《中国医学大成》总目录： 一、内经分册: 1. 黄帝内经素问集注(清·张隐庵) 2. 黄帝内经灵枢集注(清·张隐庵) 3. 灵枢识(日·丹波元简) 二、伤寒、金匮分册: 1. 伤寒九十论(宋·许叔微) 2. 阴证略例(元·王好古) 3. 伤寒明理论(宋·成无己 明·吴学勉) 4. 伤寒兼证析义(清·张倬) 5. 伤寒贯珠集(清·尤在泾) 6. 伤寒六经辨证治法(清·沈目南) 7. 张周子伤寒论(清·张卿子) 8.伤寒补例(清·周学海) 9.伤寒来苏集(附论翼、附翼) (清. 柯琴) 10.重刊金匮玉函经二注 ( 宋·赵以德、清·周杨俊) 11. 沈注金匮要略（清·沈目南） 12.金匮要略心典（清·尤在泾） 13. 金匮翼（清·尤在泾） 三、诊断针灸分册： 1. 脉经（晋·王叔和） 2. 玉函经（唐·杜光庭） 3. 重订太素脉秘诀（明·张大素、 清·刘伯祥） 4. 脉语（明·吴昆） 5. 医订续焰（明·王绍隆） 6. 脉说（清·叶子雨） 7. 望诊遵经（清·汪广庵） 8 重订诊家直诀（清·周学海） 9. 临证验舌法（清·杨云峰） 10. 察舌辨症新法（清·刘恒瑞） 11.脉学辑要评（日·丹波元简） 12. 针灸甲乙经（晋·皇甫谧） 13.巢氏病源补养宣导法 （隋·巢元方、 清·廖平） 14. 针灸素难要旨（明·高武、 日·冈本一抱子） 四、温病分册： 1. 瘟疫论（明·吴有性） 2. 重订医门普度温疫论 （ 明·吴有性、 清．孔以立、清 龚绍林） 3.张氏温暑医旨（清·张畹香） 4. 瘟疫明辨（清·戴天章） 5. 温热暑疫全书（清·周禹载、 清·薛生白、 清·吴正功） 6. 温证指归（清·周杓元） 7. 温热病指南集（清·陈平伯） 8. 南病别鉴（清·叶香岩、 清·薛生白、 清·薛公望） 9. 痧胀玉衡（清·郭右陶） 10. 疟疾论（清·韩善征） 11.湿温时疫治疗法）绍兴医学会 12. 增订叶评伤暑全书（清·张凤逵、 清·叶子雨） 13 .伏气解（清·叶子雨） 14.伏邪新书（清·刘吉人） 15. 伏阴论（清·田云槎） 16.羊毛瘟论（清·隋万宁） 17. 温热逢源（清·柳宝诒） 18.随息居霍乱论（清·王士雄） 19. 瘟疫霍乱答问（清·陈蛰庐） 20.霍乱审证举要（清·连文冲） 21. 鼠疫抉微（清·余伯陶） 22.增补评注温病条辨（清·吴鞠通、 清·王士雄、 清·叶子雨） 五、内科杂病分册： 1.十药神书（元·葛可久） 2. 增订十药神书（清·周杨俊、 清·陈修园、 清·潘蔚） 3. 痰火点雪（明·龚居中） 4. 慎柔五书（明·胡慎柔） 5. 理虚元鉴（明·绮石） 6. 虚损启微（清·洪缉庵） 7. 何氏虚劳心传（清·何嗣宗） 8. 症因脉治（明·秦景明、 明·秦之桢） 9. 周慎斋遗书（明·周慎斋） 10. 医原（清·石寿棠） 11. 脉因证治（元·朱丹溪） 12.韩氏医通（明·韩愗） 13. 医林改错（清·王清任） 14.医学举要（清·徐镛） 六、眼科、外科分册： 1.一草亭目科全书（清·邓苑） 2. 异授眼科（清·胡芝樵） 3. 银海指南（清·顾锡） 4. 口齿类要（明·薛己） 5. 尤氏喉科秘书（清·尤乘） 6. 重订咽喉脉证通论（清.许裢） 7. 喉舌备要秘旨（清·佚名） 8. 包氏喉证家宝（清·包三鏸） 9. 重订囊秘喉书（清·杨龙九） 10. 正体类要（明·薛己） 11.外科证治全生集（清·王洪绪） 12. 外科选要（清·唐芹洲） 13.外科医镜（清·张贞庵） 14. 疬科全书（清·梁柘轩） 15.痰疬法门（清·李子毅） 16. 徐评外科正宗（明·陈实功、 清·徐灵胎） 七、妇科儿科分册： 1. 盘珠集胎产证治（清·施澹宁、 清·严西亭、 清·洪缉庵） 2. 胎产指南（清·单南山） 3. 重订产孕集（清·张曜孙、 清·包兴言） 4. 女科切要（清·吴道源） 5. 经效产宝（唐·昝殷） 6. 女科经纶（清·萧赓六） 7. 校注妇人良方（宋·陈自明、 明·薛立斋） 8. 慈幼新书（明·程凤雏） 9. 原瘤要论（清·袁(佚名)） 10. 麻疹备要方论（清·吴砚丞） 11.活幼心书（元·曾世荣） 12. 幼科直言（清·盂介石） 13.小儿卫生总微论方（佚名） 14.幼幼集成（清·陈复正） 八、医案医话分册： 1.眉寿堂方案选存（清·叶天士） 2.徐批叶天士晚年方案真本（ 清·叶天士、 清·徐灵胎） 3.孙文垣医案（明·孙泰来、 明·孙文来） 4.三家医案合刻（清·叶天士、 清·缪宜亭、 清·薛生白） 5. 张畹香医案（清·张畹香） 6. 程杏轩医案（清·程杏轩） 7. 何澹安医案（清·何澹安） 8. 邵兰荪医案（清·邵兰荪） 9. 吴鞠通医案（清·吴瑭） 10. 冷庐医话（清·陆定圃） 11. 柳洲医话（清·魏玉横） 12. 碣塘医话（清·张景焘） 13.先哲医话（日·浅田惟常） 14. 潜斋医话（清·王士雄） 15.友渔斋医话（清·黄退庵） 16.对山医话（清·毛对山） 17. 客尘医话（清·计寿乔） 九、医论分册： 1.巢氏诸病源候总论（隋·巢元方） 2. 儒门事亲（金·张从正） 3. 重订灵兰要览（明·王肯堂） 4. 肯堂医论（明·王肯堂） 5. 知医必辨（清·李冠仙） 6. 研经言（清·莫枚士） 7. 医学读书记（清·尤在泾） 8.读医随笔（清·周学海） 9. 市隐庐医学杂著（清·王严士） 10. 叶选医衡（清·叶天士） 11. 医学源流论（清·徐大椿） 12.慎疾刍言（清·徐大椿） 13. 医暇卮言（清·程林） 14.医学心悟（清·程国彭） 十、本草、医方分册： 1.神农本草经(魏·吴普、 清·孙星衍、 清·孙冯翼） 2.珍珠囊补遗药性赋 （元·李东垣、 清·王晋三） 3.雷公炮制药性解（明·李中梓、 清·王晋三） 4. 重刊本草衍义（宋·寇宗奭） 5. 药征（日·吉益东洞） 6. 药征续编（日·村井 钝） 7.刘涓子鬼遗方（宋·龚庆宣） 8.医方考（明·吴鹤皋） 9.圣济总录纂要（清.程云来）