真正实现“数据不落地”！在线生物信息分析平台将于年底全面上线

随着生命科学领域研究的深入和技术的发展，科学研究和临床诊断已逐渐向基因水平聚焦，全基因组测序技术已开始成为这些领域重要的研究手段。目前，由上海科技创新资源数据中心研发基于PaaS的在线生物信息分析平台G-Xpert已基本完成，预计于今年年底全面上线。

数据中心首席技术官张嘉锐表示：在线生物信息分析平台将坚持中立的第三方身份，从技术和管理两方面确保用户的数据安全和隐私。数据中心将充分利用现有资源优势，整合相关领域的专家资源，通过部署各领域专家背书的分析流程以及PaaS级别的定向优化，大大降低使用门槛，使科研人员和医务工作者提高研究效率，实现‘数据不落地’的在线协同。”

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据悉，今年疫情期间，数据中心推出的病毒基因组检测服务，就是该生信分析平台的主要功能之一，用户只需上传呼吸道样本的二代测序数据，即可在3小时内检测出是否含有新型冠状病毒。

传统的核酸检测只能覆盖全基因组的很小一部分，无法满足前瞻性科学研究和复杂临床检测的需求。在过去，测序技术受地域限制和分析周期的影响，分析结果的及时性较弱，尤其是对疾病的快速诊断十分不利。中科院上海巴斯德研究所郝沛研究员表示：“病毒检测平台，直接对接人体样本的RNA二代测序原始数据，具有对数据全自动质量控制、拼接和病毒组成分析等功能，实现了包括新型冠状病毒在内的样本快速检测。”

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据后台数据显示，截止2020年5月6日12点，病毒基因组检测平台共向来自上海市公共卫生临床中心、复旦大学、复旦大学附属儿科医院、遵义医科大学等机构的用户提供了224次检测服务，检出了包括Covid-19、Hepatitis B virus、Influenza A virus在内的近10种病毒，该检测服务计划通过迭代和扩展，应用到各级医疗机构的临床和科研工作中。