环状RNA中谁才是肝细胞癌的明星标记物？

作者：蚍蜉玉

转载请注明：解螺旋·临床医生科研成长平台

最近小编在阅读文献的时候发现越来越多的研究者开始关注环状RNA作为肿瘤的明星标记物，为此小编也追着余热探索一下谁才是真正肝细胞癌的标记物。在PUBMEND 中输入检索式(circRNA) and hepatocellular[Title]，有7条相关结果检索出来，如下：

接下来小编则按顺序依次介绍一下这篇文章大致做了些什么？

1

Circular RNA MTO1 acts as the sponge of miR-9 to suppress hepatocellular carcinoma progression

该文是描述肝细胞癌的肿瘤标记物的精彩文章，文章从结构上分析是完全按照ceRNA的机制分三个阶段验证。

首先是利用芯片分析筛选出环状RNA-circMTO1，进而在肝细胞癌的组织中进一步验证，并且值得一提的是还在预后的病人组织中进行验证。

第二阶段利用MiRanda Program预测可能与其结合的miRNA，并且采用circMTO1探针技术进行RIP实验富集到了预测的miR-9，该小RNA在预测的候选miRNA中。第三阶段，探索miR-9的靶向mRNA-P21，并且采用体内和体外的丰富的实验技术共同验证。

最后作者总结为circMTO1 可能会成为最值得考虑的具有潜在的预后诊断价值以及治疗肝细胞癌的有效药物靶点。

2

Screening differential circular RNA expression profiles reveals hsa_circ_0004018 is associated with hepatocellular carcinoma

通过文章的题目可知作者通过筛选不同的环状RNA的表达水平揭示出hsa_circ_0004018 是与肝细胞癌相关的环状RNA，那就来看看文章是通过什么实验技术筛选和验证的吧？

首先通过circRNA microarray分析到hsa_circ_0004018，并且用qRT-PCR技术验证出hsa_circ_0004018在肝细胞癌的表达水平中显著性降低，接着又进一步证实hsa_circ_0004018与肝细胞癌的临床病理特征的相关性分析，更值得学习的是本文作者还比较了在慢性肝炎、肝硬化和肝细胞癌患者三种肝脏疾病中hsa_circ_0004018的表达水平，用ROC面积曲线展示。

最后作者总结出，hsa_circ_0004018 不仅是肝细胞癌的具有诊断性意义的标记物，而且在肝细胞癌的形成和代谢中发挥着重要作用。

3

Computational identifying and characterizing circular RNAs and their associated genes in hepatocellular carcinoma

这是一篇利用计算机分析并鉴定与肝细胞癌相关circRNA以及预测与该circRNA相关基因的文章。

文章利用RNA-seq data预测出肝细胞癌相关circRNA，通过筛选与蛋白编码基因（PCGs）相关的circRNA，探索其生物学功能。在肿瘤组织和正常组织中观察肝细胞癌相关的circRNA和PCGs相关的circRNA的表达情况，发现其差异显著。并且PCGs相关的circRNA在各种疾病中的表达具有广谱性。

最后作者总结到circRNA会是肝细胞癌发生的关键因子，将会成为探索肝细胞癌治愈的有利资源。

4

ZKSCAN1 gene and its related circular RNA (circZKSCAN1) both inhibit hepatocellular carcinoma cell growth, migration and invasion but through different signaling pathways

这是一篇ZKSCAN1线性和环状的RNA研究，本文的作者采用的是收集102个肝细胞肿瘤病人的样本进行队列研究，实施RT-PCR技术发现了ZKSCAN1 mRNA 和circZKSCAN1与正常人群组织相比表达水平均下降。

功能上的验证，通过抑制ZKSCAN1 mRNA 和circZKSCAN1的表达发现能够促进细胞的增殖、迁移和浸润，同时，在体内和体外过表达ZKSCAN1 mRNA 和circZKSCAN1后抑制了肝细胞癌的进一步恶化（验证过程是丰富多彩的），为此作者最后总结 出该cirZKSCAN1 可能成为肝细胞癌的有效标记物。

5

The circular RNA ciRS-7 (Cdr1as) acts as a risk factor of hepatic microvascular invasion in hepatocellular carcinoma

众所周知，在斑马鱼和胰岛细胞中ciRS-7 与其可结合的miRNA-miR-7发挥着重要的抑制作用，而且miR-7已被报道是肝细胞癌的重要抑制因子，所以该作者想尝试在肝微血管癌浸润中两者是不是也发挥着重要的作用。

该文收集102个肝细胞癌病人的样本进行配对研究，用qRT-PCR检测ciRS-7和miR-7以及miR-7-targeted mRNAs的核酸水平；观察ciRS-7的表达水平以及ciRS与临床病理特征的相关性；用单变量和多元逻辑回归分析到ciRS-7是肝脏微血管浸润的潜在危险因子 。

最后作者总结到 ciRS-7 有望成为肝脏微血管浸润的标记物，并且有望成为治疗肝脏微血管浸润的新目标。

6

Comprehensive Circular RNA Profiling Reveals that hsa_circ_0005075, a New Circular RNA Biomarker, is Involved in Hepatocellular Crcinoma Development

本文先在肝细胞癌组织中选择3组配对的样本芯片筛选出3种环状RNA，并且候选的circRNA在60个肝细胞癌组织中进行验证。通过比较筛选出差异环状RNA hsa_circ_0005075，利用AUC曲线分析其潜在的诊断肝细胞癌价值。

另外还建立了强大的网络结构， 利用mirSVR预测该环状RNA可能结合的小RNA；利用 TargetScan和miRanda预测小RNA的靶向mRNA。最终作者总结为hsa_circ_0005075 可能是肝细胞癌的新型标记物并且具有很高程度的准确性，特异性和敏感性。

7

Hsa_circ_0001649 A circular RNA and potential novel biomarker for hepatocellular carcinoma

此文收集了89个配对的肝细胞癌的组织样本，然后利用了qpcr技术检测，筛选出Hsa_circ_0001649，其在肝细胞癌中的表达水平是下降的。

通过用ROC曲线描述Hsa_circ_0001649与临床病理特征之间的敏感性和特异性，表明Hsa_circ_0001649与肿瘤的大小和血栓的发生具有相关性，最终作者认为Hsa_circ_0001649可以作为肝细胞肿瘤的潜在标记物，并且会影响肝细胞肿瘤的生成和代谢。

亲爱的读者，看完这七篇文章，有没有想探究一下环状RNA会不会是其他癌组织的明星标记物，这里提供计算机预测环状RNA，并且有供你选择的丰富的实验技术，快快行动吧。