MR-base:高效准确的进行孟德尔随机化研究的网站

通过孟德尔随机化研究，可以基于GWAS的结果来推断不同表型之间的因果关系， 比如使用的很广泛的两样本MR分析

对于暴露因素X和结局变量Y两个表型，以遗传变量G为工具变量，通过各自对应的gwas结果来推断二者的因果关系。

目前gwas的公开结果很多，为了更加高效准确的进行MR分析，科学家们开发了MR-base数据库。该数据库收录了1600多个公开的GWAS结果以及基因，蛋白，代谢物，甲基化等不同水平的eQTL研究结果，同时开发了一个R包TwoSampleMR，并封装成了一个web app, 以方便科研人员，高效的利用这些公共数据集开展两样本的MR(简称2SM)分析, 对应的文章链接如下

https://elifesciences.org/articles/34408

R包的源代码保存在github上, 链接如下

https://github.com/MRCIEU/TwoSampleMR
官网如下
http://www.mrbase.org/

通过官网的web app,可以方便的进行2SMR分析，整个过程分为了以下3步

1. choose exposures

选择暴露因素X对应的gwas结果，可以上传自己的gwas结果，也可以选择公共数据库。如果是自己上传结果，对格式有一定要求，必须有以下几列

1. SNP

2. effect allele

3. beta

4. se

官方的示例文件内容如下

2. choose outcomes

选择结局变量Y对应的gwas结果, 此时只能选择数据库中收录的gwas结果，示意如下

3. Run MR

运行2SMR分析, 调整参数之后，直接点击Perform MR analysis分析即可，结果示意如下

每一行代表一个不同的算法, nsnp代表模型中的SNP数量，b代笔beta, se代表标准误，pval表示p值。同时还提供了异质性和基因多效性偏倚的评估结果。当然也提供了很丰富的可视化结果，部分内容示意如下

如果想要更加灵活的进行分析，也可以直接使用TwoSampleMR这个R包，其使用手册网址如下

https://mrcieu.github.io/TwoSampleMR/

具体用法后续在详细介绍。

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