欢迎来到NHANES和MR系列推文
近年来,临床公共数据库挖掘发文量巨大,其中利用美国健康与营养调查(National Health and Nutrition Examination Survey, NHANES)发表的文章更是层出不穷。
那么如何从中脱颖而出呢?不妨结合同样风头正盛的孟德尔随机化(Mendelian Randomization, MR)方法试试?
本系列推文将通过解读NHANES数据库和MR相关文献,帮助大家拓宽视野,为大家提供一种新的分析思路。
下面为大家分享的是由四川大学华西医院泌尿外科王坤杰教授团队使用NHANES数据库结合MR方法,开展的一项探讨抑郁症与肾结石发生风险关联的研究。
1. NHANES 中抑郁症与肾结石的观察结果
研究最终纳入了24,892名参与者(Supplementary Fig. 1)。
Table 1 按抑郁程度列出了参与者的基线特征。
Table 2 显示了使用多变量调整逻辑回归分析,评估抑郁与肾结石风险之间的关联的结果。与对照组比较,轻度抑郁组无显著相关(OR 1.18, 95 % CI 0.94–1.47, P = 0.155)。然而,中度(OR 1.38, 95 % CI 1.05–1.83, P = 0.022)和严重(OR 1.56, 95 % CI 1.02–2.40, P = 0.040)抑郁组肾结石疾病的风险较高(P for trend = 0.006)。当抑郁评分作为一个连续变量时,结果仍然显著(Table 2)。
2. MR分析中,抑郁症与肾结石的因果关联
从一个 GWAS 荟萃分析中获得抑郁症的遗传工具,有102个与抑郁症相关的SNP满足P < 5 × 且F统计量 ≥10。经过筛选后,在 MR 分析中使用了92个 SNP(Supplementary Fig. 2)。
IVW 分析结果显示,抑郁与肾结石风险升高有因果关系(OR 1.26, 95 % CI 1.04–1.53, P = 0.017) 。使用weighted median、weighted mode和MR-PRESSO方法进行敏感性分析。在weighted median中抑郁与肾结石风险升高的因果关联得到验证(OR 1.34, 95 % CI 1.07–1.69, P = 0.012)。但在weighted mode中无显著相关性(OR 1.42, 95 % CI 0.72–2.80, P = 0.313)。去除outliers后,MR-PRESSO也显示抑郁症增加了肾结石风险(OR 1.31, 95 % CI 1.09–1.58, P = 0.005)(Table 3)。IVW的异质性分析表明存在潜在的 SNP 异质性(P = 0.001)
将全国范围内具有代表性的大型观察性研究 NHANES 和 MR 结合分析,研究发现抑郁症会增加肾结石的风险。这一发现需要在进一步精心设计的前瞻性队列研究中得到验证。此外,还应探讨其潜在机制。
心得体会
本文介绍的这篇文章结合了两种不同的研究方法,即观察性研究和孟德尔随机化分析。除此之外,王坤杰教授团队近三年还发表了2篇相同类型的文章,大家可以进行对比阅读,学习分析思路。 目前将 NHANES 和 MR 进行联合分析的文章较少,且发文量呈逐年上升趋势。大部分文章的影响因子在5分左右,阴性结果也能发,或可一试。 这篇文章在分析上可能还有一些调整的空间。比如 Table 1 中可以对于不同组别的数据进行统计检验计算P 值;Table 2 中可以使用多变量调整逻辑回归调整混杂因素时,建立多个模型;数据允许的情况下,可以使用MR-Egger判断有无水平多效性。
以上就是本次的学习内容啦,感谢观看!如有表述不当之处,欢迎各位小伙伴批评指正~ (●'◡'●)
参考文献: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35691420/
联系客服