Science发表长穗偃麦草基因组

昨天Science上发表了山东农大孔令让团队的最近科研进展，我们有幸邀请到文章的第一作者兼共同通讯作者王宏伟老师给我们带来一作解读“《Science》一作解读∣Fhb7基因水平转移塑造小麦赤霉病抗性”。该成果受到了广泛的赞誉，贾继增研究员对该成果给与了高度评价。

Science昨天也发表了一篇评论

今天我们主要关注这篇文章中的长穗偃麦草基因组部分的结果。

为了组装出一个高质量的基因组，这里采用了多种类型的数据(下图)，加起来达到236倍的覆盖度。

除了上表列出的数据之外，还包括Bionano和Hi-C数据，最终获得了一个质量很好的基因组，相关的统计相关信息如下表所示。

对小麦族物种的直系同源基因分析，推测分化时间为4.77-4.96 Mya间(下图A)。利用单拷贝基因对小麦族物种构建进化树发现，长穗偃麦草与小麦的关系最近(下图A)。基因组共线性分析发现，与小麦基因组具有良好的共线性(下图B)，同时也发现18个大片段的染色体结果变异，均有可靠的证据支持。

One more thing,

在孔老师的支持下，小麦多组学网站同步在线了该基因组资源，欢迎大家使用。该基因组在本网站的名称是Thinopyrum elongatum genome(D-3458)。

1、在线blast 

(http://202.194.139.32/blast/viroblast.php),支持基因组，基因以及蛋白。

2、在线调取序列(http://202.194.139.32/getfasta/),支持基因组、基因和蛋白。

3、JBrowse(http://202.194.139.32/jbrowse-1.12.3-release/?data=Thinopyrum_elongatum)

参考文献

Wang H, Sun S, Ge W, Zhao L, Hou B, Wang K, Lyu Z, Chen L, Xu S, Guo J, Li M, Su P, Li X, Wang G, Bo C, Fang X, Zhuang W, Cheng X, Wu J, Dong L, Chen W, Li W, Xiao G, Zhao J, Hao Y, Xu Y, Gao Y, Liu W, Liu Y, Yin H, Li J, Li X, Zhao Y, Wang X, Ni F, Ma X, Li A, Xu SS, Bai G, Nevo E, Gao C, Ohm H, Kong L (2020) Horizontal Gene Transfer of Fhb7 from Fungus Underlies Fusarium Head Blight Resistance in Wheat. Science:eaba5435    doi: 10.1126/science.aba5435