据中科博生研究表明,造血干细胞(HSCs)具有独特的基因表达程序,可执行干细胞的身份确定和调节细胞谱系定型。长非编码RNA(lncRNAs)已经成为基因表达和细胞命运决定的重要调节因子,然而它们在造血干细胞中的功能尚不清楚。中科博生。
在这项研究中,研究人员通过深度测序描述了纯化造血干细胞的转录组,并鉴定了323个未加注释的lncRNAs。通过在已分化的细胞谱系中比较它们的表达,发现有159个lncRNAs富集在造血干细胞中,其中一些可能是HSC特异性的(lnchscs)。这些lncRNA基因与蛋白编码基因具有相同的表观遗传特征,包括通过DNA甲基化调控表达,敲除掉两个lncHSCs——lncHSC-1和lncHSC-2,对HSC自我更新和谱系决定具有不同的影响。中科博生。
该研究小组精确找出了其中一个候选lncRNA的基因组结合位点,并发现了关键造血转录因子结合位点的富集,特别是E2A。总而言之,这些结果表明,lncRNAs对调节造血干细胞起着重要的作用,从而为控制HSC功能的遗传通路提供了更多的层面。中科博生。
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