蛋白质组学对生物体内的所有蛋白质进行定性和定量分析。经过近年蛋白质组学技术不断发展,其在生物问题研究和药物研发等多方面都起着非常重要的作用。目前蛋白质组学技术仍面临三个主要挑战:分析速度,蛋白质组覆盖深度,以及定量分析的质量。串联质谱标签(TMT)系统可以在一次实验中对多个样品在全蛋白质组水平同时进行定量分析,是应对以上三个挑战非常有效的策略。TMT标记试剂由氨基反应基团,质量平衡基团,以及报告离子基团组成。每个TMT标签的氨基反应基团的结构式和质量相同,但5个稳定重同位素在不同TMT标签的报告离子基团和质量平衡基团之间的分布不同。被不同TMT标签标记的肽段在质谱一级谱图上有相同的质荷比。经过高能碰撞解离,这些肽段在随后的二级谱图或者三级谱图上产生质量不同的报告离子。这些报告离子实现了对不同样品的准确定量。经过多年的发展,TMT标记试剂从最初的6通道已发展到11通道,但受其结构限制已经无法继续增加通量。2020年3月16日,哈佛大学医学院Steven P. Gygi研究组(李嘉铭博士为第一作者,Joao A. Paulo博士为共同通讯)在Nature Methods上在线发表文章TMTpro reagents: a set of isobaric labeling mass tags enables simultaneous proteome-wide measurements across 16 samples,介绍了新一代串联质谱标签系统TMTpro。TMTpro标记试剂仍然利用了15N和13C之间6 mD的微小质量差,沿用了相同的氨基反应基团,但具有重新设计的质量平衡基团和新的基于脯氨酸的报告离子基团。每个TMTpro标签有9个稳定同位素原子,可以提供最多18通道标记。作者在文章中主要介绍了16通道的TMTpro标记试剂。