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KRAS 突变疾病模型精选|KRAS|突变|抑制剂|信号|基因|

RAS

RAS是第一个被发现的人类肿瘤基因(oncogene)。Harvey和Kirsten等人在60年代分别发现了类似于RSV的逆转录病毒携带的老鼠肿瘤基因Hras和Kras。1982年,Weinberg等实验室在人类膀胱癌细胞T24/EJ中也发现了HRAS,使得RAS成为第一个被发现的人类肿瘤基因。50多年过去后,RAS基因被发现是肿瘤中最常见的突变基因之一,30%的肿瘤携带RAS变异,如果算上RAS调控因子和信号通路上下游的变异,几乎覆盖所有肿瘤,RAS变异每年造成一百万以上的病人死亡,无愧是肿瘤基因之王。

KRAS靶点

KRAS基因的全名叫Kirsten rat sarcoma viral oncogene homolog,翻成中文是“Kirsten大鼠肉瘤病毒癌基因同源物”。KRAS基因属于RAS基因家族。RAS基因家族当中,还有NRAS(neuroblastoma-RAS)和HRAS(Harvey-RAS)。HRAS、KRAS和NRAS,分别定位在11、12和1号染色体上,都参与细胞内的信号传递。

 

图1:KRAS 信号通路示意图

KRAS基因负责编码K-Ras的蛋白,该蛋白是小GTP酶(small GTPase),将GTP分子转换成GDP。K-Ras蛋白如同一个开关:当K-Ras传递信号时,其需要与GTP分子进行结合来进入激活状态;而当GTP转换成GDP时,K-Ras蛋白便会进入失活状态,停止传递信号。K-Ras蛋白属于MAPK/ERK信号通路途径的一个重要部分。K-Ras蛋白可将细胞外的信号传导至细胞核,这些信号与细胞生长和分裂(增殖)、细胞成熟分化有关。

KRAS与GDP或GTP的结合力非常强,它(KRAS)与GTP结合的亲合系数在Pico Molar(皮摩尔浓度)级。当KRAS与GDP结合时,没有激酶活性;而当KRAS与GTP结合时,有激酶活性。野生型的KRAS与GDP结合,还是与GTP结合,受到上游信号调控。当KRAS基因发生致病性突变后,KRAS会一直保持与GTP结合,K-Ras蛋白将处于持续激活的状态,并不断激活下游信号通路(如PI3K,RAF-MEK-ERK(MAPK),RAL-GEF等),进而刺激细胞增殖、迁移,导致肿瘤的形成。

KRAS基因突变占RAS基因突变总数的85%(NRAS-12%次之,HRAS-3%最少)。在人类癌症中,KRAS基因突变出现在90%以上的胰腺癌中,40%以上的结肠癌中,17%的子宫内膜癌中,20%以上的肺癌中(大多为NSCLC)。它也会在胆管癌、宫颈癌、膀胱癌、肝癌和乳腺癌等癌症类型中出现。

在KRAS的基因突变中,97%突变是第12号或者第13号氨基酸残基发生了突变。其中最主要的是G12D、G12V、G12C、G12A、G13D这五种突变。

KRAS突变靶点药物研发进展

1. Sotorasib (AMG510)  Amgen

Sotorasib (AMG-510) 是一种有效的,有选择性的 KRAS G12C 共价抑制剂。Sotorasib 将 KRAS G12C 锁定在非活跃的 GDP 约束状态,在这种状态下,KRAS处于安全的关闭状态,无法结合到GTP上,实现对KRAS突变不可逆的抑制。2021年5月28日,美国FDA批准了针对KRAS基因突变的首款靶向药物Lumakras(Sotorasib)上市,代号为AMG510,中文名索托拉西布。AMG510获批的适应症:至少经过一次系统治疗且病情进展的KRAS基因G12C突变阳性非小细胞肺癌。AMG510的上市打破了KRAS 靶点不可成药的魔咒。

2. Adagrasib(MRTX849) Mirati Therapeutics

Adagrasib(阿达格拉西布,MRTX849)是一款针对KRAS G12C突变体的特异性优化口服抑制剂。通过在非活性状态下与KRAS G12C不可逆转地选择性结合,阻止其发送细胞生长信号并导致癌细胞死亡。经过初步的人体临床试验证实,MRTX849在治疗携带KRAS G12C基因突变的非小细胞肺癌(NSCLC)和结直肠癌(CRC)及其他实体肿瘤时表现出可喜的安全性和抗癌活性。2021年6月24日,美国食品药品监督管理局(FDA)已授予Adagrasib突破性疗法认定,用于治疗先前接受过全身治疗的携带KRAS G12C突变的非小细胞肺癌(NSCLC)患者。

3. MRTX1133  Mirati Therapeutics

MRTX1133是选择性和可逆KRAS-G12D抑制剂,可抑制激活和失活状态状态的KRAS G12D突变体细胞,但不抑制KRAS野生型肿瘤细胞,MRTX1133对KRAS G12D的特异性是野生型KRAS的1000倍以上。该分子目前处于临床前研究阶段,现有数据显示出较好的开发潜力。

4. BI-2852  Boehringer-Ingelheim

BI-2852是基于药物结构设计的 switch SI/II 口袋的 KRAS 抑制剂,其通过基于结构的药物设计具有纳摩尔亲和力。BI-2852可阻断 GEF,GAP  和效应子与 KRAS 的相互作用,抑制下游信号传导。具有对KRAS 突变细胞抗增殖作用。

5. KRAS G12C抑制剂的联合用药

近期有研究者将AMG 510、MRTX 849与HER2,EGFR, SHP2, PI3K, AKT和MEK等抑制剂分别组合进行联合用药尝试。发现:MEK抑制剂与AMG510的组合在多种情况下具有协同作用,MAPK抑制剂与AMG 510联用能够消除可能限制疗效或诱发耐药性的残留信号通路;MRTX849和HER2家族抑制剂阿法替尼、CDK4/6抑制剂Palbociclib、SHP2抑制剂RMC-4450以及mTOR通路抑制剂等小分子抑制剂的组合具有良好的前景。

6. 靶向KRAS上下游通路靶点的抑制剂

靶向KRAS信号通路的上游与下游调控蛋白成为抑制KRAS通路的一个热门的研究方向。

目前在研发阶段的KRAS上下游通路靶点抑制剂如下图3所示。

 

图3:在研发阶段的KRAS上下游通路靶点抑制剂

KRAS 突变靶点类器官疾病模型

科途医学目前已成功构建出一批KRAS突变的类器官模型(PDO)及PDOX小鼠模型,并且对模型进行了以下验证:

模型的组织病理学结构(HE&IHC)

模型的连续多代次稳定扩增和传代性能

部分类器官体内成瘤模型构建,PDOX模型

OncoCode Panel(673基因)NGS 检测

部分KRAS突变类器官模型对AMG510、BI-2852等化合物敏感性检测

这些KRAS突变的疾病模型覆盖胰腺癌、结直肠癌、胃癌、肺癌、卵巢癌、食管癌等高发瘤种,并包含以下KRAS突变位点:

● KRAS G12C

●KRAS G12D、KRAS G12V、KRAS G12A、KRAS G12S、KRAS G12R

● KRAS G13D、KRAS G13C

● KRAS V14I

● KRAS D33E

● KRAS T58I

● KRAS Q61H、KRAS Q61L

● KRAS K117N

● KRAS D153V

这些KRAS突变类器官模型可作为KRAS靶点药物研发及临床转化医学研究的工具,为新药研发企业及各大科研院所提供相关的研发技术服务。

KRAS突变类器官疾病模型的验证数据展示(PDO模型和PDOX模型):

 

图4:肺癌KO-79094(KRAS G12D突变)和胃癌KO-99213(KRAS G12C突变)类器官模型明场照片

 

图5: 胰腺癌KO-43472(KRAS G12D突变)和结直肠癌KO-83993(KRAS G12A突变)类器官模型HE染色照片

图6:胆管癌KO-41193(KRAS G12C突变)类器官模型对AMG510的敏感性和肺癌KO-79094(KRAS G12D)类器官模型对BI-2852敏感性检测

 

图7:结直肠癌KO-42491(KRAS G12S突变)类器官PDOX小鼠体内成瘤数据

 

图8:结直肠癌KO-42491(KRAS G12S突变)类器官PDOX小鼠体内成瘤照片

 

图9:胰腺癌KO-31154(KRAS G12V突变)类器官PDOX小鼠模型HE染色照片

KRAS G12C突变类器官模型精选产品列表:

 

KRAS G12D、G12V、G12A、G12S、G12R突变类器官模型精选产品列表:

  

KRAS G13C、G13D突变类器官模型精选产品列表:

 

KRAS 其他突变位点类器官模型精选产品列表:

   

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