陈根：最大规模癌症全基因组分析，发现58个新的突变特征

文/陈根

癌症的发生离不开基因的突变。

在细胞分裂时，突变可能偶然发生，而当细胞产生突变时，这表示人的身体当中的一些健康细胞不再接受身体的指令，并且很有可能已经失控了。突变赋予了突变细胞相对于邻近细胞的某些选择性优势，当其出现在一组基因中时（称为“癌症驱动基因”），其突变形式会影响一系列细胞关键功能的稳态发育。

基于此，追溯突变就成为了解癌细胞诞生的重要途径。毕竟，每种癌症都有数千个突变。如果能够在人体的乳腺、肺部、神经系统等十几个组织器官中鉴定不同的突变特征，就能寻找倒不同癌症类型的患者具有的共性和差异，将常见的突变过程与人群中发生频率较低的罕见突变过程区分开来。

其中，基因组测序又是理解突变的重要技术，基因组测序能够让科学家们更近距离地观察到某些癌症的发展可能性。当前，新一代测序技术（NGS）和计算分析的爆炸性进展，使得探索大多数癌症的突变特征成为可能。尤其是凭借全基因组测序（WGS）方法，可全面探索所有类型的癌症基因改变。

近日，基于10万个基因组项目提供的数据，剑桥大学教授Serena Nik-Zainal于2022年4月21日报告了新的发现。值得注意的是，100,000基因组计划中的12,222个样本数据集，包含每种器官类型的数百个样本，这使得能够检测到存在于每个器官集合中不到1%的稀有特征。而且其癌症全基因组序列数量比之前的主要癌症测序项目加起来的数量还要多。

基于此，研究人员分析了12000多名癌症患者的全基因组序列，揭示出以前未报道的癌症突变特征，包括肿瘤特异性罕见特征。该团队还发现了 58 个新的罕见突变特征，表明对于癌症还有一些我们尚未完全了解的发生原因。此外，这项成果的发现还展示了每种癌症类型中常见与罕见的突变特征，而且还强调了如何利用这些发现来增强个性化的癌症诊断与治疗。

英国基因组学协会的马特·布朗教授接受了剑桥大学的采访，他说：“突变特征是充分使用WGS潜力的一个例子。我们希望利用这项研究中看到的突变线索，并将其应用回我们的患者群体，最终目的是改善癌症患者的诊断和管理。”