《黄帝内经》说：“生之本，本于阴阳”。《易经》整体观对中医主要有三方面影响：
一是《易经》主张天人合一，人与天地，社会相应的整体观成为中医学的指导思想。
二是中医臧象学说源于《易经》，并对天象、物象、人象的关系进行了重大发展。《黄帝内经》的藏象学说把天象、地象、人象做了三合一，并将阴阳五行贯穿其中，是人与天、地相应的整体观的升华。中医臧象的内涵，就是将人这个整体以五脏为中心，联系六腑及体表五官七窍，归类为五个系统，并与天地宇宙大整体密切相关。
《黄帝内经》：“心者，生之本也，神之变也，其华在面，充在血脉，为阳中之阳，通于夏气”。表明了心与神、面、血脉相关并通于夏天，并成为一个臧象整体。臧象整体成为中医主要基础理论，并用于概括人的生理病理。
三是中医运气理论把《易经》强调的人与天、地相应做了重大发展。运气理论是《黄帝内经》对《易经》天人合一观的杰出发挥。运气学说的核心是通过运气气化揭示宇宙气化与人体气化的宏观整体关系，这个关系就是“天道—气化—物候包括病候”的关系。运气气化是连接天道（宇宙运动）与物候之间的枢纽
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