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《细胞》第16期论文汇总|复制应激损害人胚胎染色体分离和着床前发育+重复元件重组与体细胞复杂性+人基因组的交叉疾病剂量敏感性图谱
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2022.12.05 广东

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On the cover: In this issue, Federici et al. identify a clade(分支) of Klebsiella pneumoniae (Kp) strains to be strongly associated with human inflammatory bowel disease (IBD) and its clinical exacerbation across geography. 发现了一个克雷伯氏肺炎菌(Kp)菌株的分支,与人类炎症性肠病(IBD)及其在地理上的临床恶化密切相关。(封面中,噬菌体特异性抑制选择的微生物群共生体是可视化的流行空间入侵者视频游戏。)
2022年Cell第16期研究论文汇总:
【噬菌体联合疗法靶向抑制 IBD 相关肠道菌群治疗肠道炎症】
【胶质母细胞瘤劫持脑侵袭的神经元机制】
【组织驻留记忆和循环T细胞是手术前癌症免疫疗法的早期反应者】
【SARS-CoV-2杀伤 T 细胞优势表位免疫逃逸的出现】
【人血管紧张素转换酶2与当前流行的 Omicron SARS-CoV-2亚变异体 BA.2和 BA.1.1的高结合亲和力的结构基础】
【小麦蛋白激酶基因的失活赋予对锈菌的广谱抗性】
【HGT在昆虫中广泛存在,并促进了鳞翅目昆虫的雄性求偶行为】
【复制应激损害人胚胎染色体分离和着床前发育】
【整个生物体中的大规模多重嵌合CRISPR介导基因扰动】
【重复元件的重组产生人类基因组中的体细胞复杂性】
【人类基因组的交叉疾病剂量敏感性图谱】
Targeted suppression of human IBD-associated gut microbiota commensals by phage consortia for treatment of intestinal inflammation
【噬菌体联合疗法靶向抑制 IBD 相关肠道菌群治疗肠道炎症】
一种由5种噬菌体组合而成的口服药物成功地靶向细菌病原体肺炎克雷伯菌,以治疗人类炎症性肠病的症状。该研究首次设计了一种噬菌体联合疗法,可以精确地靶向和抑制与炎症性肠病(IBD)相关的肠道细菌。
Combination of phage targets the XXX to treat the symptoms of  bowel disease.
Glioblastoma hijacks neuronal mechanisms for brain invasion
【胶质母细胞瘤劫持脑侵袭的神经元机制】
具有神经元特征(neuronal features)的胶质母细胞瘤细胞促进脑侵袭。该研究发现胶质瘤劫持神经元促进脑内侵袭。
Tissue-resident memory and circulating T cells are early responders to pre-surgical cancer immunotherapy
【组织驻留记忆和循环T细胞是手术前癌症免疫疗法的早期反应者】
口腔癌患者对新辅助免疫检查点阻断反应的免疫细胞动力学分析鉴定了循环和肿瘤浸润 T 细胞亚群中的不同特征,这些特征是对治疗快速反应的基础,并与病理结果相关。
Analysis of 口腔癌患者免疫细胞动力学responding to 新辅助免疫检查点阻断 identifies diverse features in 循环和肿瘤浸润 T 细胞亚群 that underlie rapid response to therapy and correlate with pathological outcome.
备注:在手术前,医生会使用免疫检查点阻断(ICB) 剂作为新佐剂治疗口腔鳞状细胞癌(OSCCs),这比直接做手术的的效果好很多。做手术都是迫不得已,如果不用开刀就可以治好肿瘤,那自然是最好的。
Emergence of immune escape at dominant SARS-CoV-2 killer T cell epitope
【SARS-CoV-2杀伤 T 细胞优势表位免疫逃逸的出现】
对各种 SARS-CoV-2谱系的 CD8 + T 细胞应答的分析确定了病毒穗蛋白的突变,使病毒能够逃避 T 细胞应答。
Analysis of T response to V identifies a mutation in V spike protein that enables the V to escape T responses.
Structural basis of human ACE2 higher binding affinity to currently circulating Omicron SARS-CoV-2 sub-variants BA.2 and BA.1.1
【人血管紧张素转换酶2与当前流行的 Omicron SARS-CoV-2亚变异体 BA.2和 BA.1.1的高结合亲和力的结构基础】
通过对人血管紧张素转换酶 -2(ACE2,SARS-CoV-2病毒进入的受体)和4个 Omicron 亚变异体(BA.1,BA.1.1,BA.2和 BA.3)的受体结合结构域(RBD)的生物化学和结构分析,揭示了亚变异结合亲和力差异的结构基础和RBD突变的影响。该研究发现人血管紧张素转换酶 2 (hACE2) 与四个早期 Omicron 亚变体(BA.1、BA.1.1、BA.2 和 BA.3)的受体结合域 (RBD) 的结合亲和力顺序为 BA.1.1>BA.2>BA.3≈BA.1。
Inactivation of a wheat protein kinase gene confers broad-spectrum resistance to rust fungi
【小麦蛋白激酶基因的失活赋予对锈菌的广谱抗性】
小麦条锈菌是引起小麦条锈病的一种破坏性真菌病原体。在感染后,真菌诱导受体样细胞质激酶 TaPsIPK1,其特异性地与效应子 PsSpg1相互作用。田间试验表明,灭活 TaPsIPK1可以在两年内对锈菌产生广谱抗性,而不会影响农艺性状。
HGT is widespread in insects and contributes to male courtship in lepidopterans
【HGT在昆虫中广泛存在,并促进了鳞翅目昆虫的雄性求偶行为】
从非后生动物来源获得的218种昆虫的基因水平转移(horizontal gene transfer,HGT)事件的综合资源提供了对昆虫基因组中 HGT 的适应的深入了解,发现了基因 LOC105383139在鳞翅目昆虫雄性求偶(courtship)行为中的功能性作用。
Replication stress impairs chromosome segregation and preimplantation development in human embryos
【复制应激损害人胚胎染色体分离和着床前发育】
在人类植入前胚胎中,G2期 DNA 复制导致染色体断裂、节段性非整倍体和胚胎质量差。
Large-scale multiplexed mosaic CRISPR perturbation in the whole organism
【整个生物体中的大规模多重嵌合CRISPR介导基因扰动】
IMAP 是一个多路复用的镶嵌原位基因扰动平台,其能够在整个身体中大规模绘制 Perturb-Atlases 分析基因组功能的图谱,并且能够高通量地衍生单基因扰动小鼠系。
Recombination of repeat elements generates somatic complexity in human genomes
【重复元件的重组产生人类基因组中的体细胞复杂性】
对人类组织样本的大规模分析揭示了广泛存在的重复元件的组织特异性体细胞重组,并有助于支撑人类发展和疾病的基因组多样性。
A cross-disorder dosage sensitivity map of the human genome
【人类基因组的交叉疾病剂量敏感性图谱】
协调来自近100万个体的基因组数据可以深入了解疾病中罕见拷贝数变异的特性以及对所有常染色体蛋白质编码基因的剂量敏感性预测。
往期回顾:(点击每期任意文字可转到详解内容)
2022年Cell第1期共发表6篇研究论文,内容包括:指纹基因的发现、mRNA疫苗功效、艾滋病的预防、细菌生物膜分段时钟的机制、蛋白质折叠校正结构机制、肺癌免疫逃逸机制。
2022年Cell第2期共发表8篇研究论文,内容涉及DNA非依赖的基因编辑技术,单HIV病毒分析,GSDMB不依赖细胞焦亡调节上皮恢复/修复,乳腺癌浸润性转变与进展性有关,皮层细胞类型和功能发育与视觉有关,腹侧嵴髓小脑束神经元控制哺乳动物运动,利用3D的“最小活细胞”模拟细胞内部基本运作,解析酵母核孔复合体的三维结构。
2022年Cell第3期共发表7篇研究论文,有5篇和疫情直接相关,另外两篇关于是微生物,具体内容包括奥密克戎变异株对抗体介导的中和作用具有高度抗药性,mRNA疫苗增强剂诱导的中和免疫,奥密克戎突变体广泛逃离中和抗体反应,德尔塔变异株接种疫苗后的传播能力,肠道微生物聚糖代谢,补体激活新冠病毒导致过度T细胞毒性,基因组结构预测微生物群落代谢动力学。
2022年Cell第4期共发表7篇研究论文,包括镁并调节CD8+T细胞效应功能,新冠mRNA疫苗有效性的关键是滤泡辅助T细胞,真菌配体的物理性质与抗原免疫原性,人血管紧张素转换酶2(ACE2)受体及其复合结构,HIV病毒微结构,哺乳动物中性别典型的社会行为由大脑基因活动的差异决定,泵状光敏感通道蛋白ChRmine通道传导的结构。
2022年Cell第5期共发表9篇研究论文,包括:胞表面的波动调节早期胚胎谱系分选转录因子蛋白质相互作用组揭示心脏病的遗传决定因素GPR35 响应血清素代谢物5-羟基吲哚乙酸 (5-HIAA)促进中性粒细胞募集黏膜真菌通过17型免疫促进肠道屏障功能和社会行为新冠疫苗可诱导针对Omicron变体的强大记忆T细胞免疫效应SARS-CoV-2奥密克戎传染性和免疫逃避的结构和功能特征SARS-CoV-2的突破性感染或会引起强有力、广泛且持久的机体中和抗体反应多种早期因素预示着急性2019冠状病毒疾病后遗症新一代2019冠状病毒疾病疫苗的呼吸道黏膜输送可提供强有力的保护,抵抗原始和变异;
2022年Cell第6期共发表9篇研究论文,包括:
局部热疗诱导白色脂肪褐变并治疗肥胖,泡个热水澡也可减肥啊!合成信号通路可实现细胞群规模调控TFPI是超毒力分支艰难梭菌毒素B肠道隐窝受体两种抗体的组合使用有望治疗多种致命的埃博拉病毒物种。新冠mRNA疫苗可促进有效抗原特异性生发中心反应疫苗接种与SARS-CoV-2感染后产生的抗体不同大部分个体(但并非所有个体)对 SARS 冠状病毒2型奥密克戎变异株的T细胞反应仍然存在。非细胞自主破坏核结构是 COVID-19诱导嗅觉丧失的潜在原因。中脑-丘脑-皮层回路重组皮层动力学以启动准备好的运动
2022年Cell第7期共发表7篇研究论文,包括:
果子狸等“野味”病毒多,不能吃。cAMP纳米畴是不同G蛋白偶联受体GPCR行使不同功能的关键。冷冻电镜结构揭示了细菌外膜蛋白质折叠的多个阶段。以MHC/HLA-1为受体的新肠球菌成孔毒素(Epxs)。肠粘膜唾液酸化调控肠道宿主-菌群生理稳态。人类乳腺癌中的组织驻留FOLR2+巨噬细胞与CD8+T细胞浸润相关。肿瘤反应性抗体由非结合性和自身反应性前体演化而来。
2022年Cell第8期共发表9篇研究论文,包括:
为了包装更大的基因组,杆状病毒进化成纺锤形;oskar核糖核蛋白颗粒通过液相-固相转变调控果蝇胚胎发育;新型聚集体自噬受体CCT2介导固态聚集体的清除;TMEM106B在多种神经退行性疾病中的同型纤维化;肿瘤内的微生物促进乳腺癌转移定植;表达LGR5的皮肤成纤维细胞定义硬皮病中一个主要的细胞枢纽;可吸入双特异性单域抗体,可广泛中和新冠病毒变体;古基因组揭示了7世纪阿瓦尔族精英的起源和快速跨欧亚大陆迁移;替代细胞因子激动剂的筛选方法。
2022年Cell第9期共发表10篇研究论文,包括:
【Argonaute蛋白通过一种新机制中和入侵 DNA,增加NAD (P) + 消耗,触发细胞死亡】【合成基因元件的跨物种表达有助发现人类微生物组衍生性的代谢物】【雄性来源的非核糖体多肽信息素控制着雌性血吸虫发育】【靶向线粒体凋亡增强NK细胞免疫治疗】【Omicron 和 Delta 变异疫苗对感染的保护作用随着时间的推移而减弱】【猴试验:测试针对奥密克戎变异毒株的疫苗保护】【加强针疫苗增强反应性记忆B细胞诱导的免疫反应】【增强变异匹配或历史mRNA疫苗对小鼠Omicron感染的保护作用】【印迹 SARS-CoV-2特异性记忆淋巴细胞定义混合免疫】【前额叶远程抑制对海马信噪比的自上而下控制】
2022年Cell第10期共发表10篇研究论文,包括:
【有袋动物的不完全谱系分类和表型进化】【GPCR介导β-arrestin激活的单分子精度机制】【大麻与心脏病有关,金雀异黄素可以降低该风险】【静息的癌细胞通过形成免疫抑制生态位来抵抗T细胞的攻击】【骨髓组织的适应性先天免疫训练是炎症性合并症的基础】【SARS-CoV-2环状RNA疫苗及其变异体的研究】 【蛋白酶调控的CAR-T细胞受体可增强安全性和有效性】【人类线粒体DNA中A-到-G的碱基编辑】【DNA纳米阵列技术绘制小鼠器官发生时空转录组图谱】【哺乳动物组织中细胞药物靶点的原位识别】
2022年Cell第11期共发表10篇研究论文,包括:
【1.29万年前第一批农民的基因起源】【宿主和病原体能够响应针对脓肿分枝杆菌肺部感染而设计的噬菌体】【第三剂SARS-CoV-2 mRNA疫苗对Omicron反应性B细胞记忆的影响】【一种植物免疫蛋白能够通过挽救microRNA的缺乏来实现广泛的抗肿瘤反应】【谱系追踪揭示了肿瘤的系统动力学、可塑性和进化途径】【淋巴结定植诱导肿瘤免疫耐受促进远处转移】【抑制 PAAN/MIF 核酸酶可预防帕金森病中的神经退行性疾病】【细胞外基质(ECM)动力学在自发滤泡模式下产生超细胞流动性】【癌症中突变导向的新蛋白相互作用】【人类复发性反转多态性与遗传不稳定性和基因组疾病相关】
2022年Cell第12期共发表10篇研究论文:【帕金森病蛋白α-突触核蛋白调控mRNA稳定性】【拆除反义寡核苷酸搭起的“路障”可显著提高其在脊髓性肌萎缩症中的疗效】【先天性巨痣消退的局部治疗及黑色素瘤的预防】【破坏自动抑制回路产生“开环杀伤力”以产生抗逃逸的抗病毒剂】【SARS冠状病毒2型奥密克戎变异株BA2的病毒学特性】【奥密克戎突破性感染后能够增强疫苗保护效果并产生大量反应性抗体】【人类核外泌体靶向复合物(NEXT) RNA监测的结构机理】【锌调节的GTPase金属蛋白激活剂1(ZNG1)调节脊椎动物的锌稳态】【XIST缺失损害乳腺干细胞分化,增加乳腺的成瘤性】【胶质瘤的进展是由遗传进化和微环境相互作用决定的】
2022年Cell第13期共发表11篇研究论文:【星形胶质细胞和小胶质细胞中胆固醇与基质体通路失调】【骨髓造血促进多发性硬化症的进展】【基因编辑人类造血干细胞的无化疗移植新方法】【新一代重组蛋白疫苗高效预防Omicron】【新的人类冠状病毒CCOV-HuPn-2018起源于犬类】【帕金森病风险蛋白TMEM175是溶酶体中质子激活的质子通道】【非编码7S RNA通过线粒体RNA聚合酶二聚化抑制转录】【III-E 型CRISPR-Cas7-11效应子配合物的结构与工程化】【BacPROTACs 介导细菌靶向蛋白质降解】【一系列保守的细菌毒性因子通过阻断钙信号来抑制干扰素的反应】【植物免疫受体的TIR结构域为介导细胞死亡的2′ ,3′-cAMP/cGMP合成酶】
2022年Cell第14期共发表11篇研究论文:
【新冠病毒BA.4、BA.5变种可逃避疫苗及免疫系统】【四种新冠疫苗诱导的体液和细胞免疫记忆】【轻微的新冠感染仍可导致神经细胞和髓鞘失调】【GABAA受体自身免疫性脑炎的结构机制】【抑制食欲的器官间神经回路】【肠道菌群将橙皮纤维转化为活性代谢物N-甲基-5-羟色胺】【皮肤共生微生物来源的一种气味挥发物促进黄病毒感染宿主吸引蚊虫】【从多能干细胞生成人类动脉和静脉细胞突出了尼帕病毒和亨德拉病毒的动脉嗜性】【胸腺上皮细胞通过谱系相关转录因子清除自身反应性T细胞】【单细胞测序绘制首张全基因组基因型-表型图谱】【小鼠卵母细胞在哺育细胞的帮助下在囊中发育】【解析未经治疗的人类黑色素瘤脑转移的生态系统】
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