阮光缵在位期间政局动荡不安，政治腐败。因此阮福映在夺取政权之后，下令改革政治制度。1815年，阮福映参照中国的《大清律》，颁布了《嘉隆律书》。
阮福映将越南全境分为北城、嘉定城以及朝廷直辖区域三个部分。其下又分为23镇4营。
北城下辖11镇：山南上镇（今兴安大部、河南、河内东部）、山南下镇（今南定、太平两省）、山西镇（今河内市西部和永福大部、富寿东部）、京北镇（今北江、北宁两省、河内北部）、海阳镇（今海防市和海阳省）、宣光镇（今宣光、河江两省）、兴化镇（今富寿西部、老街、山罗、和平、莱州、奠边等西北省份，包括今老挝部分领土）、高平镇（今高平省大部）、谅山镇（今谅山省）、太原镇（今太原、北𣴓两省）、安广镇（今广宁省）；
嘉定城下辖5镇：藩安镇（今胡志明市）、边和镇（今同奈、巴地头顿、平福一带）、永清镇（今永隆、安江一带）、定祥镇（今前江、坚江、槟椥、茶荣一带）、河仙镇（今金瓯省及富国岛一带以及柬埔寨西哈努克市）；
阮朝朝廷直辖7镇：清华镇（今清化省）、乂安镇（今乂安、河静两省）、广义镇（今广义省）、平定镇（今平定省）、富安镇（今富安省）、平和镇（今庆和省）、平顺镇（今平顺、宁顺两省）；
京畿直辖4营：直隶广德营（今承天顺化省）、广治营（今广治省）、广平营（今广平省）、广南营（今岘港市和广南省）；[80][81]
其中，京畿由阮朝朝廷直接管理，北城和嘉定城分别设置总镇和副总镇（或称协镇）以管理事务。北城和嘉定城的总镇都是由立下赫赫战功的武将担任。各镇以留镇或镇守为长官，镇之下又细分为府、县、州，由知府、知县、知州为长官。
阮福映也意识到北城这片刚占领的领地形势错综复杂，既存在有支持后黎朝和郑主势力的余党，也存在着据守山区、朝廷难以管理的土豪，而且这些势力依然强大。阮福映认为北城地区“民性骄顽”，难以统治，因此并没有遵循前代历朝定都河内的惯例，而是将都城选在了历代阮主的统治中心顺化。1803年，阮福映命黎质、范文仁、阮文谦，参照中国紫禁城的建筑风格，在富春城内修建顺化皇城，作为阮朝朝廷的行政中心。
对于北城存在的各种势力，阮福映决定任命他们为官。北城的11镇被分为内五镇和外六镇，内五镇由后黎朝旧臣管理，外六镇由地方土豪管理。这种委任地方势力为官的制度直到明命帝继位的时候才被废止。
阮福映在位期间，参照法国的沃邦式城堡的建筑风格，在越南全境又先后建立了9座城堡。这些城堡分别是北城辖下的荣市、清化、北宁、河仙，朝廷直辖地的顺化、广义、庆和、平定，以及嘉定城辖下的永隆。德·皮曼纽尔和西奥多·勒布朗在战争结束之后离开了越南，越南工程师们参照他们建造八卦城和延庆城堡时用的建筑图纸，建造了这些城堡。阮福映认为国家刚刚步入安定时期，百姓容易受朝廷调遣；若再过数年，百姓便习惯于安逸生活，那时再征调他们建造大型工程，就很容易引起百姓的不满。故而他在位期间大兴土木，建造了众多工程。他还积极修建官道、修建驿站、疏通河流、建立堤坝。
阮福映灭西山朝之后，赏赐有功将士，允许年老体弱者卸甲归田。又赏赐并修建庙宇，祭祀阵亡将士。他制定了兵丁之法：广平至平顺各镇三丁抽一，边和以南各镇五丁抽一，河静以北、北城内镇七丁抽一，北城外镇十丁抽一。京畿一带设立亲兵、禁兵、精兵，统称三兵，以守卫顺化。各镇设立奇兵、募兵，分作三番轮流值班。阮朝设置五军都统府，其首领由皇帝的亲信担任。若要动用军队，则由五军都统率兵出征。
而在兵器上，阮朝军队使用的主要是剑槊、马刀以及铜制大炮，也有使用西洋的枪支鸟铳。阮朝在顺化设立三个射击场士兵每年进行一次射击演习。但阮朝朝廷对西洋枪支的使用非常苛刻，每队50人中只有5人拥有鸟铳，每人每年只允许使用六发子弹，超过数目者要赔偿。
阮福映非常重视海港的军事防备，在各港口都建立炮台，检查过往船只；又建造了巨大的船只以巡防海面。而对于活跃于南中国海沿岸的华南海盗，阮福映持严厉打击的态度。1802年，就在阮福映推翻西山朝后不久，阮朝官军便攻陷了华南海盗位于江坪（今中国广西壮族自治区东兴市江平镇）的大本营，将著名的海盗首领郑七俘虏并斩首。此后官军清剿华南海盗在越南沿海一带根据地，华南海盗势力遭受沉重打击，不得不离开越南，回到中国广东一带发展。
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