云南是中国生物多样性最丰富的省份之一，也是全球34个物种最丰富且受到威胁最大的生物多样性热点地区之一。云南省典型的自然地理区域、各类有代表性的自然生态系统区域、85%以上的珍稀濒危野生动植物物种的天然集中分布区域、部分具有重大科学文化价值的化石分布区、冰川、火山、温泉等自然遗迹都已建立了自然保护区，基本形成类型比较齐全、布局基本合理、功能相对完善的自然保护区体系。
自然保护区，是指对有代表性的自然生态系统、珍稀濒危野生动植物物种的天然集中分布区、有特殊意义的自然遗迹等保护对象所在的陆地、陆地水体或者海域，依法划出一定面积予以特殊保护和管理的区域。从级别上，自然保护区分为国家级自然保护区和地方级自然保护区；从空间构成上，自然保护区分为核心区、缓冲区和实验区。
截至2017年底，云南省已建立各种类型、不同级别的保护区161处，总面积286.41万公顷，占全省国土面积的7.3%，全省90%的典型生态系统和85%的重要物种得到有效保护，初步建成布局合理、类型齐全的自然保护区网络体系。
数据禾（
databox.store）根据云南省环保厅、林业厅等部门发布的自然保护区名录，以及自然保护区功能区划图，收集截止2018年3月的云南省自然保护区本底资料。在2000国家大地坐标系（CGCS2000）下，基于高分辨率卫星影像，通过图上同名点的地理匹配，以及经纬网格间的误差计算，实现自然保护区功能区划图与卫星影像之间的地理配准。然后，对每个自然保护区的核心区、缓冲区及实验区进行面状要素矢量化。最后，对面状要素进行拓扑检查，修改合格后，完成云南省自然保护区空间分布数据的制作，共计58个自然保护区，其中国家级20个，省级38个。
保护区名称
面积
（公顷）
主要保护对象
类型
始建时间
主管
部门
长江上游珍稀特有鱼类
31713.8
珍稀鱼类及河流生态系统
野生动物
19961001
农业
龙溪－虹口
31000
亚热带山地森林生态系统、大熊猫、珙桐等珍稀动植物
森林生态系统
19930424
林业
白水河
30150
森林生态系统、大熊猫、金丝猴等珍稀野生动植物
森林生态系统
19961231
林业
攀枝花苏铁
1400
攀枝花苏铁等珍稀濒危动植物及其生境
野生植物
19830314
林业
画稿溪
23827
桫椤等珍稀植物及地质遗迹
野生植物
19980112
环保
千佛山
11083
大熊猫、川金丝猴等珍稀野生动物及其栖息地
野生动物
19930828
林业
小寨子沟
44384.7
大熊猫、扭角羚及森林生态系统
野生动物
19790501
林业
王朗
32297
大熊猫、金丝猴等珍稀动物及森林生态系统
野生动物
19630402
林业
雪宝顶
63615
大熊猫、川金丝猴、扭角羚及其生境
野生动物
19930828
林业
米仓山
23400
森林及野生动物
森林生态系统
19990106
林业
唐家河
40000
大熊猫等珍稀野生动物及森林生态系统
野生动物
19781215
林业
黑竹沟
29643
水源涵养林
森林生态系统
19970101
林业
马边大风顶
30164
大熊猫等珍稀野生动物及森林生态系统
野生动物
19781215
林业
长宁竹海
28719
竹类生态系统
森林生态系统
19961001
环保
老君山
3500
四川山鹧鸪及森林生态系统
野生动物
20000229
林业
花萼山
48203.39
森林生态系统及野生动物
森林生态系统
19960101
环保
栗子坪
47940
大熊猫、红豆杉、连香树等珍稀野生动植物及山地森林生态系统
野生动物
20010924
林业
蜂桶寨
39039
大熊猫等珍稀野生动物及森林生态系统
野生动物
19750320
林业
诺水河珍稀水生动物
9220
大鲵及其生境
野生动物
19980110
农业
卧龙
200000
大熊猫等珍稀野生动物及森林生态系统
野生动物
19630402
林业
白河
16204.3
大熊猫、川金丝猴及其栖息地
野生动物
19630402
林业
九寨沟
64297
大熊猫等珍稀野生动物及森林生态系统
野生动物
19781215
林业
小金四姑娘山
56000
野生动物及高山生态系统
野生动物
19950301
环保
南莫且湿地
82834
湖泊、沼泽等高原湿地生态系统
内陆湿地
20020901
林业
若尔盖湿地
166570.6
高寒沼泽湿地及黑颈鹤等野生动物
内陆湿地
19941118
林业
贡嘎山
400000
高山森林生态系统及珍稀动物
森林生态系统
19960301
林业
格西沟
22896.8
四川雉鹑、绿尾虹雉以及大紫胸鹦鹉等珍稀鸟类
野生动物
19951108
林业
察青松多白唇鹿
143682.6
白唇鹿、雪豹等野生动物
野生动物
19951108
林业
长沙贡玛
669800
高寒湿地生态系统和藏野驴、雪豹、野牦牛等珍稀动物
野生动物
19951108
林业
海子山
459161
高寒湿地生态系统及白唇鹿、马麝、藏马鸡等珍稀动物
内陆湿地
19951108
林业
亚丁
145750
森林生态系统、野生动植物、冰川
森林生态系统
19960320
环保
美姑大风顶
50655
大熊猫等珍稀野生动物及森林生态系统
野生动物
19781215
林业
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