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东京都将在30日制定新的监测指标来判断感染情况，主要是用于消除不安、易于理解的指标。
28日，在紧急事态宣言解除后，东京都确认感染新型冠状病毒人数有60人，是本月内最多的一天。29日，又确认感染人数为58人。从6月24日开始，东京都已连续6天单日新增数在50人左右推移，保持着较高的增长态势。
29日新增的感染者中与夜晚娱乐场所有关的人有32人。这几日特别需要注意的是，在东京都内，除了20代30代的年轻人外，在牛郎俱乐部、夜总会等夜间娱乐场所工作的工作人员和客人多人相继发生感染。
不过也正因为这批新增确诊病例中年轻人居多，东京都政府判断，现在的感染者重症化的风险较小。
为了应对第2波疫情，更准确地把握东京都内的感染状况，东京都29日进行了重新评估监控指标的工作，30日将公布新的标准。而东京将是否会再次要请配合停业，目前尚难判断。
这一周以来，东京的感染人数周平均超过50人，从6月19日起，东京都所有行业全面解除停工申请开始，现在的感染人数已超过了原先东京警报时修订的再次申请停工的目标指标的数值。
在感染人数不断增加的今天，有不少人呼吁为了避免爆发第二波疫情，东京都应该再次发出紧急事态宣言。
但另一方面，有专家指出如果这个时候再次发表紧急事态宣言的话，一度处于恢复基调的经济活动将再次受到巨大损害，预计会有很多人陷入生活危机。
日本传染病学专家、东京医科大学教授滨田笃郎认为，此次和发表紧急事态宣言前的今年3月下旬的情况很相似，但此次轻症感染者占了较大比例，这一点和之前大不相同。他呼吁民众尽量少去疫情高危地带，特别是不要经常出入夜间经营场所等地。
日本内阁官房长官菅义伟在29日的记者会上发表看法称，目前并不处于要再次发布紧急事态宣言的情况，也不会要求民众避免跨县移动。他强调，会继续力争兼顾防疫和社会经济活动并举，并表示会保持警戒态势。
随着新一届东京都知事选举即将拉开帷幕，这次是东京都史上最多人参选的一次知事选举，有22人参选。28日，最有竞争力的5位参选人在公开讨论会上，首次聚在一室，畅谈自己未来打算把东京建设成什么样？
东京都知事选举预计在7月5日举行投票和开票，各个候选人的选举团队在疫情期间，纷纷戴着口罩，监测着体温，一边预防感染，一边进行激烈的选战。候选人们大多表示重视东京市民的生命和健康，有些候选人强调应该发放更多经济补偿。
29日，日本同属首都圈的琦玉县知事大野公布了埼玉县内的新型冠状病毒的感染状况，到28日为止，埼玉两周内感染人数上升到88人，约半数的感染者来自东京都，大野表示在东京都内饮食、访问娱乐场所的人适当自我约束。对于老年人和有基础疾病的人，要求不要急着去东京。琦玉县于29日确认感染了13名新型冠状病毒。
在日本雅虎新闻上，面对新型冠状病毒第二波疫情你是否已准备好的提问，有71%的日本人回答已准备好，17%的人表示不好说，12%的人表示还没准备好。
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