On the cover: In this issue, Federici et al. identify a clade(分支) of Klebsiella pneumoniae (Kp) strains to be strongly associated with human inflammatory bowel disease (IBD) and its clinical exacerbation across geography. 发现了一个克雷伯氏肺炎菌(Kp)菌株的分支,与人类炎症性肠病(IBD)及其在地理上的临床恶化密切相关。(封面中,噬菌体特异性抑制选择的微生物群共生体是可视化的流行空间入侵者视频游戏。)2022年Cell第16期研究论文汇总:【噬菌体联合疗法靶向抑制 IBD 相关肠道菌群治疗肠道炎症】【胶质母细胞瘤劫持脑侵袭的神经元机制】【组织驻留记忆和循环T细胞是手术前癌症免疫疗法的早期反应者】【SARS-CoV-2杀伤 T 细胞优势表位免疫逃逸的出现】【人血管紧张素转换酶2与当前流行的 Omicron SARS-CoV-2亚变异体 BA.2和 BA.1.1的高结合亲和力的结构基础】【小麦蛋白激酶基因的失活赋予对锈菌的广谱抗性】【HGT在昆虫中广泛存在,并促进了鳞翅目昆虫的雄性求偶行为】【复制应激损害人胚胎染色体分离和着床前发育】【整个生物体中的大规模多重嵌合CRISPR介导基因扰动】【重复元件的重组产生人类基因组中的体细胞复杂性】【人类基因组的交叉疾病剂量敏感性图谱】Targeted suppression of human IBD-associated gut microbiota commensals by phage consortia for treatment of intestinal inflammation【噬菌体联合疗法靶向抑制 IBD 相关肠道菌群治疗肠道炎症】一种由5种噬菌体组合而成的口服药物成功地靶向细菌病原体肺炎克雷伯菌,以治疗人类炎症性肠病的症状。该研究首次设计了一种噬菌体联合疗法,可以精确地靶向和抑制与炎症性肠病(IBD)相关的肠道细菌。Combination of phage targets the XXX to treat the symptoms of bowel disease.
Glioblastoma hijacks neuronal mechanisms for brain invasion【胶质母细胞瘤劫持脑侵袭的神经元机制】具有神经元特征(neuronal features)的胶质母细胞瘤细胞促进脑侵袭。该研究发现胶质瘤劫持神经元促进脑内侵袭。
Tissue-resident memory and circulating T cells are early responders to pre-surgical cancer immunotherapy【组织驻留记忆和循环T细胞是手术前癌症免疫疗法的早期反应者】口腔癌患者对新辅助免疫检查点阻断反应的免疫细胞动力学分析鉴定了循环和肿瘤浸润 T 细胞亚群中的不同特征,这些特征是对治疗快速反应的基础,并与病理结果相关。Analysis of 口腔癌患者免疫细胞动力学responding to 新辅助免疫检查点阻断 identifies diverse features in 循环和肿瘤浸润 T 细胞亚群 that underlie rapid response to therapy and correlate with pathological outcome.备注:在手术前,医生会使用免疫检查点阻断(ICB) 剂作为新佐剂治疗口腔鳞状细胞癌(OSCCs),这比直接做手术的的效果好很多。做手术都是迫不得已,如果不用开刀就可以治好肿瘤,那自然是最好的。
Emergence of immune escape at dominant SARS-CoV-2 killer T cell epitope【SARS-CoV-2杀伤 T 细胞优势表位免疫逃逸的出现】对各种 SARS-CoV-2谱系的 CD8 + T 细胞应答的分析确定了病毒穗蛋白的突变,使病毒能够逃避 T 细胞应答。Analysis of T response to V identifies a mutation in V spike protein that enables the V to escape T responses.
Structural basis of human ACE2 higher binding affinity to currently circulating Omicron SARS-CoV-2 sub-variants BA.2 and BA.1.1【人血管紧张素转换酶2与当前流行的 Omicron SARS-CoV-2亚变异体 BA.2和 BA.1.1的高结合亲和力的结构基础】通过对人血管紧张素转换酶 -2(ACE2,SARS-CoV-2病毒进入的受体)和4个 Omicron 亚变异体(BA.1,BA.1.1,BA.2和 BA.3)的受体结合结构域(RBD)的生物化学和结构分析,揭示了亚变异结合亲和力差异的结构基础和RBD突变的影响。该研究发现人血管紧张素转换酶 2 (hACE2) 与四个早期 Omicron 亚变体(BA.1、BA.1.1、BA.2 和 BA.3)的受体结合域 (RBD) 的结合亲和力顺序为 BA.1.1>BA.2>BA.3≈BA.1。
Inactivation of a wheat protein kinase gene confers broad-spectrum resistance to rust fungi【小麦蛋白激酶基因的失活赋予对锈菌的广谱抗性】小麦条锈菌是引起小麦条锈病的一种破坏性真菌病原体。在感染后,真菌诱导受体样细胞质激酶 TaPsIPK1,其特异性地与效应子 PsSpg1相互作用。田间试验表明,灭活 TaPsIPK1可以在两年内对锈菌产生广谱抗性,而不会影响农艺性状。
HGT is widespread in insects and contributes to male courtship in lepidopterans【HGT在昆虫中广泛存在,并促进了鳞翅目昆虫的雄性求偶行为】从非后生动物来源获得的218种昆虫的基因水平转移(horizontal gene transfer,HGT)事件的综合资源提供了对昆虫基因组中 HGT 的适应的深入了解,发现了基因 LOC105383139在鳞翅目昆虫雄性求偶(courtship)行为中的功能性作用。
Replication stress impairs chromosome segregation and preimplantation development in human embryos【复制应激损害人胚胎染色体分离和着床前发育】在人类植入前胚胎中,G2期 DNA 复制导致染色体断裂、节段性非整倍体和胚胎质量差。
Large-scale multiplexed mosaic CRISPR perturbation in the whole organism【整个生物体中的大规模多重嵌合CRISPR介导基因扰动】IMAP 是一个多路复用的镶嵌原位基因扰动平台,其能够在整个身体中大规模绘制 Perturb-Atlases 分析基因组功能的图谱,并且能够高通量地衍生单基因扰动小鼠系。
Recombination of repeat elements generates somatic complexity in human genomes【重复元件的重组产生人类基因组中的体细胞复杂性】对人类组织样本的大规模分析揭示了广泛存在的重复元件的组织特异性体细胞重组,并有助于支撑人类发展和疾病的基因组多样性。
A cross-disorder dosage sensitivity map of the human genome【人类基因组的交叉疾病剂量敏感性图谱】协调来自近100万个体的基因组数据可以深入了解疾病中罕见拷贝数变异的特性以及对所有常染色体蛋白质编码基因的剂量敏感性预测。