ZSCI-载体构建：如何将序列文件转化成图谱文件？

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ZSCI

以pEGFP-C1图谱为例，我们在Addgene/Snapgene等网站获取载体序列信息，其中有两大类，一类是序列文件，不过序列文件有弊端是不能直观表现载体元件信息，另外一类是图谱文件，虽然无法编辑不可知位点序列，但是比序列文件的可视化要强很多。所以今天介绍两种如何将序列文件转化成图谱文件的方法给大家。

一、序列文件与图谱文件的区别

序列文件不能直观表现载体元件信息。

图谱无法编辑不可知位点序列。

二、将序列文件转化成图谱文件

1、DNAMAN方法绘制图谱

首先打开DNAMAN软件，选择新建，在新弹出来的对话框中输入序列，同时进行选定；然后再点击通道，在选择菜单栏中的序列加载序列，从选择中进行序列加载，就可以将序列导入到通道中！

点击菜单栏中的酶切位点分析。

再在弹出的页面中进行设置，绘制一个载体图谱中有2个必选项，其中一个是绘制限制图谱，另外一个是设定DNA为环状，这样显示出的就是一个环状的带有酶切位点标记的图谱。

在其他选项中，包括显示剪接、列出酶切位点……再点击下一步。

  这个是提示我们应该选择那些酶，筛选需要使用的酶，然后点击完成。

最后生成图谱，其中上方是酶切位点谱图，下面是序列显示，其中具体在什么位置上，可以用酶将它切开。

  双击图谱，添加元件，点击菜单栏第二项，最后点击New，即是添加一个元件。

  设置添加元件的显示类型、位置、图例，最后点击OK，这里我们添加了2个元件。

添加完成后，可以看到图谱中，除了酶切位点后，还有我们添加的元件，点击右侧菜单，调整谱图中心位点位置，然后拉动图谱缩放，使字体不再重叠。