陈根：RAS致癌基因突变频率，仅为此前一半

文|陈根

癌症是世界首要死因之一，其特征在于基因组中的突变或其他改变导致细胞生长不受控制。肿瘤可出现数百至数千种突变，但只有少数几个基因对其致瘤能力至关重要，比如TP53、PIK3CA、KMT2C、ARID1A、KMT2D、LRP1B、PTEN、RB1、FAT4、KRAS。

这10个基因每个的突变都能导致20多种不同类型的癌症，其中最厉害的就是TP53基因，其突变导致的癌症超过50种。近日，科学家们开发了一种新方法，重新统计分析了泛癌种中致癌突变基因的频率，结果与此前的认知差距较大。

新方法利用的系统名为ROSETTA（Reclassification Of Sequencing and Epidemiological Tumor Type Annotations），其能够得到各个癌种在所有癌症中的占比。最常见的五种癌症是乳腺癌、前列腺癌、结直肠癌、肺腺癌和恶性黑色素瘤，加起来占50%以上；前十名合计占比达到68.7%。

  在这些癌症中，最常见的致癌突变基因是TP53，35%的新发癌症有它；而被认为最常突变的原癌基因KRAS，只有11%；排名靠前的还有BRAF，占8%。前十名里KMT2C、KMT2D、ARID1A是表观遗传修饰相关基因，可见癌症中表观遗传失调十分常见。

既往的研究普遍显示，RAS致癌基因在所有人类癌症中出现的频率大约在30%-33%，但在新的研究中，这个数字实际上只有15%，仅为此前的一半。

此外，大部分突变基因在两者之间的差距不到5%。腺癌比鳞癌高的仅有KRAS和APC突变频率差距较大（14%vs1%，13%vs5%）；鳞癌比腺癌高的主要有LRP1B（23%vs10%），KMT2D（16%vs7%），FAT1（15%vs5%），CDKN2A（12%vs2%），NOTCH1（10%vs3%）和NEF2L2（10%vs1%）。

  科学家们认为，出现这种现象的原因是许多致癌突变与癌症类型有关，很多癌种发病率较低，因此在该癌种中致癌基因出现频率再高，放到泛癌种中也并不是举足轻重的地位了。

常见突变基因的鉴定对于药物开发起着重要作用，未来，该研究或可为相关药物研发提供一定思路。