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Primer Premier 5.0引物设计

PCR引物设计
⑴ 确定PCR产物片段大小
⑵ 确定引物所在区段
⑶ 确定引物序列的长度范围
⑷ 确定引物Tm(melting temperature)值范围

PCR引物设计原则

  • 引物长度以15-30bp为合适的
  • 引物里面的GC含量在40-60%之间是最好的
  • 引物里面的ATCG分布应遵守随机性,避免连续出现4个以上的单一的碱基,尤其在引物的3端不应该出现连续的G/C
  • 引物要求自身不能含有互补序列,否则这个引物自身会形成发夹一样的二级结构,影响PCR作用效果
  • 两个引物之间不应该有多于4个的互补/同源的碱基,否则会形成引物二聚体
  • 引物的3' 端是G/C

Primer Premier 5.0软件设计引物

Primer 设计笔记.jpg
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