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LCMS解析不到位,你很可能把成功反应当成失败反应丢弃

小编记得在学校的时候,一般合成的化合物,先点板(TLC)监测反应,有产物生成后,再过柱子,打核磁,质谱会最后做。随着技术的不断发展和高校科研条件的不断改善,越来越多的科研机构和制药公司都配备了LCMS,既可以用来监测反应,又可以用来表征产物的纯度。小编发现,现在大家越来越依靠LCMS了,传统的TLC点板监测反应有点受忽视了(图片来源于网络)。

使用LCMS监测反应,确实有其优势。然而,如何用好和解析好LCMS需要我们好好琢磨一番。我们做LCMS,最希望看到的就是Ms+1(H+);Ms+23(Na+)等的信号峰。然而很多时候,特殊的信号峰需要我们去分析,有时候分析的不正确,很有可能会使我们的判断错误。今天小编先给大家分享一个真实案例,在学校期间,小编的一位师弟合成一个胺类化合物,其结构(只画出核心结构分析结果)如下。按理说产物应该出122的分子离子峰(Ms+1),然而只观察到了105的信号峰。这位师弟据此就觉得产物没有合成出来,找原因和分析:是不是溶剂没有经过无水处理,是不是试剂质量不行等等;反应应该做出来,却没有做出来的,总会觉得这有问题那有问题的。折腾来折腾去,也没找到原因;把产物纯化出来做了核磁,核磁显示是正确的。最终的原因相信大家都知道了,含烯丙基或苄基的杂原子化合物,很容易出烯丙基或苄基的正离子碎片峰,这个时候大家切不可贸然觉得反应没有成功,然后随手把反应体系倒掉如果这样,你可能会错过一篇好的文章和多走很多弯路

除了上述的情况外,不同类型的化合物,LCMS里还可能出现其它不同类型的碎片峰。以RNHBoc类化合物为例,分析如下。

有些化合物,核磁很干净,但是LCMS会出碎片峰,如硼酸酯,SEM和THP保护基等,如下所示。

除了常见的M+1分子离子峰外,还容易出现2M+H,2M+Na, 2M+NH4, (M/2)+H等峰信号,此外,还容易出现其它的离子和溶剂加合离子峰信号。通常是以M+溶剂(中性)+离子的组合,如M+42 = M+MeCN+H+出现,详见下图分析。

因此,大家在分析LCMS和副产物的时候,要敢于大胆合理猜测。


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