊断疾病。同时如果给这一反应点(较高级全息元的反应点)--个针刺或按压等刺激就可治疗相关机体(其他全息元或主体上全息对应部位)的疾病。
耳穴诊疗法也符合生物全息律诊疗法，所以全息诊疗法给予了耳穴为什么能诊疗疾病的问题-一个圆满的答复。
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